Biologia molecolare

Le altre aggiunte nella sequenza. Un'altra particolarità dei procarioti è che il tRNA per la formilmetionina entra direttamente nel sito P, anzi nell'emisito P (nella regione della subunità 30S che andrà poi a formare il sito P nel ribosoma intero). Il corretto legame tra ribosoma e RNA dipende dalla sequenza di Shine-Dalgarno, che si trova all'incirca 5-10 nucleotidi prima del codone di avvio e che rappresenta il sito di legame dei ribosomi all'mRNA (ciascun AUG avrà la propria sequenza di Shine-Dalgarno dato che si parla di mRNA policistronici che codificano per varie proteine) e inoltre sono necessari 3 fattori proteici (IF1, IF2 e IF3) che interagiscono con la subunità minore del ribosoma e sono necessari per la formazione del complesso d'inizio 30S). Anche negli si ha la formazione di un complesso tra la subunità minore del ribosoma, mRNA, eucariotitRNA di inizio ma la metionina non viene formilata anche se

subunità 60S tutti i fattori vengono rilasciati tranne eIF4F che rimane legato al cap pronto per interagire con un nuovo complesso di inizio (a partire dallo stesso messaggero vengono sintetizzate più proteine)

2. avviene la formazione del legame peptidico tra gli amminoacidi = un tRNA che porta il ALLUNGAMENTO à peptide si trova sul sito P e un tRNA associato al proprio aa sta arrivando al sito A, se l'appaiamento codone-anticodone è giusto si forma il legame peptidico con il resto del peptide che era sul sito P e quindi il peptide in crescita è ora sul tRNA del sito A, avviene poi la traslocazione del mRNA che porta allo spostamento del tRNA che non ha più l'aa attaccato nel sito E, il tRNA con attaccato il peptide passa nel sito P e il sito A è pronto per l'ingresso di un nuovo tRNA

3. = quando il ribosoma raggiunge un codone di terminazione (UAG, UAA, UGA) la traduzione TERMINAZIONE si conclude e il polipeptide viene

rilasciato infatti non esistono tRNA con anticodoni per i codoni di stop che vengono invece riconosciuti dai fattori proteici di terminazione RF; nei procarioti il fattore di rilascio RF1 riconosce UAA e UAG mentre RF2 riconosce UGA e UAA mentre negli eucarioti c'è un solo fattore che riconosce tutti i codoni di stop (eRF1), gli RF inducono l'idrolisi del peptide dal tRNA direttamente oppure indirettamente provocando un cambiamento strutturale del ribosoma che a sua volta idrolizza il peptidil-tRNA lasciando però intatto il complesso tRNA/mRNA/Ribosoma che poi viene disassemblato ad opera del fattore di riciclaggio del ribosoma (fattore RRF) nella fase di post terminazione.

in cui si ha la dissociazione dei tRNA, mRNA e delle subunità ribosomiali.

POST TERMINAZIONE

REGOLAZIONE DELLA TRADUZIONE

Esistono numerose proteine regolatrici che impediscono temporaneamente l'attacco dell'mRNA ai ribosomi oppure si legano direttamente al messaggero impedendone

La traduzione (inoltre anche i miRNA hanno un ruolo importante in questa fase in quanto il loro aggancio al mRNA può portare al blocco temporaneo oppure alla degradazione del messaggero infatti stabilità ed emivita del mRNA è un fattore importante perché il suo tempo di sopravvivenza influisce sulla quantità di molecole proteiche che vengono prodotte) e sono importanti anche i che sono un'ampia classe di piccoli RNA microRNA (miRNA) non codificanti (21-25 nucleotidi), a singolo filamento che regolano l'espressione genica a livello post-trascrizionale inducendo la degradazione di specifici mRNA target impedendo la trascrizione a proteina e l'impedimento può essere temporaneo o definitivo, è stato visto che sono implicati anche in diverse patologie cardiovascolari, neurologiche, nell'obesità, diabete e cancro (possono essere utilizzati come marcatori per la diagnosi precoce) e il loro equivalente sintetico utilizzato.

sono generati da precursori più grandi (miRNA primari), sono trascritti dalla RNA pol II e maturati a livello del nucleolo da complessi proteici denominati DROSHA (nucleo, rimuove sequenze extra al perminale 5' e 3' del miRNA primario e genera una struttura a forcina) e DICER (citoplasma) per poi essere assemblati in un complesso chiamato RISC (sofisticato meccanismo di silenziamento genico e le proteine della famiglia "argonauta" sono una componente fondamentale e conservata del complesso con attività endonucleasica diretta contro molecole di RNA che hanno sequenza complementare a quella contenuta nel RISC degradano la sequenza a cui il RISC è omologo, degradando mRNA bersaglio o bloccandolo).

Ogni miRNA può avere più di un bersaglio e possono agire in due modi a seconda della complementarietà tra il miRNA e il target:

1. complementarietà imperfetta bloccano temporaneamente l'espressione dei geni target;
2. complementarietà perfetta degradano mRNA bersaglio o bloccandolo.