Composti Intermedi, Enzimi, strutture da imparare: biochimica 1 e 2

Biochimica i: composti da imparare e memorizzare

Pirimidine

Citosina
Timina
Uracile
Citosina
Timina
Uracile

Piridine e purine

Adenina
Guanina
Adenina
Guanina

Ribosio e gruppo fosfato

Ribosio (lineare)
Gruppo fosfato

Ciclizzazione

[Attacco nucleofilo dell'OH in posizione 1 sul carbonio carbonile] - Emiacetale
Ribosio (ciclico) (nucleosidi)

Biochimica i: composti da imparare e memorizzare

• Pirimidine: Citosina, Timina, Uracile
• Purine: Adenina, Guanina
• Gruppo fosfato
• Ciclizzazione (nucleotidi)
• ATP (nucleotide trifosfato)
• cAMP (nucleotide monofosfato ciclico)

Escrezione basi azotate

• Adenina
• Ipoxantina (1 OX)
• Xantina (2 OX)
• Acido urico (3 OX) - Tramite “Xantina ossidasi” (cofattore FAD)

Amminoacidi

Classificazione nutritiva

• AA. Essenziali
  • Phe (Fenilalanina)
  • Isoleucina
  • Leucina
  • Lisina
  • Metionina
  • Triptofano
  • Treonina
  • Valina
  • (Forse anche Istidina)
• AA. Non essenziali
  • Glicina
  • Alanina
  • Prolina
  • Cisteina
  • Tirosina
  • Serina
  • Asparagina
  • Glutammina
  • Aspartato
  • Glutammato
• AA. Semi-essenziali
  • Arginina

Gruppi R alifatici non polari

• Glicina (Gly, G)
• Valina (Val, V)
• Alanina (Ala, A)
• Leucina (Leu, L)
• Isoleucina

Gruppi R aromatici

• Fenilalanina (Phe, F)
• Tirosina (Tyr, Y)
• Triptofano (Trp, W)

Gruppi R polari non carichi

• Serina (Ser, S)
• Treonina (Thr, T)
• Cisteina (Cys, C)

Gruppi R carichi positivamente

• Lisina (Lys, K) R:NH₂|(CH₂)₄
• Arginina (Arg, R) NH||CNH₂ Gruppo Guanidinico (urea-simile)
• Istidina (His, H) Imidazolo

Gruppi R carichi negativamente

• Acido Aspartico (Asp, D) COOH|CH₂
• Acido Glutammico (Glu, E) COOH|CH₂

Gruppi R polari derivati da AA con gruppi R carichi

• Asparagina (Asn, N) CONH₂|CH₂
• Glutammina (Gln, Q) CONH₂|CH₂

Metionina (Met, M)

Presenta un legame Tiol-etere non polare nella sua catena laterale!

Prolina (Pro, P)

Il gruppo -NH₂⁺ (ammino) dell'α.a. è trasferito di posizione e scambia ruoli con la catena laterale dell'α.a. Ciclicizza legando appunto il gruppo amminico -NH₂⁺ che diventa: N_H / \C_α

Vitamine: cofattori enzimatici (no proteine)

Vitamina B3 (Nicotinamide)

Piridina + Acido formico = Acido nicotinico
Nicotinamide (vitamina B3)
La nicotinammide, se "aggiunta" ad altre molecole, può portare NAD⁺/NADH
NAD⁺ (Nicotinammide Adenina Dinucleotide) Forma ossidata + può esterificare su (P) e formare NADP⁺
Esempio di reazione che sfrutta NAD⁺/NADH Naoh (Nicotinammide Adenina Dinucleotide) Forma ridotta _NADH Latto deidro. Piruvato Ac. lattico

Vitamina B2 (Riboflavina)

• Durene
• Flavina
• Ribosio (lineare)
• Riboflavina (Vit. B2)

La Riboflavina, se "aggiunta" ad altre molecole, può formare FAD / FAD_H2
Ribotolose
FAD = cofattore della succinato ossidasi
FAD (Flavin Adenina Dinucleotide) Ossidato
FADH₂ (Flavin Adenina Dinucleotide) Ridotto
Enzimi con cofattore FAD → elettroni → ottenere H⁺ di legami C-H!!

Vitamina B6 (Piridossina)

La piridossina (B6) è importante perché:
È precursore del piridossale
Dal piridossale si forma piridossal fosfato (PLP)