Esame di biochimica (parte 6)

Ciclo dell'acido citrico

Respirazione = fase aerobica di catabolismo; è un’assunzione di O₂ e rilascio di CO₂ da parte di organismi multi cellulari.

Nel ciclo dell'acido citrico o ciclo di Krebs possono entrare aa, acidi grassi e il piruvato (prodotto finale della glicolisi) sotto forma di acetil-CoA.

La trasformazione del piruvato in acetil-CoA avviene ad opera di un insieme organizzato di 3 enzimi, chiamato complesso della piruvato deidrogenasi (PDH). Esso è un classico esempio di complesso multienzimatico in cui una serie di interazioni chimico-enzimologiche legano le molecole enzimatiche fino a che il S_H non è stato trasformato nel prodotto finale.

Partecipano alla reazione 5 cofattori, di cui 4 sono derivati dalle vitamine:

• TPP ⟶ Tiamina
• FAD ⟶ Riboflavina
• NAD ⟶ Niacina
• Coenzima A ⟶ Pantotenato
• ⟶

Il suo gruppo -SH quando si lega a gruppi acilici forma il legame tioestere.

Il lipato ha due gruppi Tiolici che possono essere ossidati irreversibilmente e formare un ponte disolfureo.

3 enzimi (presenti in molte copie nel complesso) sono: piruvato deidrogenasi (E1), diidrolipoile transacetilasi (E2) e la diidrolipoile deidrogenasi (E3).

Ciclo dell'acido citrico

Respirazione - fase aerobica di catabolismo, è un'assunzione di O₂ e rilascio di CO₂ da parte di organismi muti, cellulare. Nel ciclo dell'acido citrico o ciclo di Krebs possono entrare aa, acidi grassi e il piruvato (prodotto finale della glicolisi) sotto forma di acetil-CoA. La trasformazione del piruvato in a CoA avviene ad opera di un insieme organizzato di 3 enzimi chiamato complesso della piruvato deidrogenasi (PDH). Esso è un classico esempio di complesso multienzimatico in cui: una serie di reazioni chimiche avvengono legate alle molecole enzimatiche fino a che il S non è stato trasformato nel prodotto finale. Partecipano alla reazione 5 cofattori, di cui 4 sono derivati dalle vitamine. La reazione prende il nome di decarbossilazione ossidativa ed è un processo irreversibile in cui il COOH viene rimosso dal piruvato e si forma l'acetil-CoA Coenzimi:

• TPP → Tiamina
• FAD → Riboflavina
• NAD → Niacina
• Coenzima A → Pantotenato Il suo gruppo – SH quando si lega a gruppi acilici forma il legame Tioestere.

3 enzimi presenti in molte copie nel complesso sono: piruvato deidrogenasi (E1), diidrolipoile transacetilasi (E2) e la diidrolipoile deidrogenasi (E3).

Ciclo:

1. l'acetil-CoA dona il suo gruppo acetilico all'ossalacetato e forma il citrato. Tutto ciò avviene ad opera della citrato sintasi e la reazione prende il nome di condensazione di Claisen.
2. Il citrato viene trasformato in isocitrato passando attraverso la formazione del cis-aconitato.
3. A questo punto si ha una decarbossilazione ossidativa catalizzata dalla isocitrato deidrogenasi, nella quale si formano il α-chetoglutarato, CO₂, Gels e vengono rilasciati gli NADH.
4. Viene persa un'altra molecola di CO₂, e rilasciato NADH nella reazione, catalizzata dal complesso della α-chetoglutarato deidrogenasi, e il α-chetoglutarato viene convertito in succinil-CoA.
5. La succinil-CoA sintetasi converte il succinil-CoA in succinato e l'energia contenuta nel legame tioestere viene mantenuta nel legame dell'ATP (o GTP) che si forma.
6. Il succinato viene deidrogenato dalla succinato deidrogenasi. Si libera FADH₂ e si forma il fumarato.
7. Il fumarato subisce una reazione di idratazione catalizzata dalla fumarasi e si forma il malato.
8. L'ultima reazione porta la ripristino di una molecola di ossalacetato grazie all'azione della malato deidrogenasi. Si ricarica un NADH.

4C ➡ 6C ➡ 6C ➡ 5C ➡ 4C²⁺ ➡ 4C²⁺ ➡ 4C ➡ 4C

L'ossalacetato e l'α-chetoglutarato si possono formare dall'aspettato e dal glutammato quando vengono degr i dati le proteine introdotte con la dieta.

Il ciclo di Krebs è, negli organismi aerobici, una via anfibolica ovvero serve sia ai processi anabolici che a quelli catabolici.

Reazioni anaplerotiche:

Reazioni che permettono di riutilizzare gli intermedi del ciclo che vengono sottratti e usati come precursori dell'altre vie.

Una di esse è:

piruvato + HCO₃^- + ATP _carbossilasi → ossalacetato + ADP + P_{i biotina}

Avviene nel rene e nel fegato quando il ciclo è povero di ossalacetato o di un qualsiasi altro intermedio.

È modulato allostericamente positivamente d