Appunti di Biochimica

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Appunti di Biochimica

Biochimica - metabolismo dell azoto

Esame Biochimica

Facoltà Scienze biotecnologiche

Dal corso del Prof. M. Bevilacqua

Università Università degli studi di Napoli Federico II

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Appunti di Biochimica per l’esame della professoressa Bevilacqua. Gli argomenti trattati sono i seguenti: la degradazione delle proteine e gli enzimi coinvolti, l'ubiquitina, ossidazione degli amminoacidi con transaminazione e deaminazione ossidativa, destino dello ione ammonio, ciclo dell'urea e relative tappe, regolazione del ciclo dell'urea

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Biochimica - Appunti

Esame Biochimica

Facoltà Farmacia

Dal corso del Prof. T. Cabras

Università Università degli Studi di Cagliari

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Appunti di biochimica per l'esame della professoressa Cabras. Gli argomenti trattati sono i seguenti: Amminoacidi. Struttura e stereochimica. Classificazione. Proprietà acido-base degli amminoacidi: curva di titolazione, pKa, punto isoelettrico.Peptidi e proteine. Caratteristiche del legame peptidico. Ionizzazione dei peptide e delle proteine. I quattro livelli di organizzazione strutturale. Strutture elicoidali e strutture . Strutture non ripetitive. Le proteine fibrose, biosintesi e struttura del collageno. Struttura terziaria e proteine globulari. Denaturazione e rinaturazione. Struttura quaternaria. Le emoproteine. L’eme, il legame dell’ossigeno. Curve di dissociazione dell’ossigeno dalla mioglobina e dall’emoglobina. Proprietà allosteriche dell’emoglobina e modulatori del legame con l’ossigneo. Il trasporto dei gas. Carboidrati. Nomenclatura. Stereochimica. Gli emiacetali. Forme anomeriche. Proiezioni di Haworth. Derivati degli zuccheri. Il legame glicosidico. I disaccaridi di importanza biologica. I polisaccaridi. Struttura di amilosio, amilopectina, glicogeno e cellulosa. Nucleotidi e acidi nucleici. Le basi puriniche e pirimidiniche. I nucleotidi. La struttura a doppia elica del DNA, RNA ribosomiale, RNA messaggero e RNA transfer, caratteristiche strutturali e ruolo biologico Lipidi. Classificazione, glicerofosfolipidi, sfingolipidi, colesterolo. Struttura e funzioni. Le membrane biologiche. Enzimi. Classificazione e proprietà generali degli enzimi. La cinetica enzimatica. Fattori che modificano la velocità enzimatica. Significato di Km, Vmax e Kcat. Classificazione degli inibitori. L’inibizione irreversibile ed i vari tipi di inibizione reversibile, con riferimento agli effetti su Km e Vmax. L’equazione di Micaelis-Menten e interpretazione dei grafici. Grafico dei doppi reciproci. Meccanismi di catalisi enzimatica, esempi. Varie modalità di regolazione dell’attività enzimatica in vivo. Vitamine. Vitamine idrosolubili, i loro derivati coenzimatici e il loro ruolo nelle reazioni metaboliche. Bioenergetica. Termodinamica delle reazioni biologiche. G, G0 e Keq. Composti fosforilati, fosforilazione a livello dei substrati e ciclo dell’ATP. La fosforilazione ossidativa. La catena respiratoria mitocondriale, i suoi componenti e la loro organizzazione. La teoria chemiosmotica. La sintesi di ATP. Metabolismo dei Glucidi. Glicolisi e sua regolazione. Fermentazioni. Metabolismo del piruvato. Gluconeogenesi. Biosintesi e degradazione del glicogeno. Controllo ormonale del metabolismo glucidico: adrenalina, glucagone, insulina. Vie di alimentazione della glicolisi: amido e disaccaridi. Ciclo dei pentoso-fosfati. Ciclo di Krebs. Reazioni chimiche e loro regolazione metabolica. Metabolismo dei Lipidi. Digestione e trasporto dei lipidi; lipoproteine. Degradazione degli acidi grassi: -ossidazione, regolazione metabolica e ormonale. Chetogenesi. Biosintesi degli acidi grassi. Metabolismo degli amminoacidi. Digestione delle proteine. Ruolo metabolico degli aminoacidi. Catabolismo degli aminoacidi. Transaminazione, deaminazione, decarbossilazione. Formazione dell’ammoniaca e suo trasporto, ureogenesi Sintesi delle proteine. Processo di traduzione dell’mRNA, maturazione delle proteine di nuova sintesi e modificazioni post-traduzionali.

