Filamento veloce, guida e filamento lento

Meccanismo di replicazione del DNA

Esiste un filamento guida/veloce dove la forcella di replicazione è in corrispondenza dell’estremità 3’ dell'acido deossiribonucleico; nell’altro filamento è invece fondamentale che la primasi sviluppi molti primer a breve distanza così che la polimerasi possa sintetizzare in direzione 5’→3’ senza allontanarsi dalla forcella di replicazione. I frammenti ritardanti che la DNA polimerasi produce in questo caso sono detti frammenti di Okazaky. Fondamentali in questa fase sono anche le single strand binding proteins (SSBP) che permettono di mantenere aperta la forcella mentre avviene la sintesi ad opera della polimerasi. I primer possono essere ora eliminati e sostituiti da del DNA attraverso una DNA polimerasi. I frammenti di Okazaky sono invece saldati dalla DNA ligasi.

Differenze tra procarioti ed eucarioti

Organismi diversi presentano polimerasi diverse perché presentano DNA con caratteristiche diverse, in particolare i procarioti, a differenza degli eucarioti, presentano piccole molecole di DNA circolari. Le polimerasi degli eucarioti vengono quindi indicate con le lettere greche e quelle dei procarioti con i numeri romani di modo da distinguerle. Un’ulteriore differenza sta nel fatto che i batteri, a differenza dei mammiferi, presentano un’unica forcella di replicazione.