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La struttura e le dimensioni dei protozoi variano ampiamente:
Entamoeba histolytica presenta un diametro di 5 mentre
µm,
Balantidium coli di 150 µm.
I protozoi sono costituiti da un involucro cellulare che
racchiude il citoplasma e il nucleo.
Fra i protozoi patogeni vi sono alcuni elementi comuni e fra
questi emerge per importanza il ciclo vitale che in molti
protozoi prevede sia una fase di cisti, ossia una forma
immobile e metabolicamente inattiva che assicura loro la
sopravvivenza in presenza di condizioni ambientali ostili,
sia uno stadio vegetativo dotato di motilità, in cui sono in
grado di nutrirsi e di riprodursi attivamente (trofozoite).
I trofozoiti hanno il citoplasma circondato da una membrana
citoplasmatica e sono meno resistenti nell'ambiente esterno
rispetto alla maggior parte dei batteri.