I contenuti di questa pagina costituiscono rielaborazioni personali del Publisher di informazioni apprese con la frequenza delle lezioni e lo studio autonomo di eventuali testi di riferimento in preparazioneall’esame finale o della tesi. Non devono intendersi come materiale ufficiale dell’università attribuibile al docente del corso o al relatore
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Appunti di Ingegneria dei sistemi - Politecnico di Milano

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Proteine globulari e immunoglobuline Premium

Esame Biomolecules structure and functions

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. E. Fasoli

Università Politecnico di Milano

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Appunti di Biomolecules structure and functions. Proteine globulari caratteristiche strutturali. Immunoglobuline. Linfociti T e B. Classi delle immunoglobuline. IgG. Struttura con regione costante variabile e ipervariabile. Riconoscimento antigene-anticorpo.
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Acquaporine e membrana cellulare Premium

Esame Biomolecules structure and functions

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. E. Fasoli

Università Politecnico di Milano

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Appunti di Biomolecules structure and functions. Acquaporine. Struttura ad eliche e loop. Vestiboli e poro centrale. membrana cellulare. Fosfolipidi. Fluidità con stato gel e liquido. Doppio strato micella e liposoma. Tipologie di trasporto. Tipologie di Carrier. Proteine periferiche e integrali con tipologie.
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Proteine trasportatrici del glucosio e metabolismo Premium

Esame Biomolecules structure and functions

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. E. Fasoli

Università Politecnico di Milano

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Appunti di Biomolecules structure and functions. GLUT1 con struttura e cambiamento conformazionale. Differenza tra trasporto mediato e non mediato. Pompa sodio potassio con meccanismo e funzioni. SGLT1 e Glut2. Metabolismo. Anabolismo e catabolismo. Vie metaboliche. Enzimi e cofattori. Reazioni reversibili e irreversibili. Flusso metabolico. Meccanismi di controllo a breve e a lungo termine.
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Emoglobina e mioglobina Premium

Esame Biomolecules structure and functions

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. E. Fasoli

Università Politecnico di Milano

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Appunti di Biomolecules structure and functions. Proteine trasportatrici nel sistema circolatorio. Mioglobina con struttura. Gruppo eme. Curva di saturazione. Ruolo nei muscoli. Emoglobina con struttura. Passaggio da deossi a ossi. Curva di saturazione e confronto con mioglobina. Regolatori allosterici. BPG. Scambio di ossigeno tra sangue e tessuti e tra sangue e polmoni e acidità. Effetto Bohr. Varianti dell'emoglobina. Anemia falciforme.
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Sequenziamento delle proteine Premium

Esame Biomolecules structure and functions

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. E. Fasoli

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Appunti di Biomolecules structure and functions. Sequenziamento come identificazione della struttura primaria e step. Digestione proteica e catalizzatori enzimatici. Spettrometria di massa con fonte ionica analizzatore di massa e rilevatore. Risoluzione trasmissione e accuratezza. Peptide Mass Fingerprinting.
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ATP e NAD e muscolo Premium

Esame Biomolecules structure and functions

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. E. Fasoli

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Appunti di Biomolecules structure and functions. Reazioni endoergoniche e esoergoniche. ATP con struttura e idrolisi. Accoppiamento tra reazioni endoergoniche e esoergoniche con esempio del caricamento del tRNA. Turnover dell'ATP. NA con struttura e forma ossidata e ridotta. Tessuto muscolare. Miosina. Actina. Contrazione muscolare e ciclo dei ponti trasversali.
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Proteine fibrose Premium

Esame Biomolecules structure and functions

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. E. Fasoli

Università Politecnico di Milano

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Appunti di Biomolecules structure and functions. Classificazione delle proteine sulla base della struttura 3d. Proteine fibrose. Collagene con tessuto connettivo e tipologie e struttura primaria e tripla elica e patologie connesse. Cheratina con tipologie e coiled-coil e ponti disolfuro e differenza tra capelli lisci e ricci. Proteine della seta.
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Estrazione e purificazione delle proteine Premium

Esame Biomolecules structure and functions

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. E. Fasoli

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Appunti di Biomolecules structure and functions. Estrazione. Solubilizzazione. Mantenimento della stabilità. Quantificazione. Kit ELISA. Spettrofotometro e assorbanza. Purificazione. Cromatografia. Ion Exchange Chromatography. Reverse Phase Chr. Immuno Affinity Chr. SDS-PAGE.
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Proteine misfolded e malattie neurodegenerative Premium

Esame Biomolecules structure and functions

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. E. Fasoli

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Appunti di Biomolecules structure and functions. Misfolding. Proteine amiloidi e aggregazione. Malattie neurodegenerative. Malattie prioniche e proteina prionica. Alzheimer e A-beta peptidi e proteina tau e metodi di diagnosi. Parkison e alphasinucleina.
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Folding proteico e cristallografia a raggi X Premium

Esame Biomolecules structure and functions

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. E. Fasoli

Università Politecnico di Milano

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Appunti di Biomolecules structure and functions. Folding proteico vs misfolding. Citocroma c. Rapporto tra identità di struttura primaria e somiglianza in struttura terziaria. Step del processo di folding. Proteine ausiliarie e PDI. Paradosso di Levinthal. Conformazioni della struttura quaternaria. Step dell acristallografia a raggi x e limiti.
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Amminoacidi Premium

Esame Biomolecules structure and functions

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. E. Fasoli

Università Politecnico di Milano

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Appunti di Biomolecules structure and functions. Amminoacidi (aa) come monomeri delle proteine. Struttura chimica. Zwitterione. Capacità di buffering. Punto isoelettrico. Legame peptidico. Legami secondari e tipologie. Raggruppamento degli aa a seconda di polarità carica e apolarità del gruppo R. I 20 aa nel dettaglio. Formula del punto isoelettrico. Derivati degli aa.
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Ph e principi della termodinamica Premium

