Glicobiologia - 3

Corso di tecniche analitiche in glicobiologia

Lezione 3

Ci sono numerosi studi che riguardano il coinvolgimento di glicoproteine come recettori; il livello di glicosilazione è spesso collegato a stadi di alterazione delle linee cellulari e a stadi patologici.

Glicoproteine

(È una famiglia abbastanza ampia)

• Proteine che legano covalentemente monosaccaridi oppure oligosaccaridi.
• La modifica della proteina è un evento co-traduzionale o post-traduzionale (glicosidazione, ne esistono vari tipi, ma noi ci concentreremo su due tipi fondamentali).
• Le cellule animali non sopravvivono quando sono private dalla parte glicidica della glicoproteina.
• Le catene oligosaccaridiche influenzano il folding, il processing, il targeting e l’attività biologica delle glicoproteine (alcuni studi mettevano anche in relazione come il livello di glicosidazione fosse correlato con l'invecchiamento della proteina, quindi come il processamento della componente monosaccaridica fosse funzione del tempo e quindi come l'assenza di determinati residui monosaccaridici fosse il segno che la proteina dovesse essere avviata alla distruzione).

Le glicoproteine (quindi il tipo di glicosilazione) possono essere di due tipi:

• N-linked, quando la porzione glicosidica è legata ad un residuo di Asparagina mediante un legame N-glicosidico. Nella maggioranza dei casi il primo monosaccaride è una β-GlcNAc.
• O-linked, quando la porzione glicosidica è legata ad un residuo di Serina o Treonina mediante un legame O-glicosidico. Nella maggioranza dei casi (90%) il primo monosaccaride è un α-GalNAc.

Identificazione del tipo di glicoconiugato

Come si fa ad identificare il tipo di glicoconiugato con cui si ha a che fare? Una delle informazioni principali che si ha è la presenza o meno di questo monosaccaride, ovvero α-GalNAc (N-acetil-galattosammina), allora si saprà che è una glicoproteina di tipo O.

Struttura primaria di una glicoproteina

Comprende:

• Catena polipeptidica e sue modificazioni covalenti:
• Glicosilazione
• Fosforilazione
• Acilazione
• Ammidazione
• Lipidazione
• Solfatazione

Sono isolabili dalla fonte naturale solo in piccole quantità.

Limiti nella determinazione strutturale di glicoproteine

Sono isolabili dalla fonte naturale solo in piccole quantità. Tutta la parte proteica ha un ruolo fondamentale, sia per quanto riguarda la caratterizzazione che per la purificazione.

Funzioni della parte glicidica

Funzioni intrinseche: componenti strutturali di membrana e della matrice extracellulare. Capacità di modificare la solubilità e la stabilità delle proteine.

Funzioni estrinseche: capacità di dirigere la circolazione intracellulare ed extracellulare.