Paniere per esame di Biologia Molecolare Mod. 1 e 2

Set Domande

BIOLOGIA MOLECOLARE

SCIENZE BIOLOGICHE

Docente: Russo Silvia 28/06/2019 15:33:26

Generato il 40

N° Domande Aperte 123

N° Domande Chiuse

Set Domande: BIOLOGIA MOLECOLARE

SCIENZE BIOLOGICHE

Docente: Russo Silvia

Indice

Indice Lezioni .......................................................................................................................... p. 2

Lezione 002 ............................................................................................................................. p. 3

Lezione 003 ............................................................................................................................. p. 4

Lezione 004 ............................................................................................................................. p. 5

Lezione 005 ............................................................................................................................. p. 7

Lezione 006 ............................................................................................................................. p. 8

Lezione 007 ............................................................................................................................. p. 9

Lezione 008 ............................................................................................................................. p. 10

Lezione 009 ............................................................................................................................. p. 12

Lezione 011 ............................................................................................................................. p. 13

Lezione 013 ............................................................................................................................. p. 14

Lezione 014 ............................................................................................................................. p. 15

Lezione 015 ............................................................................................................................. p. 18

Lezione 016 ............................................................................................................................. p. 19

Lezione 017 ............................................................................................................................. p. 21

Lezione 018 ............................................................................................................................. p. 22

Lezione 019 ............................................................................................................................. p. 23

Lezione 020 ............................................................................................................................. p. 24

Lezione 021 ............................................................................................................................. p. 26

Lezione 022 ............................................................................................................................. p. 27

Lezione 023 ............................................................................................................................. p. 29

Lezione 024 ............................................................................................................................. p. 30

Lezione 025 ............................................................................................................................. p. 31

Lezione 026 ............................................................................................................................. p. 32

Lezione 028 ............................................................................................................................. p. 33

Lezione 029 ............................................................................................................................. p. 34

Lezione 031 ............................................................................................................................. p. 36

Lezione 032 ............................................................................................................................. p. 37

Lezione 033 ............................................................................................................................. p. 39

Lezione 034 ............................................................................................................................. p. 40

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Lezione 002

01. Un tipo di legame debole che avviene fra 2 molecole che hanno cariche elettriche parziali di opposta polarità formano un'attrazione intermolecolare.

legame idrofobico

legame debole si forma tra molecole con carica netta(ioni) o carica distribuita in modo non uniforme

legame idrogeno è un legame forte

legame covalente legame debole tutti lo riescono a formare

forze di van der Waals

02. Quale delle seguenti reazioni è poco probabile che avvenga spontaneamente?

A + B--> C if ?G° for the reaction equals -2.5 kcal/mol.

A + B --> C if Keq for the reaction equals 0.5.

A + B --> C if ?G° for the reaction equals -12.5 kcal/mol

A + B --> C if ?G° for the reaction equals +1 kcal/mol © 2016 - 2019 Università Telematica eCampus - Data Stampa 28/06/2019 15:33:26 - 3/40

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Docente: Russo Silvia

Lezione 003

01. che cosa ha osservato Chargaff?

in tutte le specie A+T=G+C

il DNA estratto da tessuti diversi di organismi della stessa specie ha la stessa composizione in basi.

giusta la composizione in basi non varia da una specie all'altra

in tutte le specie il n delle guanine è uguale a quello delle adenine

02. anche se c'è una rotazione libera intorno al legame glisodico delle basi azotate, l'ingombro sterico

fa adottare alle pirimidine solo la configurazione anti

le purine possono adottare solo la configurazione anti

fa adottare alle pirimidine solo la configurazione sin

permette alle purine solo la configurazione syn e molte possibilità alle pirimidine

