Appunti di Scienze matematiche fisiche e naturali - Università Politecnica delle Marche - Ancona

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Ciani

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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Riassunto delle varie fermentazioni microbiche studiate per superare l'esame, i riassunti sono provvisti di foto e paragrafi finali dove vengono ricapitolati i passaggi fondamentali delle varie fermentazioni come la produzione di ATP e i metaboliti prodotti.

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1-Generalità e tipologie di database

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Barucca

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Documento contenente una descrizione delle più importanti banche di dati per l'esame di bioinformatica basati su appunti personali del publisher presi alle lezioni del prof. Barucca dell’università degli Studi del Politecnico delle Marche - Univpm. Scarica il file in formato PDF!

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4b Ingegneria vascolare: generalità dei vasi sanguigni e tecniche per la riparazione dei vasi danneggiati

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. A. Canapa

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si descrivono le caratteristiche dei vasi sanguigni; si descrivono i casi in cui è necessario ricorrere all'ingegneria vascolare; e si descrivono le tecniche remote e moderne con cui si costruiscono dei vasi ingegnerizzati. Scarica il file in formato PDF!

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4 DNA Ricombinante:enzimi di restrizione, vettori di clonaggio (plasmidi, cosmidi, cromosomi bac, lieviti, batteriofago lambda)

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. A. Canapa

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In questo documento si descrive il clonaggio del DNA facendo riferimento alle fasi che permettono il clonaggio e quindi si descrivono gli enzimi di restrizione e i vettori di clonaggio. Appunti basati su appunti personali del publisher presi alle lezioni della prof. Canapa.

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5 a Proteine eterologhe: produzione di p. Eterologhe nei lieviti saccharomycaes; produzione di p. Eterologhe in cellule di insetto; produzione di p. Eterologhe in cellule di mammifero+ il bacmide + purificazione p. Eterologhe

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. A. Canapa

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si descrive il significato di proteine eterologhe e le tecniche di produzione delle proteine eterologhe in cellule di lievito, di insetto e di mammiferi. Si descrive il BACMIDE, i SISTEMI CASSETTA, i VETTORI DI ESPRESSIONE DICISTRONICI. Si descrivono le tecniche di purificazione delle proteine eterologhe (dialisi, affinity tags, phage display).

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5 b Mutagenesi mirata (batteriofago m13, metodo di Kunkel, DNA plasmidico, overlap extension pcr, megaprimer method, ) + mutagenesi casuale

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. A. Canapa

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si descrive cosa è la mutagenesi e si descrivono le tecniche di mutagenesi causale (mutagenesi casuale con oligonucleotidi degenerati e PCR; mutagenesi casuale con analoghi dei nucleotidi) e le tecniche di mutagenesi mirata (mutagenesi mirata basata sul batteriofago M13; mutagenesi mirata con DNA plasmidico; overlap extension PCR; megaprimer method). Si descrivono anche le modalità di inserzione e delezione di nucleotidi da una sequenze geniche.

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6 animali transgenici: generalita' e descrizione di tecniche e strumenti per l'ottenimento di animali transgenici + gene targeting e knock out

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. A. Canapa

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In questo documento si dà la definizione di animale transgenico e si descrivono le tecniche per ottenere animali transgenici (transgenesi mediante microiniezione, transgenesi mediante vettori retrovirali). Si descrivono gli strumenti per effettuare questo tipo di manipolazione (come il micromanipolatore). Si descrive la ricombinazione omologa; la transgenesi mediantele cellule staminali embrionali totipotenti manipolate (TRASFEZIONE E GENE TARGETING). Si descrive la tecnica del KNOCK OUT. Si elenzano gli ambiti in cui gli animali transgenici possono essere utilizzati.

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7 a. Terapia genica: proteine eterologhe, trasferimento di geni terapeutici per la cura di malattie genetiche + esempi di malattie curate con la terapia genica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. A. Canapa

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento sono descritte le modalità con cui si possono curare alcune malattie genetiche, come l'immunodeficienza combinata severa (ADA-SCID), ipercolesterolemia familiare ecc. Si descrivono i geni terapeutici che possono essere utilizzati per la cura di queste malattie e in che modo possono essere trasferiti all'individuo affetto da una determinata malattia genetica. Si descrivono le proteine eterologhe utilizzate come metodo per il trattamento di malattie genetiche.

