Diversità procariotica

Diversità procariotica

La tassonomia batterica è la disciplina che permette di identificare e classificare i batteri, importante esigenza pratica di cui necessitano i microbiologi sia clinici sia industriali, agrari e ambientali. Nel 1923 David H. Bergey e alcuni collaboratori scrissero per iniziativa della Società Americana dei Batteriologi (l'attuale American Society for Microbiology) il Bergey's Manual of Determinative Bacteriology, un trattato tassonomico sui procarioti che è stato in seguito continuamente aggiornato (9 edizioni) fino a divenire il testo di riferimento in batteriologia. Nel 1984 è stata prodotta la prima edizione del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology (Manuale Bergey di Batteriologia Sistematica) in 4 volumi articolata in classi e divisioni (Gracilicutes, Firmicutes, Tenericutes e Mendosicutes) che formavano il Regno dei Procarioti (Procaryotae). La seconda edizione è un'opera articolata in 5 volumi che descrive le proprietà dei batteri e presenta un ordinamento gerarchico nella tassonomia generalmente accettato come riferimento standard per l'identificazione dei batteri.

I procarioti sono raggruppati tassonomicamente sulla base dell'analisi filogenetica (tassonomia filetica, cioè basata su affinità evolutive), integrata con la tassonomia convenzionale (fenetica, ovvero basata sulla reciproca similarità dei caratteri fenotipici). Tale impostazione sistematica si deve alle acquisizioni filogenetiche di questi ultimi due decenni, che hanno fortemente influenzato la tassonomia biologica e batterica: attraverso studi sull'evoluzione biologica, che utilizzano metodi molecolari come la comparazione delle sequenze degli acidi nucleici (RNA ribosomiale, RNA messaggero e DNA) e l'analisi delle sequenze dell'RNA ribosomiale, sono state acquisite evidenze che hanno portato all'individuazione di tre linee cellulari fra loro distinte dal punto di vista evolutivo (albero filogenetico).

Le tre linee, che corrispondono ad aree filogenetiche (o domini), discendono da una comune cellula ancestrale; due di esse presentano una struttura procariotica, la terza eucariotica: Bacteria (Batteri), Archaea (Archea), e Eukarya (Eucaria o Eucarioti). Questa nuova classificazione su base evolutiva degli organismi viventi è ormai ampiamente accettata e vede i procarioti centrali nel percorso evolutivo del sistema biologico.