I contenuti di questa pagina costituiscono rielaborazioni personali del Publisher di informazioni apprese con la frequenza delle lezioni e lo studio autonomo di eventuali testi di riferimento in preparazioneall’esame finale o della tesi. Non devono intendersi come materiale ufficiale dell’università attribuibile al docente del corso o al relatore
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Appunti di Ingegneria dei sistemi - Politecnico di Milano

Esame Biomeccanica

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. A. Redaelli

Università Politecnico di Milano

Appunti esame
Tendini e Legamenti (cap. 1 del programma d'esame del Secondo Parziale del prof. Redaelli). Questi schemi sono stati fatti rielaborando le sue lezioni, contengono infatti tutto quello che dice il prof, incluse tutte le dimostrazioni che ha fatto in classe
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In questo documento di Informatica A troverete tutto quello da sapere per avere delle buone e solide basi per la programmazione in Python. In particolare, sia per quanto riguarda la teoria (con tanto di illustrazioni aggiuntive e descrittive) ma anche per gli esercizi (svolti e spiegati), troverete: 1) Introduzione al linguaggio Python e ai Jupyter Notebook (funzione Print, variabili, control flow, ecc...); 2) Conditionals: If, Else and If-Else statements; 3) Loops: cicli For e cicli While; 4) Stringhe e tutte le loro funzioni e metodi; 5) Liste e tutte le loro funzioni e metodi; 6) Tuple e tutte le loro funzioni e metodi; 7) Funzioni: standard (da libreria) e personali (create direttamente dall'utente); 8) Dizionari e tutte le loro funzioni e metodi; 9) Set e tutte le loro funzioni e metodi; 10) Analisi di complessità degli algoritmi e notazione dell'O-grande; 11) Algoritmi di ricerca: ricerca lineare e ricerca binaria; 12) Una breve introduzione ai file con tutte le loro funzioni e metodi essenziali.
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Esame Meccanica razionale

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. P. Biscari

Università Politecnico di Milano

Appunto
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Esame Meccanica razionale

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. P. Biscari

Università Politecnico di Milano

Appunto
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Esame Fisica sperimentale I

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. D. Comelli

Università Politecnico di Milano

Appunti esame
Appunti di teoria di Fisica sperimentale I scritti su iPad delle lezioni dell'esame di Fisica sperimentale 1. Riguardano quanto detto a lezione. Comprendono argomenti di una parte parziale del corso.
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Esame Algebra lineare e geometria analitica

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. E. Schlesinger

Università Politecnico di Milano

Appunti esame
Appunti completi per il corso di Algebra e geometria lineare del prof Enrico, perfetti per la preparazione all'esame e con esempio di esercizi. Per la preparazione all'esame questi appunti sono perfetti.
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Esame Elettrotecnica

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. F. Grimaccia

Università Politecnico di Milano

Appunti esame
Il file contenente gli appunti riguardanti il corso di Elettrotecnica del professore Francesco Grimaccia del politecnico di Milano con sede a lecco, ha al suo interno un insieme di appunti riguardanti più la prima metà del corso.
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Esame Bioinformatica e genomica funzionale

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. L. Pattini

Università Politecnico di Milano

Appunti esame
Appunti di Bioinformatica e genomica funzionale su: storia del dna. Struttura del dna. Cromosomi. Impaccamento del DNA nel nucleo. Dogma fondamentale della biologia molecolare. I geni e lo splicing alternativo. Traduzione e ridondanza del codice. Geni codificanti e non codificanti. database di geni. Struttura e funzione delle proteine. Anemia falciforme. Database per le proteine. Le -omiche. Applicazioni della bioinformatica e genomica funzionale all ambito medico
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Esame Bioinformatica e genomica funzionale

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. L. Pattini

Università Politecnico di Milano

Appunti esame
Appunti di Bioinformatica e genomica funzionale su: allineamento a coppie e applicazioni. Similarità e omologia. Geni ortologhi e paraloghi. Il Dot Plot. Schema di punteggio per l allineamento. Modelli di allineamento ottimo: globale e locale. Esempi semplici di problema e algoritmo di allineamento globale. Algoritmo in forma di equazioni. Esempio semplice. Algoritmo per l allineamento locale ed esempi. Definizione della matrice di sostituzione.
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Esame Bioinformatica e genomica funzionale

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. L. Pattini

Università Politecnico di Milano

Appunti esame
Appunti di Bioinformatica e genomica funzionale su: problematiche dell'algoritmo di allineamento ottimo e soluzioni euristiche. BLAST (Basic Local Alignment Search Tool): i suoi programmi. Algoritmo locale applicato da BLAST. Presentazione dei risultati. I punteggi e significatività statistica. PSI-BLAST (Position Specific Iterated BLAST).
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Esame Bioinformatica e genomica funzionale

