Concetti Chiave
- Il codice genetico è a triplette, scoperto attraverso esperimenti con batteriofagi e mutanti indotti da proflavina, dimostrando che tre mutazioni dello stesso tipo possono ristabilire il fenotipo wild type.
- Nirenberg e Matthaei hanno utilizzato RNA sintetici e estratti cellulari per la traduzione in vitro, contribuendo a identificare il codice genetico.
- Il Trinucleotide Binding Assay di Nirenberg e Leder ha dimostrato che specifici trinucleotidi legano aminoacidi corrispondenti sui ribosomi.
- L'RNA viene tradotto in direzione 5'3', permettendo alla sintesi proteica di iniziare su RNA non completamente trascritti, essenziale per la regolazione genica nei batteri.
- I poli-trinucleotidi sintetici hanno rivelato che il codice genetico è continuo e non presenta punteggiatura, con codoni di stop come UAA, UAG, e UGA che non codificano per aminoacidi.
Indice
Scoperta di Francis Crick
Scoperto da Francis Crick.
Hanno usato un batteriofago, il T4 e hanno usato un mutante, che è R2. Il mutante non cresceva nel ceppo K12 ma entrambi crescevano nel ceppo B.
Mutanti indotti dalla proflavina che è una sostanza che causa delle index (inserzioni/delezioni) di una singola coppia di basi. Che cosa è un’ index? Se tolgo una base (delezione) sfasa la fase di lettura. Stessa cosa succede se inserisco una base. I mutanti da proflavina potevano revertire e quindi tornare a selvatico. Una delezione causa un mutante, per farlo tornare a wild type c’è bisogno di una inserzione.
I revertanti sono di due tipi:
-una inserzione/delezione viene revertita dalla delezione/inserzione dello stesso nucleotide (rarissimo).
-La prima delezione viene revertita da una seconda delezione in un’altra posizione, se la inserzione successiva è poche basi più avanti vado a stabilire la sequenza esatta dalla delezione in avanti.
Codice genetico e triplette
Hanno capito che le mutazioni per inserzioni (mutaz +) delezioni (mutaz -).
Due mutazioni dello stesso segno non ristabilivano mai i wild type.
Se avvenivano 3 mutazioni dello stesso segno in diversi casi si ristabiliva il wt. Questo perché 3 + causano inserzione di un amminoacido ma nello spazio tra le tre mutazioni a valle, la lettura è identica all’originale.
Unica spiegazione possibile è che il codice genetico sia a triplette quindi l’mRNA viene letto di tre basi per volta.
Esperimenti di Nirenberg e Leder
RNA sintetici e estratti cellulari per la traduzione in vitro.
La Polinucleotide fosforilasi sintetizza RNA senza bisogno di uno stampo partendo da ribonucleotide difosfati.
Nirenberg e Leder sintetizzano tutti e 64 i trinucleotidi e li associano uno a uno ai ribosomi in presenza di specifici aminoacidi marcati con radioattivo.
Scoprono che un particolare trinucleotide legato al ribosoma provoca il legame di un solo tipo di aminoacido. Esempio UGU provoca il legame al ribosoma di Cys.
Direzione della traduzione
Hanno messo una C, per capire in che direzione viene tradotto l’RNA.
Dato che la trascrizione procede in direzione 5’ 3’ la traduzione in direzione 3’ 5’ richiederebbe un RNA completamente trascritto per iniziare. Al contrario, la traduzione in direzione 5’ 3’ consente alla sintesi proteica di iniziare su un RNA non ancora completamente trascritto. L’accoppiamento che ne deriva tra trascrizione e traduzione è fondamentale per la regolazione dell’espressione dei geni nei batteri.
Hanno preso dei trinucleotidi UUC, hanno capito che la traduzione dipende dal punto in cui inizia ad essere letto il DNA.
Questo perché il codice genetico non è sovrapposto ma si legge in maniera continua, si va avanti di tre nucleotidi alla volta in direzione 5’3’. Il codice genetico non presenta punteggiatura.
I geni possono essere sovrapposti nei procarioti.
Si è scoperto che il codice genetico ha codoni di stop che non codificano per nessun aminoacido: UAA UAG UGA.
Domande da interrogazione
- Qual è la struttura del codice genetico e come è stata scoperta?
- Come hanno contribuito Nirenberg e Matthaei all'identificazione del codice genetico?
- In quale direzione avviene la traduzione dell'RNA e perché è importante?
- Qual è il ruolo dei poli-trinucleotidi sintetici nella comprensione del codice genetico?
- Quali sono i codoni di stop nel codice genetico e quale funzione svolgono?
Il codice genetico è a triplette, scoperto da Francis Crick utilizzando mutanti indotti dalla proflavina. Tre mutazioni dello stesso segno possono ristabilire il wild type, indicando che l'mRNA viene letto in gruppi di tre basi.
Nirenberg e Matthaei hanno utilizzato RNA sintetici e estratti cellulari per la traduzione in vitro, dimostrando che specifici trinucleotidi si legano a ribosomi e determinano il legame di specifici aminoacidi.
La traduzione dell'RNA avviene in direzione 5’3’, permettendo alla sintesi proteica di iniziare su un RNA non completamente trascritto, fondamentale per la regolazione dell'espressione genica nei batteri.
I poli-trinucleotidi sintetici hanno dimostrato che la traduzione dipende dal punto di inizio della lettura del DNA, confermando che il codice genetico è continuo e non sovrapposto, con codoni di stop che non codificano per aminoacidi.
I codoni di stop nel codice genetico sono UAA, UAG e UGA, e non codificano per nessun aminoacido, segnando la fine della traduzione proteica.