Linee generali di diagnostica microbiologica

Modulo di Microbiologia Clinica

Anno accademico 2008-2009

Per il Corso Integrato METLAMEC sono previste 3 ore di lezione, nell'Aula grande del complesso chirurgico P. Urbano 2008.

A seguito della modifica al piano di studi ufficiale, a partire dalla sessione di Febbraio 2009 l'esame di Microbiologia C.I. verterà anche sugli argomenti presentati alle lezioni di Microbiologia Clinica che prima rientravano nel C.I. MetLaMec.

Le lezioni sono state fissate come segue:

• Mercoledì 15 Ottobre, ore 9:30
• Mercoledì 22 Ottobre, ore 9:30
• Mercoledì 29 Ottobre, ore 9:30

Tutte nell'aula delle cliniche chirurgiche P. Urbano 2008.

15 ottobre 2008, ore 9:30

Scaletta

• Linee generali di diagnostica microbiologica. Vedi la presentazione che segue.
• Visita il sito del Laboratorio di Microbiologia di Careggi. P. Urbano 2008
• Linee generali di diagnostica microbiologica P. Urbano 08
• Clinical Microbiology in the 21st Century

Clinical microbiology laboratories provide services that are critical to...

the well-being of our population—analyzing specimens collected from sick patients and gathering data that enable the correct diagnosis to be made for victims of infectious diseases. They are the sentinels for bioterrorism events and natural outbreaks of infection which threaten the public health of the communities they serve.

These laboratories provide crucial information that guides the selection of the right antimicrobial therapy for patients with treatable infections. They are the first to recognize the emergence of resistance to frequently used antimicrobial agents.

Individuals who work in clinical microbiology laboratories are highly trained professionals who make countless decisions each day that save lives and benefit the sick and at-risk members of our society. P. Urbano 2008

Premessa

La diagnostica microbiologica è un esempio tipico di diagnostica etiologica. Consiste nell'identificare la causa microbica di una malattia o di un'infezione. Il più delle volte

consistenell’identificazione dell’agente diun’infezione [alla base di una malattiainfettiva] P. Urbano 2008

Casi particolari

Diagnosi di malattia non infettiva,ad etiologia microbica

Botulismo alimentare; intossicazionealimentare stafilococcica; TSS, ..

Diagnosi di immunità specifica auna data malattia o infezione P. Urbano 2008

Partizione principale

Diagnostica diretta

Trova e identifica l’agente

Isolandolo e identificandolo

Dimostrando la presenza di suoi prodotti specifici

Tossine

Antigeni

Acidi nucleici

Diagnostica indiretta

Cerca le prove di una risposta immunitariaspecifica in atto

Aumento del titolo anticorpale verso antigenispecifici dell’agente causale [‘movimento anticorpale’]

Reperto di anticorpi ad alto titolo

Reperto di anticorpi della classe IgM, o dianticorpi sIgA P. Urbano 2008

P. Urbano 2008

Isolamento

L’isolamento dell’agente ha un valore cheva oltre la diagnosi etiologica

Ne permette uno studio approfondito,

Per valutare:

Caratteristiche infraspecifiche [interesse epidemiologico e preventivo]

Fattori di virulenza e di patogenicità

Suscettibilità agli antibiotici

Antibiogramma = premessa a una terapia 'razionale' P. Urbano 2008

Per l'isolamento:

È necessario ipotizzare su base clinica una gamma di ipotesi etiologiche

Per ogni ipotesi, richiamare lo schema patogenetico corrispondente, per decidere quale materiale prelevare, in quale momento, e in quali condizioni

Inviare il materiale al laboratorio, informandolo delle ipotesi da perseguire P. Urbano 2008

Semine isolanti P. Urbano 2008

Isolamento in piastra È preliminare a ogni studio fenotipico P. Urbano 2008

I caratteri macroscopici variano a seconda del terreno [B. anthracis] P. Urbano 2008

Per l'isolamento, il laboratorio:

Potrà partire da un materiale normalmente sterile: Sangue, liquor, tessuti interni, versamenti articolari, ...

Terreni non selettivi... o da materiale normalmente microbico

Essudati su mucose

Tamponi nasali, cutanei, faringei, ... feci; ... Terreni selettivi P. Urbano 2008

Esempio di chiave diagnostica - coprocolture P. Urbano 2008