Appunti di Genomica

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Appunti di Genomica

anatomia dei genomi eucariotici

Esame Genomica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. S. Dato

Università Università della Calabria

Appunto

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Lunghezza del genoma; contenuto di DNA; paradosso del valore C; numero di geni e di cromosomi; densità genica; isole CpG; isocore; RNA codificante e non codificante; denaturazione/rinaturazione; famiglie multigeniche; pseudogeni; DNA intergenico (DNA satellite, trasposoni e retrotrasposoni); genoma di Drosophila; DNA mitocondriale.

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Sequenziamento del genoma

Esame Genomica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. S. Dato

Università Università della Calabria

Appunto

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Metodi di sequenziamento (Maxam-Gilbert, Sanger, automatizzato, piroquenziamento); sequenziamento ad alta resa (454, solexa, solyd); microarray (chip affimetrix, bead array), librerie di cloni di DNA; librerie plasmidiche; vettori BAC e YAC; sequenziamento shotgun e approccio del contig di cloni; assemblaggio dei contig (ibridazione e chromosome walking, fingerprinting); rifinitura; genoma minimo e organismi modello.

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