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Tesi, Esplorazione strutturale di RNA a sequenza casuale: implicazioni per l’origine della vita

Esame Biochimica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. P. Luisi

Università Università degli Studi Roma Tre

Tesi

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Tesi, Esplorazione strutturale di RNA a sequenza casuale: implicazioni per l’origine della vita. Il Mondo a RNA è una delle ipotesi nell’ambito dell’origine della vita, nata dal bisogno di rispondere al problema di come le molecole biologiche potessero essere implicate nella nascita dei primi organismi viventi. Questa teoria si basa sul fatto che l’RNA è una molecola che può aver giocato un ruolo chiave nell’origine della vita. L’idea del mondo a RNA è basata sulla comparsa di molecole di RNA nel brodo primordiale con due funzioni importantissime: contenere l’informazione genetica e svolgere la funzione di enzimi catalizzando la loro stessa sintesi. Nonostante i recenti progressi fatti in questo campo, alcune domande fondamentali rimangono senza risposta: può un RNA aver catalizzato le reazioni necessarie per l’auto-replicazione sulla terra primordiale? Possono gli RNA aver partecipato alla nascita sia alle proteine che agli acidi nucleici? Per risolvere questi interrogativi nel corso degli anni sono stati affrontati diversi studi teorici e pratici per cercare di ricreare un mondo ad RNA in laboratorio. In questo quadro si inserisce il progetto "Never Born Biopolymers" (NBBs) e in particolare il progetto "Never Born RNAs" (NB-RNAs), che ha come obiettivo l’esplorazione dello spazio delle sequenze alla ricerca di RNA strutturati con proprietà biologiche. Questo progetto nasce dalla constatazione che le molecole di RNA esistenti sono solo una piccola parte di quelle teoricamente possibili. Conoscendo lo stretto rapporto che esiste nelle molecole biologiche tra struttura e funzione si è deciso di esplorare lo spazio delle possibili sequenze in cerca di molecole di RNA casuali con un fold stabile anche ad alte temperature. Per effettuare tale ricerca si è utilizzato un saggio sperimentale denominato RNA Foster Assay (RNA folding stability test). Questo saggio utilizza la nucleasi S1, un enzima specifico per single strand, ovvero una nucleasi che taglia regioni a singolo filamento, in associazione con temperature di incubazione crescenti. Gli RNA ripiegati sono molto più resistenti di quelli che non lo sono e questi ultimi vengono degradati più velocemente. La nucleasi S1 è stata scelta perché ha la capacità di funzionare in un ampio intervallo di temperature e questo ha permesso di controllare la stabilità delle molecole di RNA, questo perché un aumento della temperatura destabilizza il fold inducendo un’apertura delle strutture a doppio filamento in ambito locale e/o globale, di conseguenza gli RNA diventano suscettibili all’attacco della nucleasi. Partendo da questi principi ho suddiviso il progetto in tre parti: la prima è la dimostrazione che in un esperimento precedente effettuato nel 2011 dal Dott. Anella la selezione delle sequenze di RNA è avvenuta grazie alla nucleasi S1 e non semplicemente a causa dei passaggi di clonaggio. Nella seconda parte della mia ricerca ho verificato se fosse o meno possibile ottenere una famiglia di sequenze simili, cioè una quasi specie, resistenti ad alte temperature, che avessero la stessa struttura, in modo da confermare la ridondanza delle strutture rispetto le sequenze. Infine ho voluto osservare se fosse possibile selezionare in vitro sequenze diverse da quelle trovate precedentemente, ma partendo da due librerie diverse: la libreria complessa originale di partenza prodotta per effettuare le selezioni e la libreria selezionata a 50°C durante gli step di selezione.

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Biochimica - proteine

Esame Biochimica

Facoltà Farmacia

Dal corso del Prof. C. Pierri

Università Università degli Studi di Bari

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Appunti e schemi riassuntivi sulla struttura tridimensionale delle proteine per l'esame di Biochimica del professor Perri. Il documento riassume le quattro strutture tridimensionali assunte dalle proteine, focalizzando l'attenzione anche sulle proteine globulari e fibrose.

