Metabolismo nucleotidi
I nucleotidi ricoprono diversi ruoli:
- Informazione acidi nucleici (DNA, RNA)
- Sintesi proteica e regolazione acidi nucleici (mRNA, tRNA, smRNA)
- Trasporto di energia: ATP, GTP, ADP, AMP
- Metabolismo: UTP, ATP
- Segnali intracellulari: cAMP, cGMP
- Trasporto di equivalenti ridotti: NADH, NADP+, NADPH, FAD/FADH2
- Trasporto di acili CoA
A differenza degli zuccheri, degli acidi grassi e degli amminoacidi, i nucleotidi non rappresentano un’importante fonte di energia metabolica. Aspartato e glutammina sono i donatori del gruppo NH nella via di formazione dei nucleotidi. Tutti gli organismi possono sintetizzare nucleotidi sia mediante vie de novo (da precursori semplici), sia recuperando i prodotti di degradazione degli acidi nucleici. Entrambe queste vie producono ribonucleotidi. I deossiribonucleotidi vengono prodotti a partire dai ribonucleotidi corrispondenti.
Sintesi de novo
Sintesi de novo dei nucleotidi purinici (A e G)
La sintesi de novo dei nucleotidi purinici avviene attraverso la costruzione dell’anello purinico sul ribosio-5P per formare inosina monofosfato (IMP).
Sintesi de novo dei nucleotidi pirimidinici (T, C e U)
La sintesi de novo dei nucleotidi pirimidinici avviene attraverso la sintesi di una pirimidina, l’orotato, legato poi al ribosio-5P con conseguente conversione in uridina monofosfato (UMP).
Ribonucleotidi purinici
Sintesi de novo dei ribonucleotidi purinici
Le basi puriniche vengono costruite sull’anello di ribosio fosfato: sono prodotte non nella forma di basi libere, ma direttamente come ribonucleotidi. Questa sintesi avviene principalmente nel fegato. I tessuti nei quali è meno rappresentata (cervello) o del tutto assente (globuli rossi), dipendono dal fegato per il fabbisogno di purine e si riforniscono di nucleotidi purinici attraverso le vie di recupero.
- Reazioni: sul ribosio e formazione di PRPP, forma
- Trasferimento di un gruppo PPi attivata del ribosio
- Un gruppo amidico proveniente dalla glutammina sostituisce il gruppo pirofosforico (inversione di configurazione)
- Aggiunta di una glicina e formazione di GAR
- Formilazione del gruppo aminico di GAR e formazione di FGAR
- Aggiunta di un altro gruppo aminico, da glutammina, e formazione di FGAM
- Chiusura dell’anello imidazolico (AIR)
- Formazione del secondo anello mediante l’aggiunta degli ultimi 3 atomi, N da aspartato, e C da formile, C da CO2
L’enzima IMP sintasi catalizza la chiusura del secondo anello.
Sintesi AMP dall’IMP
Il gruppo amminico dell’aspartato si lega all’IMP, reazione favorita dall’idrolisi del GTP.