03. Hai isolato da E.coli un plasmide di 10.500 pb (superavvolto, cccDNA). Il plasmide contiene un unico sito di riconoscimento per EcoRI, un enzima di

restrizione. Gli enzimi di restrizione riconoscono una sequenza specifica e tagliano entrambi i filamenti del DNA a livello di quella sequenza. Hai isolato da E.coli

un plasmide di 10.500 pb (superavvolto, cccDNA). Il plasmide contiene un unico sito di riconoscimento per EcoRI, un enzima di restrizione. Gli enzimi di

restrizione riconoscono una sequenza specifica e tagliano entrambi i filamenti del DNA a livello di quella sequenza. IMMAGINE DA INSERIRE

Hai brevemente incubato il cccDNA a 37 °C in quattro reazioni diverse contenenti i componenti indicati sotto. Poi hai fatto correre la reazione in un gel di

agarosio e visualizzato il DNA usando il bromuro di etidio e la luce UV. Le miscele di reazione contenevano un tampone adeguato e l'ATP, quando era necessario.

In figura è mostrato un gel di agarosio con quattro canali dove sono rappresentati i possibili prodotti. Per ogni reazione, indica quale canale contiene i prodotti che

ti aspetteresti di vedere sul tuo gel di agarosio e motiva la scelta con una spiegazione. © 2016 - 2019 Università Telematica eCampus - Data Stampa 28/06/2019 15:33:26 - 4/40

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Lezione 004

01. La struttura a doppia elica assorbe la luce UV meno della struttura a singola elica perché:

difficile penetrazione

le basi all'interno della doppia elica sono inaccessibili agli UV ipercronimo

a causa dell'effetto ipocromico che si ha in quanto il legame H e l'impilamento delle basi limita la risonanza negli anelli aromatici delle basi

giusta non è vero la singola elica assorbe più luce UV nn parla di luce bianca

l'impilamento delle basi aumento l'assorbimento della luce bianca a discapito dell'assorbimentodella luce UV

02. Quale delle seguenti proprietà chimiche dell'interazione tra purine e pirimidine non influenza struttura e funzione degli acidi nucleici?

l'impilamento idrofobico

l'assorbanza agli UV

il tautomerismo delle basi

la planarità delle basi

03. Certe sequenze nucleotidiche si ripiegano nell'elica Z più facilmente di altre. Quale delle seguenti è una caratteristica tipica dell'elica Z?

le eliche Z sono solitamente destorse

le eliche Z tendono a formarsi quando si alternano residui di A e G

le eliche Z tendono a formarsi quando si alternano residui di 5 metilcitosine e G

nelle eliche Z tutte le basi hanno conformazioni anti

04. Quale superstruttura può essere assunta da un tratto di DNA a doppia elica che contiene una sequenza ripetuta e invertita?

Struttura circolare

Struttura superavvolta

Struttura Z

Struttura cruciforme

05. La particolare instabilità dell'RNA (rispetto alle molecole di DNA) è dovuta alla presenza di un gruppo ..... sulla posizione 2' del ribosio

ossidrilico

fosforico

metilico

amminico

06. Quali interazioni molecolari sono implicate nella stabilizzazione della doppia elica del DNA? (2 risposte corrette)

Legami fosfodiesterici

Interazioni idrofobiche (impilamento delle basi).

Interazioni di Van der Waals.

Legami covalenti

07. Quali dei componenti chimici di una catena polinucleotidica presentano cariche negative?

Nessuno.

I gruppi fosfato

Le basi puriniche

I residui di zucchero (desossiribosio o ribosio). © 2016 - 2019 Università Telematica eCampus - Data Stampa 28/06/2019 15:33:26 - 5/40

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08. Quali delle seguenti modificazioni sono utilizzate nei nucleotidi?

Modificazioni degli acidi grassi

Fosforilazione

Metilazione

Glicosilazione RNA

09. Quale dei seguenti componenti NON appartiene al ribonucleotide

Ribosio

Gruppo fosfato

Uracile quando la incontra la trasforma in URACILE

Timina

10. Scegli il corretto ordine per il flusso di informazione del dogma centrale.

DNA, traduzione, RNA, replicazione, proteine DNA trasferita al RNA che funge da stampo per la sintesi di proteine

lez. 3

RNA, traduzione, DNA, trascrizione, proteine

DNA, trascrizione, RNA, replicazione, proteine

DNA, trascrizione, RNA, traduzione, proteine

11. Quale dei risultati sperimentali di Avery dimostrò che il DNA è necessario e sufficiente alla trasformazione dei batteri?

