Appunti di Scienze matematiche fisiche e naturali - Università Politecnica delle Marche - Ancona

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Appunti di Scienze matematiche fisiche e naturali - Università Politecnica delle Marche - Ancona

6 - Modelli di rappresentazione

Esame Modeling dei sistemi biologici

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. R. Galeazzi

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si descrivono i modi in cui una proteina può essere disegnata (Modelli a bastoncino, modelli ball and stick, modelli space filling). Si descrive il potenziale molecolare elettrostatico (mep), facendo riferimento alle superfici di Van der waals, superfici di Connolys e all'algoritmo della palla rotante. Si descrivono le banche dati, in particolare la PDB, in cui le strutture proteiche determinate vengono conservate. In questo caso si descrive anche il modo di utilizzo PDB step by step e i significato delle varie informazioni che compaiono in essa. In ultimo si descrivono le coordinate interne.

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5 - Conformazioni delle molecole e angolo diedro

Esame Modeling dei sistemi biologici

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. R. Galeazzi

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si descrive il significato di conformazione, isomeri conformazionali, angolo diedro, configurazione, la differenza tra configurazione e conformazione.Si fa accenno alle proiezioni di Newmann e alla barriera conformazionale. Scarica il file in PDF!

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4. Meccanica quantistica e campi di forza

Esame Modeling dei sistemi biologici

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. R. Galeazzi

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si descrive la meccanica quantistica utilizzata come metodo per il calcolo dell'energia delle molecole biologiche, con particolare riferimento ai Metodi basati sulla funzione d'onda e ai metodi basati sulla densità (Teoria DFT). inoltre si descrivono cosa sono e a cosa servono i campi di forza e più nello specifico si descrivono i capi di forza MM2 E AMBER.

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3. Meccanica molecolare, calcolo energia e campi di forza FF

Esame Modeling dei sistemi biologici

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. R. Galeazzi

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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Si descrivono i metodi utilizzati per il calcolo dell'energia di una molecola (energia potenziale) e si riportano, quindi, le formule e si descrivono cosa sono l'energia associata allo stretching, l'energia associata al bending, l'energia associata all'angolo torsionale e l'energia relativa alle interazioni di non legame.

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2 Superfici di energia potenziale

Esame Modeling dei sistemi biologici

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. R. Galeazzi

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si dà un accenno di cosa sono i gradi di libertà, le superfici di energia potenziale e si descrivono in breve i diagrammi cinetici di reazione. Appunti di Modeling dei sistemi biologici basati su appunti personali del publisher presi alle lezioni della prof. Galeazzi.

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1. Struttura delle proteine

Esame Modeling dei sistemi biologici

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si descrivono le singole strutture che compongono una proteina, facendo riferimento alla struttura primaria, secondaria e spuersecondaria, terziaria e quaternaria. Si descrive inoltre il Plot di Ramachandran. Scarica il file in formato PDF!

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Riassunti di chimica inorganica

Esame Chimica generale e inorganica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. R. Galeazzi

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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Riassunti di chimica inorganica. Dalla teoria atomica alle formule di risoluzione dei vari esercizi. Appunti basati su appunti personali del publisher presi alle lezioni del prof. Galeazzi dell’università degli Studi Politecnico delle Marche - Univpm. Scarica il file in formato PDF!

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21. acque reflue (trattamento primario, secondario e terziario; digestione anaerobica dei fanghi, compostaggio e parametri bod, cod, tod, toc)

Esame Biotecnologie dei microrganismi

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Ciani

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento sono riportati i trattamenti che vengono effettuati per ridurre la presenza di inquinanti all'interno delle acque provenienti dagli ambienti domestici e industriali. Documento basato su appunti personali del publisher presi alle lezioni del prof. Ciani dell’università degli Studi del Politecnico delle Marche - Univpm. Scarica il file in formato PDF!

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19. produzione di metaboliti primari- gli acidi organici (acido citrico, lattico e gluconico)

Esame Biotecnologie dei microrganismi

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Ciani

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si descrivono le tecniche di produzione degli acidi organici utilizzando il metabolismo microbico. Documento basato su appunti personali del publisher presi alle lezioni del prof. Ciani dell’università degli Studi del Politecnico delle Marche - Univpm. Scarica il file in formato PDF!

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1a. Sviluppo embrionale delle gonadi

Esame Biotecnologie della riproduzione

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. O. Carnevali

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si descrive lo sviluppo embrionale delle gonadi sia maschili che femminili. Documento basato su appunti personali del publisher presi alle lezioni della prof. Carnevali dell’università degli Studi del Politecnico delle Marche - Univpm.

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1b. Determinazione del sesso

Esame Biotecnologie della riproduzione

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. O. Carnevali

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si descrivono i meccanismi per la determinazione del sesso (quali geni che intervengono, il meccanismo della inattivazione dell'X). Documento basato su appunti personali del publisher presi alle lezioni della prof. Carnevali dell’università degli Studi del Politecnico delle Marche - Univpm.