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7 b.Anticorpi monoclonali: generalita' struttura anticorpi; tecnica dell'ibridoma; isolamento ibridoma; a. Monoclonali chimerici e umanizzati; ; a. Monoclonali umani; tecniche di produzione a. Monoclonali

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. A. Canapa

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Appunti di bioteconologie celluari su: Anticorpi monoclonali: generalita' struttura anticorpi; tecnica dell'ibridoma; isolamento ibridoma; a. Monoclonali chimerici e umanizzati; ; a. Monoclonali umani; tecniche di produzione a. Monoclonali, Scarica il file in formato PDF!

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1.Generalita' dei lieviti, lieviti killer, condizioni di crescita

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Ciani

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento sono descritte le principali differenze tra microrganismi procarioti e microrganismi eucarioti (quali i lieviti). Si fa riferimento alla produzione di fattori killer da parte di alcuni ceppi di lievito. Sono riportate le condizioni ottimali di crescita dei lieviti.

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2a. Metabolismo. Tutti i tipi di fermentazione

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Ciani

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si introduce il metabolismo microbico e si fa particolare riferimento alle fermentazioni. Sono descritti in modo dettagliato tutti i tipi di fermentazione, oltre che la via glicolitica, via di entner doudoroff e via dell'esoso monofosfato.

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2b. Metabolismo - respirazione aerobica e anaerobica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Ciani

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Questo documento rappresenta la continua del documento "2a METABOLISMO_TUTTI I TIPI DI FERMENTAZIONE". Q ui si descrive la respirazione aerobia e anaerobia, con particolare riferimento agli OMOACETOGENI e ai METANOGENI. Si descrivono, inoltre, le fonti di energia per i chemioinorganotrofi e le fonti di energia alternative al glucosio per i chemiorganotrofi.

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11 tipi di colture e fermentatori + parametri di fermentazione + sistemi di agitazione e aerazione

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Ciani

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento sono descritte le varie tipologie di colture (colture solide e in liquido; conlture in batch, in fed batch, in batch con riciclo di biomassa e in continuo). Si fa riferimento ai chemostati e ai turbidostati e ai fermentatori in generali; si descrivono i parametri di fermentazione (on line e offline). Si descrivono anche i sistemi di agitazione e aerazione.

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2. disegnare la struttura di una proteina (pdb e swiss pdb)

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Barucca

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento viene spiegato passo dopo passo, in modo dettagliato, come fare per riuscire a disegnare una proteina attraverso l'uso di strumenti informatici. Appunti basati su appunti personali del publisher presi alle lezioni del prof. Barucca dell’università degli Studi del Politecnico delle Marche - Univpm. Scarica il file in formato PDF!

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4. Predizione di struttura secondaria (+esercitazione gor iv e protscale)

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. P. Mariani

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si descrivono gli algoritmi di prima generazione (come l’algoritmo di Chou e Fasman), gli algoritmi di seconda generazione (come l’algoritmo di GOR-GOR Method), gli algoritmi di terza generazione (come PSI-PRED e J-PRED). C'è inoltre l'ESERCITAZIONE relativa ai programmi PROT SCALE e GOR IV.

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5. Predizione di struttura secondaria (esercitazione jpred)

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. P. Mariani

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento è riportata l'esercitazione relativa all'utilizzo del programma di predizione di struttura JPRED elaborata dal publisher sulla base di appunti personali e frequenza delle lezioni del professore Mariani. Scarica il file con le esercitazioni in formato PDF!

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6. Predizione di struttura secondaria (esercitazione homology modeling)

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. P. Mariani

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si riporta l'esercitazione relativa alla predizione di struttura secondaria con l'Homology Modelling elaboratp dal publisher sulla base di appunti personali e frequenza delle lezioni del professore Mariani. Scarica il file con le esercitazioni in formato PDF!

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7 Predizioni di struttura terziaria