Le proteine da sole permettono la trasformazione

L'aggiunta di DNA da solo permette la trasformazione.

Rimuovendo il DNA dagli estratti cellulari ottenuti dal ceppo S la trasformazione non avveniva

Rimuovendo l'RNA dagli estratti cellulari ottenuti dal ceppo S la trasformazione non avveniva

12. Come è stato determinato per la prima volta che la tripletta UUU codifica per la fenilalanina?

Determinazione della struttura tridimensionale a doppia elica del DNA

Sintesi proteica in vitro programmata da un polinucleotide sintetico (poliU) che funge da mRNA artificiale in un estratto di cellule di E.coli.

Determinazione chimica della composizione in basi del DNA e della composizione in amminoacidi delle proteine

Sequenzamento diretto del DNA e del prodotto proteico © 2016 - 2019 Università Telematica eCampus - Data Stampa 28/06/2019 15:33:26 - 6/40

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Lezione 005

01. L'RNA può avere attività enzimatica?

sì , i ribozimi sono RNA che hanno un sito di legame per il substrato ed una per i cofattori

Si, le snRPN sono enzimi conivolti nello splicing

no, la solo funzioni di regolazione e trascrizione

no, può interagire con enzimi e mediarne l'attività ma non funzionare come un'enzima le tre basi, due piramidine e una purina, interaiscono all'interno dell'elica, le

02. Spiega come si forma l'appaiamento di Hoogsteen e in quale strutture lo si ritrova

purine formano legami di H con le piramidine di entrambe le eliche. Questi particolari legami di H non canonici si chiamano appaiamenti di Hoogsteen e si

trovano in molte interazioni che coinvolgono gli acidi nucleici.

03. Descrivi struttura e funzione delle molecole di RNA evidenziandone la relazione

Il pentoso dell'RNA è il ribosio, la base che si appaia con l'adenina e l'Uracile (non la Timina come accade nel DNA), si trova principalmente a singola elica, ma

sequenze complementari presenti sul filamento possono generare tratti a doppia elica responsabili della struttura secondaria, inoltre transita dal nucleo al cito-

plasma, ne esistono diversi tipi di RNA: tRNA, mRNA, microRNA

interazioni terziarie complesse ripiegano l'RNA nella sua struttura finale tridimensionale che è stabilizzata dalle interazioni di H e dall'ampliamento delle basi.

Le sue funzioni possono essere:

Strutturale ad esempio gli RNA sui ribosomi

Informazionale: legano e decifrano il codice a tre lettere

Regolative:come i microRNA

Catalitiche: come i ribozimi © 2016 - 2019 Università Telematica eCampus - Data Stampa 28/06/2019 15:33:26 - 7/40

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Lezione 006

01. quali funzioni dell'RNA sono dipendenti dalla sua struttura terziaria?

trasportatore transiente di informazione genetica

trasportatore di aminoacidi al sito di di sintesi proteica

ruolo catalico splicing e trascrizione

tutte

02. Gli appaiamenti di Hoogsteen

risulta in un tetraplex da uno strecht di residui di G

risulta in un triplex in cui tutti e tre i filimenti sono composti solo da purine

possono risultare nella formazione di una tripla elica all'interno di lunghe sequenze che contengono solo purine e pirimidine in un filamento

può creare interazioni addizionali AT © 2016 - 2019 Università Telematica eCampus - Data Stampa 28/06/2019 15:33:26 - 8/40

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Lezione 007

01. Descrivi la struttura dei centromeri © 2016 - 2019 Università Telematica eCampus - Data Stampa 28/06/2019 15:33:26 - 9/40

