Lezioni, Biochimica

Biochimica

Prof.ssa Marcella Cemic:

Testo consigliato: "Principi di biochimica di Lehninger"

Esame orale (NB: 1° domanda: disegnare un pentapeptide)

1° lezione: introduzione alla materia e presentazione degli argomenti che verranno trattati.

Dal cap. 1: fondamenti di biochimica

Organismo vivente = elevato grado di complessità chimica e di organizzazione;

• capacità di ottenere energia dall'ambiente esterno;
• di riprodursi.

Unità di misura fondamentali in biochimica:

• grandezze: mm (10^-3); µm (10^-6); nm (10^-9); Å (10^-10 m); Da (per la massa atomica e molecolare)
• Tempo: s, ms (10^-3); ps (10^-12)

Gerarchia dell'organizzazione molecolare della cellula:

• cellula
• organuli
• complessi sopramolecolari (ad es. membrana, cromatina...)
• macromolecole biologiche (proteine, lipidi, acidi nucleici...)
• biomolecole base (amminoacidi, monosaccaridi, acidi grassi...)
• intermedi metabolici
• precursori

Vedare gli elementi essenziali degli organismi viventi (i cosidetti CHONPS).

Biochimica

02/10/13

Prof.ssa Marcella Cemic.

Testo consigliato: "Principi di biochimica di Lehninger"

Esame orale (NB 1^a domanda: disegnare un pentapeptide)

1^a lezione: introduzione alla materia e presentazione degli argomenti che verranno trattati.

Dal cap 1: fondamenti di biochimica

Organismo vivente = elevato grado di complessita chimica e di organizzazione;

capacita di ottenere energia dall'ambiente esterno;

di riprodursi.

Unita di misura fondamentali in biochimica:

• grandezze: mm (10^-3 ); μm (10^-6 ); nm (10^-9 ); Å (10^-10 m ); Da (per la massa atomica e molecolare)
• tempo: s, ms (10^-3 ); ps (10^-12 s)

Gerarchia dell'organizzazione molecolare della cellula:

• cellula
• organuli
• complessi sopramolecolari (ad es. membrane, cromatina...)
• macromolecole biologiche (proteine, lipidi, acidi nucleici...)
• biomolecole base (amminoacidi, monosaccaridi, acidi grassi...)
• intermedi metabolici
• precursori

Vedere gli elementi essenziali degli organismi viventi (C con dettagli CHONPS).

Abbondanza degli elementi inorganici nelle cellule organiche, dal più al meno abbondante:

C O N H P S

• Lo ₂ adatta bene al b₂otico p₅oc₅e g₂ande v₅e₂sat₅ilità nel f₂o₂mare leg₂a₅mi...

nei non viventi: H O N C → st₂oni: elementi, diversa organizzazione.

Dal cap. 2: l'acqua

La molecola dell'acqua H ₂O ha delle caratteristiche che la rendono essenziale e ₂ adatta alla vita:

• Elevato punto di ebollizion₅e (100º), temperatura di solidificazione 0º;
• La fo₅rma solida è meno densa della fo₅rma liquida (il ghiaccio galleggia nell'acqua), il che ₂ è a₂datt₂a perfettamente alla vita (b₂asta pensare che s₅e co₅sì non fosse, il ghiaccio si formerebbe sul fondale oceanico, senza possibilità di scioglierli);
• nell'uomo siamo 70% di H₂O;
• è un ₂ eccel₂l₅ente a₂vente p₂er m₅olec₅ole polari e ioni.

Struttura della molecola di acqua:

H ₂O

e' molto s₂imile a un t₂e₅tr₂a₅e₅dro

(₅ osserv₂ che l'angol₅o H-O-H misura 104,5º);

Complessivamente la car₂ica net₅ta è uguale a zero, ma la distribuzion₅e degli e- non è omogenea:

di fatto l'og₂eg₅eno è fort₅emente e₅lettronegativo e di ess₅i gli e- attorno al suo nucleo si forma un dipolo: O _(s^-) = 2 H _(s⁺).

Lo ₅ e' al₅la base₅ delle caratteristiche dell'acqua.

• NB H ₅ha dimensio₅ni molto piccole, cos₅i può avvicinare a un'altra m₅olec₂ola di H₂O attirata dalla parzialità carr₅ca negativa → inter₂azione di tipo elettrostatico → legame a idrogeno
• H è 4 k₅cal₂/mole abbassabile nei molti processi nel m₅ondo biologico, form₅ando forti legame covalente 110 k₅cal/

un legame a H = 4 Kcal/mole, è debole, ma se numerosi danno STABILITÁ

legame covalente = 110 Kcal/mole

NB i legami a H non si formano solo tra l