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Il principio del test di Ames
Ceppi Salmonella typhimurium
Fenotipo mutato
auxotrofi per l’istidina (his )
-
Reversione
ripristino funzione genica
Ceppo prototrofo (his+)
Fenotipo selvatico
comparsa colonie selvatiche
Il test di Ames: cronologia
1966 (Ames e Whitefield)
utilizzo di ceppi mutanti di Salmonella istidina-dipendenti
per lo screening dei mutageni chimici
1971-1973
introduzione del sistema di attivazione metabolica
(omogenato di fegato di roditori)
1973
sviluppo del plate incorporation assay in sostituzione dello
spot test
1983 (Maron e Ames)
“linee guida” per il test di reversione con Salmonella
rrelazione mutagenesi-cancerogen
Cancerogeni
Non mutageni Mutageni
Non cancerogeni
rrelazione mutagenesi-cancerogen
Sensibilità del test
– % cancerogeni positivi (mutageni) al test
– cancerogeni non mutageni al test (falsi negativi)
Specificità del test
– % non cancerogeni negativi (non mutageni) al test
– non cancerogeni mutageni al test (falsi positivi)
Valore predittivo del test
77-90%
n o. cancerogeni mutageni cancerogenesi
no. cancerogeni mutageni + no. falsi positivi nei roditori
Concordanza del test
no. sostanze identificate correttamente
no. sostanze totali database
iglioramento della sensibilità del te
Modificare geneticamente i ceppi di
1. Salmonella per renderli più sensibili
Ampliare le classi di mutageni chimici
2. identificabili (mutageni indiretti)
Sviluppare procedure di esecuzione del
3. test rapide e riproducibili
1.Aumento sensibilità ceppi
Introduzione mutazione rfa
– impedisce la sintesi del lipopolisaccaride
– aumenta la permeabilità ai mutageni
Delezione gene uvrB e bio
– impedisce il funzionamento del sistema di riparazione
error free
– determina la richiesta di biotina
Introduzione plasmide pKM101
– introduce un sistema di riparazione error prone
– comporta la resistenza all’ampicillina
notipo dei principali ceppi di Salmon
∆
Mutazione Presenza Gene e sequenza Evento
uvrB- plasmide bersaglio reversione
ceppi Bio, rfa
hisG46 fosforilasi sostituzione
di base
→
-GGG- -GAG-
→
(leu pro)
TA1535 +,+ no
TA100 +,+ pKM101
hisD3052 istidinadeidrogenasi inser/delez
-1 bp -CGCGCGCG-
TA1538 +,+ no
TA98 +,+ pKM101
TA98NR +,+ pKM101
TA981.8-DNP +,+ pKM101
6
hisC3076 transaminasi inser/delez
+1 bp -CCC-
TA1537 +,+ no
2.Sistema attivazione metabolica
Mutageni diretti Mutageni indiretti
Analoghi di base
Derivati acido nitroso Fase I (ossidativo)
Agenti alchilanti Metabolismo Fase II (coniugativo)
Sostanza elettrofila Idrocarburi policiclici
aromatici
Ammine aromatiche
Benzene
Enzimi microsomiali provenienti da
omogenato di fegato di ratto (S9)
S9-mix NADPH + G6P + tampone fosfato
Fattori critici per il test
Quantità sostanza da testare e scelta delle dosi
– 5 mg piastra (max)
– 4-5 dosi + controllo negativo e positivo
Selezione solvente
– proprietà della sostanza
– caratteristiche chimico-fisiche e tossicologiche
solvente (Acqua - DMSO - acetone - diclorometano)
Selezione ceppi
– caratteristiche chimiche delle molecole in esame
– miscele complesse
aria TA98
acqua TA100
Condizioni di coltura dei ceppi
– fase di crescita logaritmica
3.Inoculo e crescita dei batteri
100 µl S. typhimurium 20 ml terreno liquido completo
istidina-dipendenti (contiene istidina)
1x10 batteri
8 37°C per 6-10 h
5x10 batteri/ml 1x10 batteri/ml
6 9
Controllo trasmittanza a 580 nm
TA100 28
TA1535 TA1537 TA98 30 Batteri in crescita
TA98NR 32 esponenziale
TA981.8-DNP 42
6
3.Schema sperimentale plate test
100 µl 500 µl
100 µl
S. typhimurium S9-mix
Composto
istidina-dipendenti da testare
(10 batteri)
8 o solvente
2 ml
Top agar 42-45°C
(agar+NaCl+
tracce di istidina e biotina)
Terreno minimo
(agar+glucosio+VBS) 37°C per 48 h
Colonie revertenti
istidina-indipendenti
Piastre di TA100 trattate con NaN 3
Controllo
Dose 1 Dose 2