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2.Introduzione agli ormoni sessuali: quali sono, chi li produce e i recettori per gli ormoni sessuali

Esame Biotecnologie della riproduzione

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. O. Carnevali

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si descrivono le tipologie di ormoni sessuali, chi li produce (facendo riferimento e descrivendo anche ipotalamo e ipofisi per comprendere poi come e dove agiscono gli ormoni), e i recettori di questi ormoni. Scarica il file in formato PDF!

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3. Gametogenesi (spermatogenesi+anatomia dei testicoli, ovogenesi+descrizione generale ovari, dinamica ormonale e azione degli ormoni durante la gametogenesi, differenze tra apparato riproduttivo maschile e femminile)

Esame Biotecnologie della riproduzione

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. O. Carnevali

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si descrivono i processi di gametogenesi (produzione dei gameti) sia maschili (produzione di spermatozoi) che femminili (produzione di cellule uovo). Si descrive in modo dettagliato il ciclo mestruale e quando intervengono gli ormoni durante la spermatogenesi e durante l'ovogenesi. Si descrive la differenza tra apparato riproduttivo maschile e femminile. Il documento è dotato di molte immagini.

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4.Fecondazione (concetto di premorfismo, viaggio degli spermatozoi dai testicoli alla cellula uovo, modalita' di ingresso dello spermatozoo nella cellula uovo, blocco alla polispermia, cosa succede dopo la fecondazione: segnale wnt e recettori frizzled)

Esame Biotecnologie della riproduzione

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. O. Carnevali

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si descrive in modo generale il concetto di premorfismo; si descrive in modo dettagliato il processo della fecondazione (si parte dal percorso che gli spermatozoi fanno per arrivare in prossimità della cellula uovo, descrivendo anche l'azione degli ormoni sessuali che intervengono durante questo processo). Si descrive in modo generale anche quello che accade allo zigote formatosi dopo la fecondazione, facendo riferimento al segnale WNT e ai recettori Frizzled.

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5. Infertilita'_ inf. Maschile: cause e inf. Femminile: ovaio policistico, endometriosi, i vari tipi di amenorrea) + i plastificanti come causa di infertilità

Esame Biotecnologie della riproduzione

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. O. Carnevali

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si descrive l'infertilità sia maschile che femminile e le cause di inferitlità maschile (cause pretesticolari e quindi ormonali, cause testicolari come varicocele e orchite, cause post testicolari: CBAVD) e le cause di infertilità femminile (Sindrome dell'ovaio policistico, endometriosi, amenorrea). Si descrive l'azione dei plastificanti, come il bisfenolo A, come causa di infertilità.

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6. Diagnostica prima della pma (test dell'fsh del terzo giorno, spermiogramma, analisi cromatina spermatica, studio aneuploidie spermatiche, analisi qualita' ovociti, analisi dna ovocitario, valutazione funzionalita' mitocondriale)

Esame Biotecnologie della riproduzione

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. O. Carnevali

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si descrive la diagnostica che viene effettuata a livello ovocitario o a livello spermatico prima di procedere con la procreazione medicalmente assistita per capire quali sono le cause dell'infertilità. Scarica il file in formato PDF!

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7. Tecnologie della riproduzione assistita (preparazione ovociti: coh, ohss aspirazione transvaginale + preparazione spermatozoi: swim up, macs, pesa, mesa, tesa, tese)+ iui, fivet, icsi+ trasferimento embrione

Esame Biotecnologie della riproduzione

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. O. Carnevali

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si descrivono le tecniche di preparazione dei gameti da utilizzare per la procreazione medicalmente assistita. Si descrivono le tecniche di riproduzione assistita di primo livello (inseminazione intrauterina) e di secondo livello (fecondazione in vitro con trasferimento dell'embrione; iniezione intracitoplasmatica dello spermatozoo).

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8. Diagnosi preimpianto: analisi morfologica (time lapse) e genetica dell'embrione (rt-pcr; sequenziamento enzimatico; pirosequenziamento; minisequencing; fish; array-cgh

Esame Biotecnologie della riproduzione

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. O. Carnevali

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento sono descritte le modalità e le tecniche per valutare l'embrione, ottenuto tramite tecniche di procreazione medicalmente assistita, da un punto di vista morfologico e da un punto di vista genetico prima di procedere al suo impianto.

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10 EPIGENETICA

Esame Biotecnologie della riproduzione

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. O. Carnevali

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si descrivono processi come metilazione del DNA, modifiche istoniche (acetilazione degli istoni, metilazione degli istoni, fosforilazione degli istoni, sumoilazione), epigenesi mediata dagli RNA. Documento basato su appunti personali del publisher presi alle lezioni della prof. Carnevali dell’università degli Studi del Politecnico delle Marche - Univpm. Scarica il file in formato PDF!

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9 Crioconservazione: conservazione di gameti, gonadi ed embrioni tramite congelamento

Esame Biotecnologie della riproduzione

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. O. Carnevali

Università Università Politecnica delle Marche - Ancona

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In questo documento si descrivono le tecniche di conservazione tramite congelamento di cellule come i gameti, di embrioni ottenuti tramite PMA e di gonadi. Si descrivono le tecniche di scongelamento degli stessi elementi. Documento basato su appunti personali del publisher presi alle lezioni del prof. Carnevali dell’università degli Studi del Politecnico delle Marche - Univpm. Scarica il file in formato PDF!

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