cellulosa avviene per via enzimatica; il motivo per il quale viene detto circoscritto è dovuto alle modalità di attacco.
BROWN ROT
: marciumi molli (carie quando rimane più secco) un particolaremente famoso è il Serpula Lacrymans. Si insedia all’interno degli edifici poiché le fe tollerano l’estrema disidratazione. Secondo linee di frattura si spacca, carie cubica. Degradazione ossidativa di cellulose ed emicellulose (H2O2) lasciando inalterata la lignina. Nel caso delle cellulose c’è una differenza perché i funghi del soft rot vengono attaccati per via enzimatica. I funghi del brown rot procedono per via ossidativa e soprattutto non enzimatica. Producono l’agente ossidante cioè H2O2, che viene prodotto a seguito della degradazione della cellulosa.
WHITE ROT
: degradano tutte le componenti del legno. Sono gli unici organismi sul pianeta in grado di mineralizzare la lignina. Esistono anche alcuni batteri ( Attinomiceti ) che mineralizzano parzialmente la lignina. Svolgono un processo che ha caratteristiche particolari: la lignina si sviluppa come un reticolo tridimensionale che ricopre le altre componenti della parete cellulare. Si sviluppa come un reticolo tridimensionale costituito da acidi cinnamilici. La lignina è una molecola idrofobica per cui gli enzimi che agiscono sono delle ossidasi che richiedono ossigeno (processo aerobico) . Lo scopo della degradazione è un processo realizzato dai funghi per accedere a cellulose ed emicellulose come fonte di nutrimento. La degradazione delle lignine è un processodi combustione enzimatica: così come la combustione necessita di O2 e poi è un processo innescato dall’attività degli enzimi ma poi ci sono passaggi spontanei che portano alla formazione di radicali cationi altamente instabile e quindi tendono ad ossidare le molecole che si trovano nelle immediate vicinanze.
Le ossidasi ricadano in diversi gruppi biochimici :
- Fenolossidasi (agiscono sulla porzione fenolica) = Laccasi ossidano gli anelli fenolici introducendo un secondo gruppo idrossile e poi viene aperto l’anello fenolico; Le laccasi sono prodotte da alcuni funghi WHITE ROT.
- Perossidasi: questi richiedono del H2O2 per ossidare Mn(2+) a Mn(3+). Le e due più importanti sono le Manganese Perossidasi e le Lignin Perossidasi. Hanno come gruppo prostetico il gruppo eme contengono il Fe. Nella lignin Perossidasi, l’H2O2 viene usato per ossidare mediatori redox organici.
Il H2O2 si forma grazie all’azione di ulteriore enizma ovvero la Glucoso ossidasi (ossida il glucoso) . Se si vuole indurre la sintesi degli enzimi appena visti dobbiamo utilizzare un co-substrato, il fungo deve essere coltivato in condizione aerobica e poi limitare le quantità di N.
Le ossidasi sono enzimi specifici nel senso che hanno uno spettro di azione ampio, ciò significa che agiscono anche diverse dalla lignina che presentano con esse una certa affinità strutturale: perché sono molecole di natura aromatica. Tra questi substrati abbiamo idrocarburi aromatici, molecole estremamente tossiche e cancerigene che purtroppo ci ritroviamo in quantita nell’ambiente perché prodotti di combustione parziale dei combustibili fossili.
APPLICAZIONI BIOTECNOLOGICHE
: la vaniglina (derivante dal conifero) è un prodotto a partire da un substrato fenolico, grazie all’attività di perossidasi. Un altro settore di impiego è rappresentato dalla produzioni di biocarburanti: ad oggi l’uso di questi carburanti, vuole costi elevati perché ci vogliono enzimi fungini idonei.
Un modo per studiare gli organismi senza creare colture e quello di fare riferimento alla genomica ambientale: si preleva un campione dall’esterno (suolo, acqua, tessuto..) che vengono analizzati e si cerca di identificare gli organismi presenti, andando ad analizzare RNA, DNA e proteine.
cellulosa avviene per via enzimatica; il motivo per il quale viene detto circoscritto è dovuto alle modalità di attacco.
BROWN ROT :
marciumi molli (carie quando rimane più secco) uno particolarmente famoso è il Serpula Lacrymans. Si insedia all'interno degli edifici poiché le fe tollerano l'estrema disidratazione. Secondo linee di frattura si spacca, carie cubica. Degradazione ossidativa di cellullose ed emicellulose (H2O2) lasciando inalterata la lignina. Nel caso delle cellulose c'è una differenza perché i funghi del soft rot vengono attaccati per via enzimatica. I funghi del brown rot procedono per via ossidativa e soprattutto non enzimatica. Producono l'agente ossidante cioè H2O2, che viene prodotto a seguito della degradazione della cellulosa.
WHITE ROT :
degradano tutte le componenti del legno. Sono gli unici organismi sul pianeta in grado di mineralizzare la lignina. Esistono anche alcuni batteri ( Attinomiceti ) che mineralizzano parzialmente la lignina. Svolgono un processo che ha caratteristiche particolari: la lignina si sviluppa come un reticolo tridimensionale che ricopre le altre componenti della parete cellulare. Si sviluppa come un reticolo tridimensionale costituito da acidi cinnamici. La lignina è una molecola idrofobica perciò