Editing dell'acido ribonucleico messaggero

Editazione del gene nel fegato

Un esempio è l’editazione che avviene nel fegato e nell’intestino del trascritto del gene che codifica per la apolipoproteina B (responsabile del metabolismo dei lipidi, fa da trasportatrice dei lipidi nel sangue). Nel fegato il gene è espresso ad alti livelli e il prodotto di traduzione è una proteina, ApoB100 (100 è il peso molecolare); lo stesso trascritto è abbondantemente tradotto anche nell'intestino, dove però si produce ApoB48, un peptide più breve a cui manca una porzione carbossiterminale rispetto a quello intestinale: il codone che codifica per l'amminoacido 2154 è CAA, tradotto come glutammina, ma nell'intestino c'è un enzima di editing specifico che trasforma la citosina in uracile (tramite de-aminazione, è una deaminasi specifica che toglie il gruppo amminico NH2 della citosina specifica di quel codone) producendo un codone UAA, il codone di stop; i ribosomi nelle cellule dell'intestino quindi si fermano arrivati a questo punto della sintesi.

Ruolo dell'editing tessuto specifico

ApoB100 è la proteina che veicola i lipidi nel sangue, l'ApoB48 invece è coinvolta nell'assorbimento dei lipidi a livello dei villi intestinali, ma non li può trasportare; il vecchio paradigma “un gene, una proteina” può volendo essere riformulato in “un gene, un trascritto maturo” (se ignoriamo lo splicing), ma successivamente, a livello del citoplasma, avviene comunque un editing tessuto specifico dell'mRNA (tessuto specifico perché gli enzimi che effettuano l’editing sono presenti solamente in certi tessuti).