Filogenetica Molecolare

Il concetto di filogenesi → variazioni della sequenza del DNA, che ci permette di

andare, basandosi sull'analisi della sequenza del DNA, riusciamo a ricostruire la storia

evolutivi degli individui e delle popolazioni.

La filogenesi molecolare è una tecnica avanzata che ci permette di offrire le storie

evolutive di divere popolazioni partendo dalle analisi delle variazioni di sequenza

della struttura del DNA → DNA mitocondriale

La filogenesi può essere estesa a diverse molecole. Infatti oggi non si parla solo di

filogenesi ma di filogenomica , andando a comprendere tutta l'analisi del genoma . →

studio filogenomico

Grazie a questa tecnica possiamo costruire degli alberi filogenetici, di individui

appartenenti ad una specie, e mettere in evidenza le relazioni filogenetiche che ci

sono tra un individuo e l'altro.

Filogenesi molecolare ci permette di costruire alberi filogenetici andando a

comparare delle sequenze e mettiamo in evidenza le relazioni che ci sono nei diversi

individui. L'obiettivo è quello di costruire l'evoluzione di una specie di versi individui

appartenenti alla stessa specie.

Andiamo a definire un albero filogenetico che è un diagramma, un grafico della storia

evolutiva che viene dedotto da un gruppo di sequenze attraverso delle sequenze

ancestrali, che caratterizzano le basi del nostro albero.

Abbiamo una base dell'albero e dei rami che collegano differenti punti, che possono

essere chiamati nodi.

Come si può vedere nell'immagine c'è un nodo centrale e poi abbiamo dei nodi

esterni che sono l'estremità dei rami.

È come un albero; tanto è vero che i nodi esterni vengono chiamati anche foglie, per

ricordare la struttura di un albero. I nodi esterni sono le sequenze di campioni che

sto analizzando, da sequenze di popolazione attuale.

Invece i nodi interni sono le sequenze ancestrali, mente i rami sono dei segmenti che

collegano i diversi nodi, che possono essere interni o esterni. Quindi sul ramo

dell'albero ci sono le diverse variazioni che ci sono tra un nodo e l'altro. Questa è la

struttura classica di un albero.

Per arrivare a costruire un albero (il nostro lavoro è quello di studiare gli alberi

filogenetici), ci sono degli step da seguire.

• Si parte dal DNA, quindi devo avere un campione e vado a studiare una

popolazione umana facendo un cambiamento semplice, ovvero raccogliere la

saliva con diversi sistemi: con il cotton-fioc oppure facendo un risciacquo

boccale con il collutorio. In questo modo andiamo a recuperare le cellule di

sfaltamento mucosa-boccale che contengono il DNA che ci interessa.

• Poi utilizzeremo un estrattore che va a lavorare in maniera automatizzata per

purificare il DNA all'interno delle cellule. È un'estrazione di DNA genomico

totale.

- Dopodiché lavoro sul DNA mitocondriale → farò un'analisi mirata sul DNA

mitocondriale

• Dopo aver controllato l'estrazione se è avvenuta bene, farò una lettura sullo

spettrofotometro per avere la sicurezza di avere il materiale che ci interessa, e

poi vado