Esame Biomolecules structure and functions

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. E. Fasoli

Università Politecnico di Milano

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Appunti di Biomolecules structure and functions. Definizione e calcolo del PH. POh. Autoionizzazione dell'acqua. Acidi e basi. Forza dell'acido o base e acido o base coniugata. Soluzioni buffer. Tre leggi della termodinamica. Entalpia entropia e energia libera di Gibbs. Con formule.
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Trappole ottiche Premium

Esame Bioingegneria cellulare

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. M. Soncini

Università Politecnico di Milano

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Appunti di Bioingegneria cellulare. Scala micro e energia termica delle biomolecole. Esperimenti sulle singole molecole. FRET. Risoluzione spaziale e di forza. Trappole ottiche. Flusso della quantità di moto. Forza di gradiente e forza di scattering. Effetto di rifrazione e riflessione. Come amplificare l effetto di rifrazione. Trapping trasversale e trapping longitudinale. Hardware. Calibrazione. Metodo delle forze di trascinamento viscoso con modalità imprecisa e modalità precisa. metodo dei moti browniani. Esempi applicativi.
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Teoria dei biopolimeri Premium

Esame Bioingegneria cellulare

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. M. Soncini

Università Politecnico di Milano

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Appunti di Bioingegneria cellulare. Curva sforzo-deformazione dei filamenti del citoscheletro. Prove di trazione con afm. Curve di unfolding. Worm-like chain model. Modulo di Young modulo a taglio e coefficiente di Poisson. Rigidezza flessionale. Momento secondo di inerzia. Lunghezza persistente. Esperimenti di misura dei parametri e calcoli. Densità lineare di massa. Prova di flessione. Resistenza a flessione. Entropia e elasticità. Equazioni calcoli e dimostrazioni. Esercizi.
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Meccanotrasduzione Premium

Esame Bioingegneria cellulare

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. M. Soncini

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Appunti di Bioingegneria cellulare.Definizione di meccanotrasduzione. Elementi cellulari in gioco. Trasmissione degli stimoli. Meccanotrasmissione meccanosensing e meccanoresponse. Influenza della rigidezza del substrato. Modello switch-like. Modello dinamico. Esempio dello shear stress sull'endotelio dei vasi sanguigni. Flusso ateroprotettivo vs flusso aterogenico. Aterosclerosi.
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Esperimenti di microaspirazione Premium

Esame Bioingegneria cellulare

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. M. Soncini

Università Politecnico di Milano

Appunti esame
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Appunti di Bioingegneria cellulare. Introduzione sulle proprietà meccaniche delle cellule e risposte agli stimoli meccanici. Tecniche di sollecitazione meccanica sulle cellule. Il citoscheletro come attuatore. Tecniche di manipolazione delle cellule con peeling e microaspirazione. Cellule liquido e cellule solido. Tensione corticale e come determinarla sperimentalmente. Caso del leucocita e caso dell eritrocita. Esercizi
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Dinamica e meccanica molecolare Premium

Esame Bioingegneria cellulare

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. M. Soncini

Università Politecnico di Milano

Appunti esame
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Appunti di Bioingegneria cellulare. Metodi di indagine ai diversi livelli di scala. tecniche sperimentali tipiche. Modelli. Applicazioni. Sistema molecolare e gradi di libertà. Energia potenziale. Energia di legame e di non legame. Stretching bending e rotating. Energia di Van der waals e elettrostatica. dal potenziale alla traiettoria. metodi di Cutoff. Solvente implicito ed esplicito. Modellizzazione del legame tra due atomi. Oscillatore armonico. Potenziale di Morse. Esercizi.
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Filamenti intermedi Premium

Esame Bioingegneria cellulare

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. M. Soncini

Università Politecnico di Milano

Appunti esame
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Appunti di Bioingegneria cellulare. Caratteristiche generali dei filamenti intermedi. Localizzazione nell acellula. Stabilità e fosforilazione. Struttura gerarchica dei filamenti. Avvolgimento a coiled-coil e passo. proprietà meccaniche. Tipologie e famiglie. proteine associate. Desmosoma e emidesmosoma. Citoscheletro degli eritrociti e spectrina.
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4. Membrana e costituenti cell, composizione, storia, funzioni, fosfolipidi, fluidità, proteine, giunzioni Premium

Esame Bioingegneria cellulare

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. M. Soncini

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Appunti esame
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Appunti di Bioingegneria cellulare su: costituenti cellulari. Membrana plasmatica. Funzioni della membrana. Storia della membrana e modelli. Lipidi di membrana. Fosfolipidi. Fluidità di membrana e esperimenti e fattori. Colesterolo. Glicolipidi. Raft lipidici. Modello di membrana a mosaico fluido. Proteine di membrana. Permeabilità di membrana e pompa sodio potassio. Giunzioni di membrana.
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Batteri, membrana batterica gram+ e gram-, sepsi, terapia antiendotossinica con cartuccia assorbente Premium

Esame Bioingegneria cellulare

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. M. Soncini

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Appunti esame
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Appunti di Bioingegneria cellulare su: membrana nei batteri. Gram positivi e gram negativi. Peptidoglicani. Lipopolisaccaridi. Sepsi. Terapia antibiotica. Polimixina B. Interazione polimixina con endotossina. Approccio multiscala al problema.
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Corsi di Ingegneria dei sistemi - Politecnico di Milano

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