Concetti Chiave
- La serina è simile all'alanina ma con un gruppo ossidrilico; a pH fisiologico è protonata e può essere deprotonata a pH più alto.
- La treonina è una serina metilata e, insieme ad altri amminoacidi con gruppi ossidrilici, può subire fosforilazione post-trascrizionale.
- Cisteina contiene un gruppo sulfidrilico che le permette di formare ponti disolfuro attraverso ossidazione e riduzione reversibile.
- Prolina è un amminoacido ciclico con una catena idrofobica che si lega al gruppo alfamminico, contribuendo a strutture peptidiche specifiche.
- Aspartato e glutammato sono amminoacidi polari con cariche negative a pH fisiologico, e partecipano alla formazione di cariche elettrostatiche e alla catalisi.
• serina*: un alanina con al posto di H un gruppo ossidrilico; ha pKa di 10, a pH fisiologico lo scrivo protonato, (a pH 12 per esempio sarebbe deprotonato) (gruppo ossidrile)
• treonina: un alanina con al posto di H un metile, è una serina metilata (questa con gli altri aminoacidi che hanno gruppo ossidrile vanno incontro alla fosforilazione in fase post trascrizionale) (gruppo ossidrile)
• cisteina*: una serina con un sulfridrile al posto dell'ossidrile; ha la capacità di ossidarsi e ridursi reversibilmente; forma ponti disolfuro, legami covalenti tra due cisteine instaurati tramite ossidazione (zolfo)
• prolina: ha catena idrofobica che si ripiega andando a legarsi col gruppo alfamminico; è l'unico amminoacido ciclico, imminoacido; insieme a glicina sono gli amminoacidi conformazionali, conferiscono determinate strutture a determinate sequenze peptidiche
• asparagina: un acido aspartico con un gruppo amminico al posto dell’OH finale
• glutammina: un acido glutammico con un gruppo amminico al posto dell’OH finale
Polari carichi negativamente (acidi, deprotonati a pH fisiologico)
• aspartato/acido aspartico*: una alanina con al posto di H un gruppo COOH
• glutamato/acido glutammico*: un aspartato con un CH2 in più
Hanno pKa attorno a 4, partecipano alla formazione delle cariche elettrostatiche; spesso partecipano alla catalisi
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