Trascrizione DNA e rimodellamento della cromatina

Trascrizione degli RNA

Il DNA non può portare l’informazione che contiene fin dove serve. Il riscrivere le sequenze deossiribonucleotidiche in sequenze ribonucleotidiche viene detto trascrizione e l’RNA è il trascritto. L’RNA può svolgere anche altre funzioni non strettamente legate alla sintesi proteica (es. interviene nella compattazione della cromatina).

Processo di trascrizione

La crescita della catena polinucleosidica avviene ad opera dell’enzima RNA polimerasi, che scorre dal 3’OH al 5’P in direzione 5’P -> 3’OH e i nucleotidi adoperati saranno nucleosidi trifosfati in 5’ (ATP, GTP, CTP, UTP, dove A, G, C, U stanno per adenosina, guanosina, citidina e uridina). Delle due eliche di DNA ne viene trascritta solo una, che funge da stampo e che contiene l’informazione. Tuttavia, un filamento può essere trascrivente in un tratto e non trascrivente in un altro, perciò la parte trascritta (gene) deve contenere segnali di inizio e fine trascrizione.

Promotore: sito del DNA dove si lega la RNA polimerasi prima di iniziare la trascrizione. Poiché si sintetizza una molecola di RNA complementare allo stampo, per convenzione si legge il filamento non trascrivente del DNA sostituendo alla T la U in direzione 5’->3’. La velocità di trascrizione è 10-15 volte più bassa di quella di duplicazione, pertanto è possibile che gli enzimi preposti ai due compiti collidano. Per preservare la trascrizione, la forcella di replicazione passa attraverso l’apparato di trascrizione senza spiazzarlo, mentre esso riprende l’attività dopo un momento di pausa.

Trascrizione nei batteri

L’RNA polimerasi è costituita da 4 subunità che ne formano il core o apoenzima e sono: due subunità alfa, una beta e una beta’ (“beta primo”). La molecola completa, o oloenzima, comprende anche la subunità sigma, che lega l’enzima ai promotori e si dissocia successivamente all’inizio della trascrizione, che viene continuata dall’apoenzima. Le subunità sigma sono specifiche e individuano singole classi di promotori (diversa sigma -> diverse classi di promotori).

I promotori (batterici) sono costituiti da due sequenze definite -35 e -10, in base alla loro posizione rispetto al punto di inizio +1. La regione -10, detta TATA box o Pribnow box (promotore), è ricca di A – T e questo facilita l’apertura della doppia elica. L’inizio della trascrizione avviene al nucleotide +1 rispetto al promotore. Le zone ricche di C – G provocano rallentamenti detti pause, per via dei 3 legami idrogeno tra C e G.

I siti di terminazione sono formati da sequenze palindro...

[Testo troncato per incompletezza nell'origine.]