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Lezione 008

01. Quali delle seguenti affermazioni sui superavvolgimenti solenoide e plectonemico è vero?

i superavvolgimenti plectonemici sono sempre sinistorsi, mentre quelli solenoidi sono destorsi

solo i superavvolgimenti plectonemici sono stabilizzati dalla presenza di proteine.

la formazione di superavvolgimenti solenoidi è sequenza specifico

nel DNA rilassato i superavvolgimenti plectonemici sono tutti destorsi e i superavvolgimenti sinistorsi sono solenoidi

02. Le Topoisomerasi di tipo II tagliano

un solo filamento e sono dei monomeri

entrambi i filamenti e sono in genere dimeri o multimeri

un solo filamento e sono dimeri o multimeri

entrambi i filamenti e sono in genere monomeri

03. Quali sono i parametri della struttura Z del DNA?

Elica sinistrorsa | Diametro dell'elica: 20 Å Passo dell'elica: F34 Å

Elica destrorsa | Diametro dell'elica 18 Å Passo dell'elica 46 Å

Elica destrorsa | Diametro dell'elica 25 Å | Passo dell'elica 23 Å

Elica sinistrorsa | Diametro dell'elica 18 Å Passo dell'elica 46 Å

04. Le Topoisomerasi di tipo I tagliano

entrambi i filamenti e sono in genere monomeri

un solo filamento e sono dimeri o multimeri

un solo filamento e sono dei monomeri

entrambi i filamenti e sono in genere dimeri o multimeri

05. i centromeri sono

sono sequenze sul cromosoma eucariote che funzionano durante la divisione cellularecome punto d'attacco per le proteine che associano il cromosoma al fuso mitotico

sono le sequenze in cui si forma il cinetocore nei cromosomi dei procarioti

sono sequenze alle estremità dei cromosomi che aumentano la stabilità dei cromosomi lineari

sono i siti a cui inizia la replicazione nei procarioti

06. Le sequenze dei telomeri contengono strutture secondarie tipo

struttura cruciforme

struttura a zig-zag

Struttura a solenoide

G quartet

07. Quali sono le caratteristiche della eterocromatina facoltativa?

E' trascritta in alcuni casi ma non in altri.

Non contiene geni.

E' sempre compattata

E' sempre trascrizionalmente inattiva. © 2016 - 2019 Università Telematica eCampus - Data Stampa 28/06/2019 15:33:26 - 10/40

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08. Quale struttura assume una doppia elica ibrida costituita da un filamento di DNA ed uno di RNA?

Struttura A

Struttura mista

Struttura B

Struttura Z

09. Un mRNA sintetico con sequenza ripetitiva 5'-CACACACACACACACACACACACA...-3' viene introdotto come stampo in un estratto cellulare usato come

sistema di sintesi proteica in vitro. Assumendo che questa sintesi proteica inizi dal primo nucleotide della sequenza, senza bisogno di un codone di inizio, quale

prodotto (o quali prodotti) ti aspetti di trovare dopo la sintesi?

Una proteina con sequenza alternata di tre differenti amminoacidi

Una proteina contenente un solo tipo di amminoacido

Una proteina con sequenza alternata di due differenti amminoacidi.

Due proteine con sequenza alternata di tre differenti amminoacidi

10. Considerando una molecola di DNA duplex circolare superavvolta, qual'è la relazione che esiste tra le grandezze: "twist" (Tw), "writhe" (Wr) e "linking

number" (Lk)?

A. Lk = Tw + Wr

B. Lk = Tw - Wr

C. Lk = Tw · Wr

D. Tw = Lk + Wr © 2016 - 2019 Università Telematica eCampus - Data Stampa 28/06/2019 15:33:26 - 11/40

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Lezione 009

01. l'istone H1 linker

appartiene ad una struttura di supporto detta scaffold

Piccola proteina globulare con una coda N-ter di 20-35aa, 80 residui nel dominio centrale globulare e e regione Cter di 10