Biochimica generale - Appunti

Amminoacidi e proteine

Le proteine sono le macromolecole biologiche più abbondanti e presentano un’enorme varietà di funzioni; inoltre, sono il mezzo attraverso cui le informazioni genetiche vengono espresse. Le proteine sono polimeri di amminoacidi in cui ciascun residuo amminoacidico è legato a quello vicino mediante uno specifico legame di tipo covalente, chiamato legame peptidico. Il termine “residuo” indica la perdita di una molecola d’acqua quando due amminoacidi si legano tra loro.

Amminoacido

L’atomo di C è legato ad un atomo di H, ad un gruppo carbossilico, ad un gruppo amminico e ad una catena laterale R. Poiché è legato a 4 sostituenti diversi, si dice che il C è un centro chirale. Gli amminoacidi che costituiscono le proteine sono 20 e possono essere classificati, sulla base delle caratteristiche della catena laterale, in due grandi classi: gli amminoacidi polari e gli amminoacidi apolari, ai quali poi si aggiunge anche la classe degli amminoacidi aromatici.

Amminoacidi polari

Neutri / acidi / basici (sono idrofili cioè solubili in acqua, con la quale interagiscono)

• Serina (amminoacido polare – idrofilo – non carico) - Presenta come catena laterale un CH₂OH, dove questo -OH può sia generare dei ponti idrogeno con l’acqua, sia essere fosforilato.
• Treonina (amminoacido polare – idrofilo – non carico) - Presenta nella catena laterale un metile -CH₃, perciò tra serina e treonina, quest’ultima è leggermente più idrofobica, pur essendo sempre un amminoacido polare, quindi idrofilo. Anche in questo caso l’-OH della catena laterale può essere fosforilato.
• Cisteina (amminoacido polare – idrofilo – non carico) - Presenta nella catena laterale un gruppo tiolico -SH, perciò si dice che la cisteina è un amminoacido solforato. È un amminoacido importante perché 2 cisteine che si affacciano l’una all’altra possono ossidarsi e formare un ponte disolfuro, dando origine alla cistina.
• Asparagina (amminoacido polare – idrofilo – non carico) - È l’ammide di un amminoacido acido, ovvero l’acido aspartico (detto anche aspartato). Sia l’ossigeno (=O) che il gruppo amminico -NH₂ possono facilmente creare ponti idrogeno.
• Glutammina (amminoacido polare – idrofilo – non carico) - È l’ammide di un amminoacido acido, ovvero l’acido glutammico (detto anche glutammato). Sia l’ossigeno (=O) che il...