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Biochimica alimentare - biochimica alimentare

Esame Biochimica alimentare

Facoltà Agraria

Dal corso del Prof. S. Iametti

Università Università degli Studi di Milano

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Appunti di Biochimica alimentare per l'esame della professoressa Iametti su: Contenuti generali e argomenti trattati I parte: Le chiavi per lo sviluppo di competenze scientifiche per una moderna visione della biochimica della nutrizione Controllo dell’espressione genica a livello trascrizionale e post-trascrizionale Il controllo fine degli enzimi allosterici, attivazione enzimi tramite modificazioni covalenti Concetti e principi di trasduzione del segnale: dai recettori di membrana all’attivazione della cascata delle chinasi. Ruolo dei secondi messaggeri Modalità del controllo ormonale del metabolismo. Basi biochimiche di alcuni disordini alimentari II parte: L’impatto di innovativi approcci metodologici nel campo della biochimica degli alimenti Determinanti molecolari nel riconoscimento antigene/anticorpo, strategie nella definizione di un alimento ipo-allergico Ruolo delle proteine e di altri nutrienti in intolleranze alimentari Applicazioni di bioinformatica: utilizzo di database per la definizione dell’impatto metabolico di alimenti Composti bioattivi presenti negli alimenti III parte: Trasformazioni in sistemi alimentari biochimica post-mortem del muscolo Ossidazioni extra-mitocondriali in sistemi vegetali: imbrunimento enzimatico IV parte: L’impatto dell’ingegneria genetica sulla sicurezza e qualità degli alimenti Finalità degli interventi di modificazione genica nel settore agroalimentare Tecniche per il riconoscimento di materiale geneticamente modificato

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Tesi, Digestione enzimatica di estratti proteici di origine vegetale e ad alto potere Umami

Esame Biochimica alimentare

Facoltà Agraria

Dal corso del Prof. S. Iametti

Università Università degli Studi di Milano

Tesi

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Tesi, Digestione enzimatica di estratti proteici di origine vegetale e ad alto potere Umami. Lo scopo di quest’attività di tesi è stato quello di valutare il potere umami d’isolati proteici vegetali dopo proteolisi enzimatica. In questo studio abbiamo utilizzato tre materie prime alimentari di origine vegetale (proteine isolate di soia, lupino e pisello).

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Riassunto esame Biochimica, prof. Palestini

Esame Biochimica

Facoltà Medicina e chirurgia

Dal corso del Prof. P. Palestini

Università Università degli Studi di Milano - Bicocca

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Riassunto di Biochimica per l'esame della professoressa Palestini su: reazioni biochimiche, enzimi, cinetica enzimatica, regolazione. Bioenergetica, catena respiratoria, fosforilazione ossidativa Glucidi. Digestione, assorbimento, glicolisi aerobia e anaerobia. Gluconeogenesi. Shunt dei pentosi fosfati. Glicogeno e regolazione della glicemia. Lipidi. Digestione, assorbimento. Lipolisi. Biosintesi. Ciclo di Krebs. Corpi che tonici. Colesterolo. Fosfolipidi. Glicolipidi. Lipoproteine. Proteine. Digestione, assorbimento. Metabolismo. Ciclo dell’urea. Nucleotidi. Sintesi e catabolismo. Secondi messaggeri e ormoni. Nutrizione e vitamine.

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Biochimica - Appunti

Esame Biochimica

Facoltà Interfacoltà

Dal corso del Prof. P. Pedone

Università Università degli studi della Campania "Luigi Vanvitelli"

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Appunti di Biochimica per l'esame del professor Pedone. Gli argomenti trattati sono i seguenti: il Dna replicazione duplicazione ed rna, il DNA procariotico, gli acidi nucleici, la citosina (presente sia nel DNA che RNA), la timina (Presente nel DNA e qualche RNA), l'uracile ( è il corrispondente della timina nell’RNA).

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Biochimica - glicolisi

Esame Biochimica

Facoltà Interfacoltà

Dal corso del Prof. A. Parente

Università Università degli studi della Campania "Luigi Vanvitelli"

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Appunti di Biochimica per l'esame del professor Parente. Gli argomenti trattati sono i seguenti: la glicolisi, ovvero il metabolismo energetico, il co-trasporto dipendente dal sodio, la fase preparatoria: fosforilazione del glucosio e sua conversione in gliceraldeíde 3-fosfato.

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Riassunto esame Biochimica, prof. Attinà

Esame Biochimica

Facoltà Agraria

Dal corso del Prof. E. Attinà

Università Università degli studi Mediterranea di Reggio Calabria

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Riassunto di Biochimica per l'esame del professor Attinà. Gli argomenti trattati sono: che cosa sono gli enzimi, i biofattori, l'uso di reazioni di rigenerazione che possono essere fatte anche attraverso l'uso di un altro enzima, NAD (Nicotinammide Adenin Dinucleotide).

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Riassunto esame Biochimica, prof. Calonghi

Esame Biochimica

Facoltà Farmacia

Dal corso del Prof. N. Calonghi

Università Università degli Studi di Bologna

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Riassunto di Biochimica per l'esame della professoressa Calonghi. Gli argomenti trattati sono: le proteine, gli amminoacidi, i legami peptidici, la selenocisteina, la struttura secondaria della proteina, i fattori destabilizzanti, segmenti di catena polipeptidica non regolare che ricongiungono segmenti di struttura secondaria regolare.

