Download di Appunti per l'esame di Bioingegneria industriale

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Tra i professori che hanno tenuto i corsi per l’esame di bioingegneria industriale su cui sono basati i nostri riassunti e appunti: Mariani Paolo, Barucca Marco, Pennati Giancarlo, La Carrubba Vincenzo, Vismara Riccardo e molti altri, nelle università di Università Politecnica delle Marche - Ancona, Politecnico di Milano, Università degli Studi di Palermo, Politecnico di Torino.

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I contenuti di questa pagina costituiscono rielaborazioni personali del Publisher di informazioni apprese con la frequenza delle lezioni e lo studio autonomo di eventuali testi di riferimento in preparazioneall’esame finale o della tesi. Non devono intendersi come materiale ufficiale dell’università attribuibile al docente del corso o al relatore

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Appunti di Bioingegneria industriale

1. Generalità delle proteine (strutture, legame peptidico e paradosso di Levinthal)

Esame Bioinformatica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. P. Mariani

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si introduce la struttura (secondaria, terziaria e quaternaria) di una proteina, facendo cenni alla struttura degli aminoacidi e al legame peptidico. Documento basato su appunti personali del publisher presi alle lezioni del prof. Mariani dell’università degli Studi del Politecnico delle Marche - Univpm. Scarica il file in formato PDF!

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8.Alberi filogenetici e metodi di costruzione di un albero

Esame Bioinformatica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Barucca

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si introducono gli alberi filogenetici per poi concentrare l'attenzione più sui metodi per la costruzione di alberi filogenetici. Si descrivono, quindi, i metodi come Upgma, neighbor joining, metodo della massima parsimonia, metodo branch and bound, metodo del maximum likelihood (massima verosomiglianza).

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6 T Coffee

Esame Bioinformatica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Barucca

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si fa cenno ai programmi più moderni utilizzati per l'allineamento multiplo, come il programma T-COFFEE. Documento basato su appunti personali del publisher presi alle lezioni del prof. Barucca dell’università degli Studi del Politecnico delle Marche - Univpm. Scarica il file in formato PDF!

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5 Clustal W

Esame Bioinformatica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Barucca

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento c'è la descrizione del modo di operare del programma CLUSTAL W relativo all'allineamento tra più sequenze geniche (ALLINEAMENTI MULTIPLI). Documento basato su appunti personali del publisher presi alle lezioni del prof. Barucca dell’università degli Studi del Politecnico delle Marche - Univpm. Scarica il file in formato PDF!

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4 I sistemi euristici (fasta e blast)

Esame Bioinformatica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Barucca

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento è spiegato step by step in che modo operano i sistemi FASTA e BLAST per il confronto tra sequenze geniche. Documento basato su appunti personali del publisher presi alle lezioni del prof. Barucca dell’università degli Studi del Politecnico delle Marche - Univpm. Scarica il file in formato PDF!

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3 Algoritmi dinamici

Esame Bioinformatica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Barucca

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento è descritto il modo in cui operano gli algoritmi dinamici, facendo particolare riferimento all'algoritmo di Needlman e Wunsh e all' algoritmo di Waterman, dell'università degli Studi del Politecnico delle Marche - Univpm. Scarica il file con le esercitazioni in formato PDF!

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2 Le matrici per il confronto tra sequenze

Esame Bioinformatica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Barucca

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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Nel seguente documento è descritto in modo dettagliato il modo in cui funzionano le matrici a punti (dot plot o dot matrix) e di punteggio (o sostituzione), l'algoritmo di Levenshtein. Ci sono cenni di variabilità genetica e cenni relativi al concetto di OROLOGIO MOLECOLARE DI ZUCKERKANDL E PAULING

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7 PCR e progettazione primer e primer degenerati

Esame Bioinformatica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Barucca

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si descrivono i punti più importanti di un processo di PCR e si fa riferimento al modo in cui vengono progettati i primer per utilizzare durante la PCR. Si fa cenno e si descrive anche il concetto di PRIMER DEGENERATI. Scarica il file in formato PDF!

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8 Banche dati scop e cath

Esame Bioinformatica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. P. Mariani

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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Appunti di bioinformatica su Banche dati scop e cath elaborati dal publisher sulla base di appunti personali e frequenza delle lezioni del professore Mariani, dell'università degli Studi del Politecnico delle Marche - Univpm. Scarica il file con le esercitazioni in formato PDF!

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7 Predizioni di struttura terziaria

Esame Bioinformatica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. P. Mariani

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si riportano i metodi per la predizione della struttura terziaria di una proteina ed è elaborato dal publisher sulla base di appunti personali e frequenza delle lezioni del professore Mariani. Scarica il file con le esercitazioni in formato PDF!

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6. Predizione di struttura secondaria (esercitazione homology modeling)

Esame Bioinformatica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. P. Mariani

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si riporta l'esercitazione relativa alla predizione di struttura secondaria con l'Homology Modelling elaboratp dal publisher sulla base di appunti personali e frequenza delle lezioni del professore Mariani. Scarica il file con le esercitazioni in formato PDF!

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5. Predizione di struttura secondaria (esercitazione jpred)

Esame Bioinformatica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. P. Mariani

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento è riportata l'esercitazione relativa all'utilizzo del programma di predizione di struttura JPRED elaborata dal publisher sulla base di appunti personali e frequenza delle lezioni del professore Mariani. Scarica il file con le esercitazioni in formato PDF!

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4. Predizione di struttura secondaria (+esercitazione gor iv e protscale)

Esame Bioinformatica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. P. Mariani

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si descrivono gli algoritmi di prima generazione (come l’algoritmo di Chou e Fasman), gli algoritmi di seconda generazione (come l’algoritmo di GOR-GOR Method), gli algoritmi di terza generazione (come PSI-PRED e J-PRED). C'è inoltre l'ESERCITAZIONE relativa ai programmi PROT SCALE e GOR IV.

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Esame Bioingegneria del sistema motorio

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. M. Galli

Università Politecnico di Milano

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Dispensa completa e dettagliata del corso Bioingegneria del sistema motorio tenuto dalla Professoressa Galli basata su appunti personali del publisher. Ciascuna lezione è stata integrata con lo studio delle slides del corso fornite dalla Prof. stessa. La dispensa è comprensiva dei seminari tenuti durante il corso. Scarica il file in formato PDF!

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Appunti Bioingegneria meccanica

Esame Bioingegneria meccanica

Facoltà Ingegneria i

Dal corso del Prof. C. Bignardi

Università Politecnico di Torino

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Appunti di bioingegneria meccanica basati su appunti personali del publisher presi alle lezioni della prof. Bignardi dell’università degli Studi del Politecnico di Torino - Polito, facoltà di Ingegneria I, Corso di laurea in ingegneria biomedica. Scarica il file in formato PDF!

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