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. L. Pattini

Università Politecnico di Milano

Appunti esame
Appunti di Bioinformatica e genomica funzionale su: filogenetica. Grafo e albero. Topologia. Rooted tree e non roteed tree. Numero di combinazioni possibili per gli otu. Approccio filogenetico e approccio cladistico. Metodo UPGMA. Metodo a massima parsimonia. Metodo di massima verosimiglianza. Analisi di bootstrap.
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Esame Bioinformatica e genomica funzionale

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. L. Pattini

Università Politecnico di Milano

Appunti esame
Appunti di Bioinformatica e genomica funzionale su: matrice di sostituzione PAM. Modelli di evoluzione. catena di Markov e matrice di transizione. Spazio di stato. Modello di Jukes-Cantor. Modello di Kimura. Modello markoviano nascosto. Log-odds ratio. problema di valutazione, problema di decodifica e problema di learning.
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Esame Bioinformatica e genomica funzionale

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. L. Pattini

Università Politecnico di Milano

Appunti esame
Appunti di Bioinformatica e genomica funzionale su: definizione di multiallineamento. Allineamento progressivo come estensione del concetto di allineamento a coppie globale con algoritmo ottimo e costruzione dell albero filogenetico guida. Implementazione con ClustalW.
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Esame Bioinformatica e genomica funzionale

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. L. Pattini

Università Politecnico di Milano

Appunti esame
Appunti di Bioinformatica e genomica funzionale su: dogma centrale della biologia. Database per rna. Tecniche per predire la struttura secondaria dell rna. Rna non codificante e tipologie. Mirna con database e struttura e meccanismi di azione. Geni target e antitarget con metodi per classificarli. interfacce web sui target. Tuning e buffering.
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Esame Bioinformatica e genomica funzionale

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. L. Pattini

Università Politecnico di Milano

Appunti esame
Appunti di Bioinformatica e genomica funzionale su: struttura primaria, secondaria, terziaria e quaternaria delle proteine. Alpha elica e beta sheet e coil. Motivo e dominio. Prosite. Pattern e profilo. Famiglia. Pfma. Profilo di idrofobicità. Domini transmembrana. Alphaelica anfifilica e proteine mitocondriali. Algoritmo di Chou Fasman.
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Esame Bioinformatica e genomica funzionale

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. L. Pattini

Università Politecnico di Milano

Appunti esame
Appunti di Bioinformatica e genomica funzionale su: trascrittomica. cDNA microarray. Analisi d immagine. Scatter plot e MA plot. Bias sistematici. Normalizzazioni e Lowess. Dye swap. Array a oligonucleotidi. Definizioni: feature, probe, probe pair, probe set. Preprocessamento. Box plot. RMA e MAS5. Accuratezza e precisione. MIAME
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Esame Bioinformatica e genomica funzionale

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. L. Pattini

Università Politecnico di Milano

Appunti esame
Appunti di Bioinformatica e genomica funzionale su: RNA-seq. Limitazioni dei microarray. Seq diretto. Vantaggi. Read. Normalizzazione RPKM. SAM e BAM file. Sovradispersione e binomiale negativa. Individuazione dei geni espressi in modo differenziale. Fold change. T-test. p-value. Test d ipotesi. Volcano plot. Correzione da test multiplo: Bonferroni, Holm, Westfall e Young, Benjamini. Profili d espressione e heat map. geni come vettori: distanza euclidea, distanza di Manhattan e correlazione di Pearson. Clustering gerarchico: single linkage, average linkage, complete linkage, centroid linkage. Annotaioni e gene Ontology, termini. Analisi di arricchimento. Clustering k-means. Analisi dei componenti principali.
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Esame Bioinformatica e genomica funzionale

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. L. Pattini

Università Politecnico di Milano

Appunti esame
Appunti di Bioinformatica e genomica funzionale su: epigenetica, organizzazione spaziale della cromatina e regolazione dell'espressione genica. Modalità di regolazione: metilazione del DNA, modifiche post-traduzionali sugli istoni, varianti degli istoni e rimodellamento del nucleosoma. Code istoniche. Eredità delle modifiche epigenetiche.
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Esame Bioinformatica e genomica funzionale

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. L. Pattini

Università Politecnico di Milano

Appunti esame
Appunti di Bioinformatica e genomica funzionale su: predizione della struttura terziaria e metodi sperimentali. Protein data Bank. Metodi di predizione: metodo ab inizio, di fold recognition e di homology modeling. Swiss model per il template. Alpha fold.
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Esame Bioinformatica e genomica funzionale

Facoltà Ingegneria dei sistemi

Dal corso del Prof. L. Pattini

Università Politecnico di Milano

Appunti esame
Appunti di Bioinformatica e genomica funzionale su: biologia die sistemi. Analisi di rete: reti trascrizionali, di proteine, metaboliche. Nodi e posizione nella rete. Grado k di un nodo. Coefficiente di clustering. Istogrammi sulla distribuzione del grado: rete random e rete scale-free. Attacco preferenziale e duplicazione del gene. Disassortatività. Fenomeno del piccolo mondo. Motivi di rete: feedforward loop, dense overlapping regulon, biparallelo, single input module, catena a tre.
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