Destino post traduzione delle proteine
Proteine sono molecole composte da una o più catene polipeptidiche. Esistono diversi tipi di proteine, tra cui:
Tipi di proteine
- Proteine monomeriche
- Proteine multimeriche (struttura quaternaria)
- Proteine eteromultimeriche (diversi tipi di polipeptidi)
- Proteine omomultimeriche (stesso tipo di polipeptide)
Processi principali delle proteine
- Ripiegamento delle proteine
- Smistamento delle proteine
- Modificazioni post-traduzionali
- Degradazione delle proteine
1. Il ripiegamento delle proteine
Studi di Anfinsen sulla ribonucleoproteina hanno mostrato la denaturazione e rinaturazione spontanea di una piccola proteina. In vivo, il ripiegamento delle proteine è assistito dagli chaperoni molecolari:
- Chaperoni della famiglia Hsp70
- HSP60s, conosciute come chaperonine, si dividono in due gruppi principali:
- Chaperonine di gruppo I, espresse negli Eubatteri, nei mitocondri, nei cloroplasti e in alcuni Archeobatteri
- Chaperonine di gruppo II, nel citosol degli Eucarioti e degli Archeobatteri
Nei batteri, l’85% delle proteine si ripiega spontaneamente o con l’aiuto delle Hsp70. Le restanti proteine necessitano di un ambiente più isolato per il loro ripiegamento, come la chaperonina GroEL/GroES.
2. Meccanismi e vie di smistamento delle proteine
Possiamo distinguere due principali percorsi:
- Proteine destinate al citoplasma, ai mitocondri, ai cloroplasti, al nucleo, ai perossisomi
- Proteine destinate al RE, al Golgi, alla membrana, alla secrezione, ai lisosomi
Il peptide segnale guida queste proteine lungo:
- Via citoplasmatica
- Via secretoria o vescicolare
Proteine destinate al nucleo
Sequenza di segnale: Pro-Pro-Lys-Lys-Lys-Arg-Lys-Val
Proteine destinate al reticolo endoplasmatico
Il core idrofobico è costituito da 6-12 residui idrofobici preceduti da uno o più residui basici. Il meccanismo di trasporto coinvolge il complesso associato nascente (NAC) e la particella di riconoscimento del segnale (SRP).
Sintesi di una proteina transmembrana e risposta alle proteine non ripiegate.
3. Modificazioni post-traduzionali delle proteine
- Proteolisi
- Modificazione di specifici aminoacidi:
- Idrossilazione
- Metilazione
- Acetilazione
- Glicosilazione
- N-glicosilazione
- O-glicosilazione
- Formazione di ponti S-S
- Aggiunta di lipidi di ancoraggio alla membrana:
- Aggiunta di acido miristico
- Aggiunta di acido palmitico
- Prenilazione
- Aggiunta di glicosil fosfatidil inositolo
La via vescicolare e le modificazioni post-traduzionali
- N-glicosilazione (Asn): Prima fase nel RER e seconda nel Golgi
- O-glicosilazione (Ser, Thr): Golgi
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