Miceti di interesse medico
Gran parte dei miceti patogeni per l'uomo e responsabili delle infezioni fungine, dette micosi, appartiene al phylum Deuteromiceti (Funghi imperfetti), nei quali cioè la riproduzione è asessuata e non sono stati osservati, fino ad ora, processi di riproduzione sessuata. Solo alcuni miceti patogeni, come Cryptococcus neoformans, appartengono agli altri phylum, come Trichophyton e Microsporum (phylum III), (phylum II).
Tuttavia, dal punto di vista medico, la classificazione biologica risulta poco utile al fine di una corretta diagnosi delle micosi. Sulla base delle caratteristiche dei funghi patogeni per l'uomo è stata formulata una classificazione articolata in gruppi sulla base dei tessuti interessati dall'infezione:
Miceti superficiali
Malassezia furfur e Cladosporium werneckii sono miceti superficiali che possono causare infezioni degli strati più superficiali e non vitali dell'epidermide (per esempio solo su capelli o unghie). Raramente evocano una risposta immunitaria nell'ospite.
Miceti a localizzazione cutanea
Comprendono i dermatofiti e sono miceti a localizzazione cutanea, prevalentemente i generi Microsporum, Trichophyton, Epidermophyton, che causano infezioni contagiose dette dermatofitosi, limitate ai tessuti cheratinizzati come l'epidermide, le unghie e i peli (tigne). Sono miceti che presentano maggiore invasività e inducono una marcata risposta infiammatoria nell'ospite.
Miceti sottocutanei
Questi miceti, come i saprofiti del suolo e dei vegetali, ad esempio Sporothrix schenckii, in genere penetrano con qualche forma di lesioni traumatiche e possono creare infezioni dei tessuti sottocutanei, delle ossa e delle fasce muscolari. Hanno in genere un basso grado di infettività.
Miceti opportunisti e delle mucose
Tra cui prevalgono i miceti saprofiti liberi dei generi Aspergillus e Penicillium e quelli come Candida e Cryptococcus che invadono le mucose, i quali possono causare infezioni fungine nella mucosa orale, respiratoria e genitale.
Miceti sistemici
Miceti sistemici sono saprofiti del suolo che, se inalati, possono determinare infezioni che coinvolgono sempre l'apparato respiratorio e poi gli organi interni e i visceri; vi sono compresi miceti come Coccidioides immitis, Histoplasma capsulatum, Blastomyces dermatitidis.