Lezione 4 scienza degli animali da laboratorio (nomenclatura)

Nomenclatura

Oggi andremo a vedere la nomenclatura:

Nomenclatura dei ceppi murini

In base alla classificazione genetica dei roditori, noi distinguiamo diversi ceppi murini:

• Ceppi inbred
• Ceppi outbred
• Ibridi
• GEMM (Topi mutanti o Geneticamente modificati) che a loro volta si distinguono in:
  • Spontanei
  • Coisogenetici
  • Target Mutation (Knock-out, Knock-in)
  • Transgenici
  • Collaborative Cross (CC)

Ceppi inbred

Un ceppo inbred è un ceppo che viene messo in accoppiamento con un partner non casuale rispetto al suo genotipo; in termini pratici, vuol dire che è un individuo nato da un incrocio fratello x sorella per 20 generazioni. In particolare, alla ventunesima generazione, si avrà un coefficiente di inbreeding pari circa al 98,4%; questa percentuale indica l’isogenicità, ovvero il numero dei geni che si trova in stadio di omozigosi.

In questo caso, oltre all’isogenicità, si viene a formare anche:

• Stabilità genetica, in quanto, la ricombinazione non potrà cambiamento e quest’ultimo potrà essere determinato solamente da una mutazione.
• Individualità, perché, ogni ceppo inbred avrà un profilo genetico unico, totalmente diverso da quello degli altri ceppi.
• Uniformità fenotipica, dal punto di vista fisiologico, metabolico, comportamentale ecc.

Questi animali inbred, vengono utilizzati soprattutto per verificare l’esistenza di un effetto; in particolare, se l’effetto esiste, tutti gli individui mostreranno quest’effetto.

Nomenclatura dei ceppi inbred

• Normalmente, i nomi possono derivare da chi li ha prodotti, da chi li ha scoperti, dal colore del mantello, dall’anno di produzione, dal luogo di nascita ecc.

Per quanto riguarda gli animali inbred, vedremo solamente i nomi più importanti, tra questi possiamo ricordare:

BALB/c:

• La prima B sta per il dott. Bagg che nel 1913 ha prodotto questo animale.
• ALB invece ci indica che questo individuo è albino (bianco con occhi rossi, dati dalla vascolarizzazione).

Oltre a questa nomenclatura, ne esiste anche una che invece si basa sull’origine e sul colore del mantello, un esempio, possiamo farlo con un altro animale molto utilizzato: C57BL/6J

Esistono diversi sottoceppi di topi inbred, C57BL/6.

Altri nomi inbred invece, si basano sull’origine dell’animale, come ad esempio:

• SJL: Swiss, Jim Lambert
• NZB: New Zeland Brown
• NZW: New Zeland White

In particolare, una delle cose molto importanti da ricordare per riconoscere se un ceppo è inbred o meno, è la presenza dello slash /.

Ceppi outbred

A questo punto, dal momento in cui per…