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Riassunto esame Biochimica: cicli metabolici, prof. Calonghi

Esame Biochimica

Facoltà Farmacia

Dal corso del Prof. N. Calonghi

Università Università degli Studi di Bologna

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iassunto di Biochimica per l'esame della professoressa Calonghi. Gli argomenti trattati sono: i cicli metabolici, la struttura del DNA, informazioni sulla struttura vera e propria del DNA, le interazioni coinvolte per l'impilamento, la sintesi delle proprietà del DNA.

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Biochimica - metabolismi

Esame Biochimica

Facoltà Ingegneria

Dal corso del Prof. G. Mei

Università Università degli Studi di Roma Tor Vergata

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Appunti di Biochimica per l'esame del professor Mei. Argomenti Trattati: I glut(trasportatori),Glicolisi,Ciclo di Krebs,sequenze anaplerotiche,ciclo del gliossilato,gluconeogenesi,sintesi e degradazione glicogeno,catabolismo lipidi,chetogenesi,fosforilazione ossidativa, catabolismo amico acidi,destino delle proteine,transaminazione, ciclo dell'urea,vitamine. tutti con i relativi enzimi, reazioni, regolatori.

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Biochimica - metabolismo lipidico

Esame Biochimica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. F. Salamino

Università Università degli studi di Genova

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Appunti di Biochimicaper l’esame della professoressa Salamino. Gli argomenti trattati sono i seguenti: il metabolismo lipidico, l'acetil-carnitina con somministrata anche per endovena, i disturbi da assunzione, i problemi gastrointestinali, i prodotti finali: acetilCoA e Coenzimi ridotti NADH e FADH2.

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Biochimica - regolazione ormonale

Esame Biochimica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. F. Salamino

Università Università degli studi di Genova

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Appunti di Biochimica per l’esame del professoressa Salamino. Gli argomenti trattati sono i seguenti: la regolazione ormonale, la regolazione enzimatica: a breve termine, a lungo termine e a medio termine, il processo irreversibile, la segnalazione sinaptica.

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Biochimica - catena respiratoria e fosforilazione

Esame Biochimica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. F. Salamino

Università Università degli studi di Genova

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Appunti di Biochimica per l’esame del professoressa Salamino. Gli argomenti trattati sono i seguenti: la catena respiratoria: un sistema di trasportatori mitocondriali di elettroni; la fosforilazione, la fosforilazione ossidativa, i trasportatori di elettroni utilizzati.

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Lezione 5: Appunti di Biochimica

Esame Biochimica

Facoltà Medicina e chirurgia

Dal corso del Prof. R. Amendola

Università Università degli Studi di Foggia

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Appunti di Biochimica per l’esame del professor Amendola. Gli argomenti trattati sono i seguenti: il metabolismo cellulare, le principali macromolecole durante il processo del metabolismo, l'acetilcoenzima A, la generazione di questi trasportatori NADH, NADPH,FADH2.

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Fosforocreatina: Appunti di Biochimica

Esame Biochimica

Facoltà Scienze motorie

Dal corso del Prof. R. Arcone

Università Università degli Studi di Napoli - Parthenope

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Appunti di Biochimica per l'esame della professoressa Arcuni. Tra gli argomenti affrontati vi sono i seguenti: definizione dee funzioni della fosforocreatina, differenze tra la CP e ATP, i limiti fisiologici nell'utilizzare il sistema anaerobico alattacido.

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Lezioni: Appunti di Biochimica

Esame Biochimica

Facoltà Medicina e chirurgia

Dal corso del Prof. P. Chiarugi

Università Università degli Studi di Firenze

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Appunti con sintesi di Biochimica per l’esame della professoressa Chiarugi. Gli argomenti trattati sono i seguenti: i fondamenti di biochimica, la biochimica cellulare, i fondamenti della fisica, i fondamenti della chimica, i fondamenti di biologia dell'evoluzione.

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Lezioni: Appunti di Biochimica I

Esame Biochimica I

Facoltà Medicina e chirurgia

Dal corso del Prof. P. Chiarugi

Università Università degli Studi di Firenze

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Appunti di Biochimica I per l’esame della professoressa Chiarugi. Gli argomenti trattati sono i seguenti: un'introduzione alla biochimica, i livelli di osservazione e composizione chimica della materia vivente, gli amminoacidi, le caratteristiche comuni a tutti gli amminoacidi.

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