Appunti di Scienze matematiche fisiche e naturali - Università Politecnica delle Marche - Ancona

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I contenuti di questa pagina costituiscono rielaborazioni personali del Publisher di informazioni apprese con la frequenza delle lezioni e lo studio autonomo di eventuali testi di riferimento in preparazioneall’esame finale o della tesi. Non devono intendersi come materiale ufficiale dell’università attribuibile al docente del corso o al relatore

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Appunti di Scienze matematiche fisiche e naturali - Università Politecnica delle Marche - Ancona

16 Identificazione dei lieviti in base alle caratteristiche fenotipiche (morfologia, fisiologia e aspetti microscopici)

Esame Biotecnologie dei microrganismi

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Ciani

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento sono descritte le modalità con cui è possibile identificare le cellule di lievito considerando le carateristiche morfologiche, microscopiche e fisiologiche (Test della fermentazione, valutazione dell'attivita' amilasica e proteolitica). E' inoltre descritta la tecnica per valutare l'attivita' killer dei lieviti e la tecnica per valutare la capacita' di produrre solfuro di idrogeno (h2s).

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17. Metaboliti 1 e 2 (produzione amminoacidi)

Esame Biotecnologie dei microrganismi

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Ciani

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento viene data una definizione generale di metaboliti primari e secondari, descrivendo in modo più dettagliato la produzione di aminoacidi come lisina e acido glutammico. Documento basato su appunti personali del publisher presi alle lezioni del prof. Ciani dell’università degli Studi del Politecnico delle Marche - Univpm. Scarica il file in formato PDF!

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8.Alberi filogenetici e metodi di costruzione di un albero

Esame Bioinformatica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Barucca

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si introducono gli alberi filogenetici per poi concentrare l'attenzione più sui metodi per la costruzione di alberi filogenetici. Si descrivono, quindi, i metodi come Upgma, neighbor joining, metodo della massima parsimonia, metodo branch and bound, metodo del maximum likelihood (massima verosomiglianza).

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6 T Coffee

Esame Bioinformatica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Barucca

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si fa cenno ai programmi più moderni utilizzati per l'allineamento multiplo, come il programma T-COFFEE. Documento basato su appunti personali del publisher presi alle lezioni del prof. Barucca dell’università degli Studi del Politecnico delle Marche - Univpm. Scarica il file in formato PDF!

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5 Clustal W

Esame Bioinformatica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Barucca

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento c'è la descrizione del modo di operare del programma CLUSTAL W relativo all'allineamento tra più sequenze geniche (ALLINEAMENTI MULTIPLI). Documento basato su appunti personali del publisher presi alle lezioni del prof. Barucca dell’università degli Studi del Politecnico delle Marche - Univpm. Scarica il file in formato PDF!

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4 I sistemi euristici (fasta e blast)

Esame Bioinformatica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Barucca

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento è spiegato step by step in che modo operano i sistemi FASTA e BLAST per il confronto tra sequenze geniche. Documento basato su appunti personali del publisher presi alle lezioni del prof. Barucca dell’università degli Studi del Politecnico delle Marche - Univpm. Scarica il file in formato PDF!

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3 Algoritmi dinamici

Esame Bioinformatica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Barucca

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento è descritto il modo in cui operano gli algoritmi dinamici, facendo particolare riferimento all'algoritmo di Needlman e Wunsh e all' algoritmo di Waterman, dell'università degli Studi del Politecnico delle Marche - Univpm. Scarica il file con le esercitazioni in formato PDF!

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2 Le matrici per il confronto tra sequenze

Esame Bioinformatica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Barucca

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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Nel seguente documento è descritto in modo dettagliato il modo in cui funzionano le matrici a punti (dot plot o dot matrix) e di punteggio (o sostituzione), l'algoritmo di Levenshtein. Ci sono cenni di variabilità genetica e cenni relativi al concetto di OROLOGIO MOLECOLARE DI ZUCKERKANDL E PAULING

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7 PCR e progettazione primer e primer degenerati

Esame Bioinformatica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Barucca

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si descrivono i punti più importanti di un processo di PCR e si fa riferimento al modo in cui vengono progettati i primer per utilizzare durante la PCR. Si fa cenno e si descrive anche il concetto di PRIMER DEGENERATI. Scarica il file in formato PDF!

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8 Banche dati scop e cath

Esame Bioinformatica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. P. Mariani

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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Appunti di bioinformatica su Banche dati scop e cath elaborati dal publisher sulla base di appunti personali e frequenza delle lezioni del professore Mariani, dell'università degli Studi del Politecnico delle Marche - Univpm. Scarica il file con le esercitazioni in formato PDF!

