Metabolismo

appelli esame su prove intermedie

Principi di biochimica Nelson - Cox

• Macronutrienti = carboidrati
• grassi (oli)
• proteine

Carboidrati

Il principale carboidrato della dieta umana è l'amido, polisaccaride contenuto nei cereali, legumi...

La cellulosa è un polisaccaride ampiamente contenuto nel mondo vegetale.

Gli animali non possono degradarla perché non hanno gli enzimi cellulasi.

Le cellulasi sono tipici di funghi, batteri e microrganismi.

Glicogeno

Polisaccaride presente nella dieta umana è un elemento di riserva. L'uomo lo assume attraverso la carne. Il glicogeno è accumulato come polimero di riserva, nel muscolo scheletrico e nel fegato.

29/12/24

Chimica del carbonio

simbolo = C

numero atomico = 6

peso atomico = 12

isotopi: ¹²C, ¹³C, ¹⁴C

1s² 2s² 2p²

Lo orbitali quando il carbonio forma legami, perché il carbonio è ibrido sp³

sp²

sp

nella biomolecole non si trovano tripli legami

Configurazione e Conformazione

La configurazione è la disposizione spaziale degli atomi di una molecola.

L-ALANINA

La configurazione di una molecola è determinata dalla presenza di:

1. Eventuali doppi legami, attorno ai quali non c'è libera rotazione, questo origina ai cosiddetti isomeri.

acido maleico (cis) acido fumarico (trans)

20 α-amminoacidi

Tutti questi aa sono nella configurazione L.

Alcuni amminoacidi hanno più di un centro di asimmetria:

• Treonina (Thr, T)
• Isoleucina (Iso, I)

9 di essi hanno catene laterali non polare (o idrofoba):

• Glicina (Gly, G)
• Alanina (Ala, A)
• Valina (Val, V)
• Leucina (Leu, L)
• Isoleucina (Ile, I)
• Metionina (Met, M)
• Prolina (Pro, P)
• Fenilalanina (Phe, F)
• Triptofano (Trp, W)

6 di essi hanno catene laterali polari, che non presentano cariche a pH fisiologico:

La composizione amminoacidica può essere espressa in:

• termini assoluti
• termini percentuali
• termini ponderati

apoproteina → parte proteica

gruppo prostetico → parte non proteica legata alla catena polipeptidica

legame covalente → legame C-N

La struttura secondaria si riferisce agli aspetti conformazionali di tratti ben definiti e generalmente limitati, dello scheletro polipeptidico

Nelle proteine globulari prevalgono le α-eliche. Nelle proteine fibrose prevalgono le β-foglietto.

α-elica destrorsa: quando procedendo dall'estremità N-terminale verso quella C-terminale l'avvolgimento avviene in senso orario.

Lo ju senso auttiorario → α-elica

VEDERE STRUTTURA MIOGLOBINA

La mioglobina è costituita da 8 α-eliche

Se i tre atomi coinvolti nel legame a idrogeno sono nella stessa direzione, il legame a idroa sarà "più forte".

Significato di anfipatico

EC 3.4.17.1

3 -> è la classe (Va da 1 a 6)

4 -> è la sottoclasse

17 -> è la sotto-sottoclasse (gruppo accettore)

1 -> è il numero nella sotto-sottoclasse (molecola su cui agisce)

Classi di enzimi:

1. ossidoreduttasi
2. transferasi -> Trasferisco i gruppi funzionali
3. idrolasi
4. liasi
5. isomerasi
6. ligasi

Teoria dello stato di transizione

In questa reazione H_C deve avvicinarsi alla molecola di idrogeno in modo che ad un certo momento si realizzi la formazione di un complesso instabile

H_A + H_B + H_C → H_A + H_B-H_C

GRAFICO DI REAZIONE (domanda d’esame)

G: energia libera

coordinata di reazione

in questo caso ΔG = 0, perciò non c’è rilascio di energia

significa che il livello dei reagenti è uguale a quello dei prodotti

Il massimo della curva è uguale all’energia di attivazione

L'attività enzimatica è pH dipendente

La regolazione dell'attività catalitica degli enzimi può avvenire mediante:

1. il controllo della disponibilità degli enzimi.
2. il controllo dell'attività enzimatica.

Nelle vie metaboliche vi sono due classi di enzimi regolatori:

1. I classe: comprende gli enzimi allosterici.
2. II classe: comprende gli enzimi covalentemente modificati.

La fosforilazione e la defosforilazione di particolari residui amminoacidici della catena polipeptidica dell'enzima.

È meglio avere sullo stesso enzima più residui regolatori.

11/4/24

Carboidrati - tante molecole d'acqua quante sono gli atomi di carbonio

C_n(H₂O)_m

Sono i composti biologici più abbondanti sul nostro pianeta.

L'ossidazione dei carboidrati

mono - oligo - poli - SACCARIDI1 unità 2-10 unità 100 unità

Funzioni chetonica ed aldeidica sono i più importanti nei carboidrati.

I monosaccaridi con più di 4 atomi di carbonio tendono a formare strutture cicliche.

Gli oligosaccaridi sono formati da una corta catena di unità monosaccaridiche legate tra loro da legami glicosidici.

Acetalico - reazione R-OH con aldeide

Chetalico - R-OH + chetone