Biologia molecolare

Presentano più substrati per attivare un tipo di via specifico, la Mapk porta all'aumento della trascrizione per determinati geni. Dipende poi da quali delle 13 Mapk viene attivata per specificità ad alcuni geni, solitamente trascrivono per fattori trascrizionali. I geni pari di fattori di trascrizione possono inoltre essere regolati tramite la conformazione dell'acromatina, controllo quindi la trascrizione di fattori trascrizionali. STE11 è una chinasi a più substrati con effetti diversi a seconda della Mapk che va ad attivare, lo switch è determinato dalla proteina scaffol che mette in ordine i protagonisti della cascata. La stessa STE11 in base allo scaffol dal quale viene reclutata viene avvicinata a membri diversi della cascata con sviluppi differenti e specifici, il tutto avviene per aumento delle concentrazioni locali. Il sito di attracco può essere usato in diversi modi, può anche legarsi una proteina adattatore, serve per

avvicinare proteine puntando sulla concentrazione locale, permette alle proteine di interagire con il loro substrato, è importante non solo la quantità proteica ma anche la sua localizzazione. Per dare specificità troviamo quindi: scaffol, adattatori e proteine impalcatura. Ci si chiede però come faccia Ras a dare una specificità se indipendentemente dalla chinasi le vie confluiscono su questa proteina: prima di tutto Ras fa parte di una famiglia con tipologie di ras diverse, dipende poi da quale MAPK viene utilizzata. Ricordiamo che a valle dipende anche da una regolazione della cromatina. Esistono poi proteine e fattori presenti nella cellula che dipendono da molte altre vie.

Le cellule C12 differenziano in neuroni per NGF, sennò proliferano per LGF. È stato osservato che per una stimolazione più alta e più prolungata nel tempo tramite LGF, c'è una proliferazione ma tendono poi comunque a differenziare in neuroni anche.

posizione 3 definendo il 3,4difosfato. Questa nuova posizione 3 fosforilata viene riconosciuta da dominispecifici PH. In membrana adesso è aumentata la concentrazione difosfatidilinositolo e tutte le proteine che sono in grado di legarlo si attaccano orain membrana. C'è attivazione di PKB: è una chinasi ed è normalmente inattiva, ildominio PH lo mantiene in forma non attiva. Quando si attacca moltafosfatidilinositolo 3 fosfato troviamo PDK1 che ha un dominio PH compatibile. PKBè quindi substrato per PDK1, viene fosforilato passando in una forma parzialmenteattivata, con una seconda fosforilazione da parte di PDK2 avviene l'attivazionecompleta. Queste proteine si trovano tutte quante in membrana attivate dallafosfatidilinositolo3fosfato. Il complesso PKB-PDK1 rende PKB un substrato perPDK2 che non va però in membrana. Pten(correlato con l'apoptosi) con ilpassaggio PIP3-PIP2 rimuove il fosfato da PIP3.UTRS: sono molto

importanti nell'ambito della regolazione, il coding contiene la porzione da trascrivere ma è UTR che decide come, dove e quando; è quindi estremamente importante a livello regolatorio. Macroscopicamente 3' regola l'instabilità del trascritto, evita la degradazione; un trascritto stabile porta a un'alta quantità di proteina, non necessariamente serve quindi molto Mrna. Se produco poco Mrna (meccanismo regolato da 5') ma è stabilizzato molto bene da 3' posso comunque ottenere una buona quantità proteica. Viceversa se produco molto Mrna ma questo è instabile ottengo scarsa produzione proteica. Esiste poi un livello post-trascrizionale ed è qui che è importante 5'UTR, definisce più o meno traduzione; ecco quindi che UTR può comportare grandi differenze nel risultato finale. La regione 3'UTR serve anche per la localizzazione subcellulare, definisce una concentrazione asimmetrica di mRna che

porterà a un disequilibrio nel livello proteico a parità di traduzione. La subunità minore del ribosoma svolge e scansiona fino a trovare alcune sequenze stabili e riconoscibili dove riconosco AUG a monte e a valle (KOZAK). Il complesso si assembla, scansiona AUG e sviluppa l'apparato di traduzione. 5'UTR è quindi molto importante (i siti di binding si trovano nella struttura primaria). Rispetto al DNA, l'RNA presenta filamento singolo molto leggero e flessibile, tende ad avvolgersi facilmente e creare interazioni con sviluppo di strutture secondarie. Nel momento in cui il ribosoma si trova di fronte ad un airpin ha bisogno di energia libera per stirarlo, può non esserci problema oppure la traduzione può subire un brusco rallentamento o uno stop; è mediata da UTR e da alcune proteine associate. Sul Cap si assembla il complesso 4F, fattore di inizio formato da più molecole, in base alla completezza del complesso e dei