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7 Predizioni di struttura terziaria

Esame Bioinformatica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. P. Mariani

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si riportano i metodi per la predizione della struttura terziaria di una proteina ed è elaborato dal publisher sulla base di appunti personali e frequenza delle lezioni del professore Mariani. Scarica il file con le esercitazioni in formato PDF!

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6. Predizione di struttura secondaria (esercitazione homology modeling)

Esame Bioinformatica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. P. Mariani

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si riporta l'esercitazione relativa alla predizione di struttura secondaria con l'Homology Modelling elaboratp dal publisher sulla base di appunti personali e frequenza delle lezioni del professore Mariani. Scarica il file con le esercitazioni in formato PDF!

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5. Predizione di struttura secondaria (esercitazione jpred)

Esame Bioinformatica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. P. Mariani

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento è riportata l'esercitazione relativa all'utilizzo del programma di predizione di struttura JPRED elaborata dal publisher sulla base di appunti personali e frequenza delle lezioni del professore Mariani. Scarica il file con le esercitazioni in formato PDF!

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4. Predizione di struttura secondaria (+esercitazione gor iv e protscale)

Esame Bioinformatica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. P. Mariani

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si descrivono gli algoritmi di prima generazione (come l’algoritmo di Chou e Fasman), gli algoritmi di seconda generazione (come l’algoritmo di GOR-GOR Method), gli algoritmi di terza generazione (come PSI-PRED e J-PRED). C'è inoltre l'ESERCITAZIONE relativa ai programmi PROT SCALE e GOR IV.

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2. disegnare la struttura di una proteina (pdb e swiss pdb)

Esame Bioinformatica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Barucca

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento viene spiegato passo dopo passo, in modo dettagliato, come fare per riuscire a disegnare una proteina attraverso l'uso di strumenti informatici. Appunti basati su appunti personali del publisher presi alle lezioni del prof. Barucca dell’università degli Studi del Politecnico delle Marche - Univpm. Scarica il file in formato PDF!

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11 tipi di colture e fermentatori + parametri di fermentazione + sistemi di agitazione e aerazione

Esame Biotecnologie dei microrganismi

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Ciani

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento sono descritte le varie tipologie di colture (colture solide e in liquido; conlture in batch, in fed batch, in batch con riciclo di biomassa e in continuo). Si fa riferimento ai chemostati e ai turbidostati e ai fermentatori in generali; si descrivono i parametri di fermentazione (on line e offline). Si descrivono anche i sistemi di agitazione e aerazione.

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2b. Metabolismo - respirazione aerobica e anaerobica

Esame Biotecnologie dei microrganismi

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Ciani

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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Questo documento rappresenta la continua del documento "2a METABOLISMO_TUTTI I TIPI DI FERMENTAZIONE". Q ui si descrive la respirazione aerobia e anaerobia, con particolare riferimento agli OMOACETOGENI e ai METANOGENI. Si descrivono, inoltre, le fonti di energia per i chemioinorganotrofi e le fonti di energia alternative al glucosio per i chemiorganotrofi.

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2a. Metabolismo. Tutti i tipi di fermentazione

Esame Biotecnologie dei microrganismi

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Ciani

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si introduce il metabolismo microbico e si fa particolare riferimento alle fermentazioni. Sono descritti in modo dettagliato tutti i tipi di fermentazione, oltre che la via glicolitica, via di entner doudoroff e via dell'esoso monofosfato.

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1.Generalita' dei lieviti, lieviti killer, condizioni di crescita

Esame Biotecnologie cellulari

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Ciani

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento sono descritte le principali differenze tra microrganismi procarioti e microrganismi eucarioti (quali i lieviti). Si fa riferimento alla produzione di fattori killer da parte di alcuni ceppi di lievito. Sono riportate le condizioni ottimali di crescita dei lieviti.

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7 b.Anticorpi monoclonali: generalita' struttura anticorpi; tecnica dell'ibridoma; isolamento ibridoma; a. Monoclonali chimerici e umanizzati; ; a. Monoclonali umani; tecniche di produzione a. Monoclonali

Esame Biotecnologie cellulari

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. A. Canapa

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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Appunti di bioteconologie celluari su: Anticorpi monoclonali: generalita' struttura anticorpi; tecnica dell'ibridoma; isolamento ibridoma; a. Monoclonali chimerici e umanizzati; ; a. Monoclonali umani; tecniche di produzione a. Monoclonali, Scarica il file in formato PDF!

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Corsi di Scienze matematiche fisiche e naturali - Università Politecnica delle Marche - Ancona

Corso di laurea in scienze biologiche | Corso di laurea in tecniche del controllo ambientale e protezione civile | Corso di laurea magistrale in biologia applicata | Corso di laurea magistrale in biologia marina

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