Appunti di Biochimica: mappe concettuali digitali a colori

APPUNTI DI BIOCHIMICA

PRIMA PARTE: proteine di trasporto, introduzione al metabolismo, metabolismo degli zuccheri

fonte: lezioni del professore PROTEINE

FUNZIONI PROTEINE Tt

DELLE strutturali

\

i.

AÌTICORPÌROTEINE

d. ordinari .

PROTEINE

PROTEINE

Enzimi DI

di DEPOSITO

TRASPORTO

CONTRATTILI

↳ proteine possiedono

Molte funzione

la

essenziale

•

UN' proteica

UNITÀ per

non

d ↳ associati .

permanentemente

Lipoproteine Gruppi

→

FOSFO PROSTETICI

proteine

GLICOPROTEINE

F. PROTEINE

ME - ?

proteine

Flavo a

→ s ,

METALLO proteine alla

MIOGLOBINA molecolari

principi

studio

ed base

dei

→

EMOGLOBINA del PROTEINA

reversibile

legame LIGANDO

-

lo esistono { dovuti

protegge

NEUROCLOBINA i da

anche neuroni danni

non attacchi ischemici

ipossia

CITOCLOBINA e

a La

↳ monomeriche presente retina

cervello

in

} ,

Mb

come altri fluidi

e

idrofobi che

sono

all' interno

↳ le globine compatte

estremamente

sono per

idrofobi

delle

via interazioni che

laterali

catene

tra

globine

delle

Ruolo

La ossigeno AA

gli

lega

non

→

La legato

tendenza metalli

ad da di

essere

transizione stato ossidativo più basso

nello ferie cui

→

↳ l' portato

evoluzione Fei

ha ad essere

.

inserito nell' eme ↳ libero

Allo forma

stato

Ros

Fest e )

6

necessario un

proteico

complesso

EME É

gruppo prostatico

↳ :[

il ÷

:p

: La legami

6 coordinazione

di

{ EME

4 con

liberi al piano

t di eme

2 → CH

CH

/ e INH

In Fe

NH N

?

← : 1

→ :

= -

I / i c Cha

- -

fecit CHE

- Che ISTIDINA

piano

ISTIDINA dell' DISTALE

eme

PROSSIMALE FERRO non

IL

legarsi

può

02

→ DEVE OSSIDARSI

feat

solo a ↳ di

impedito dagli '

e

Hys

N di

⑧ arietta tetrapirrolico

la dell' dell' fornire

funzione azoto è

io ferro

elettroni al impedire l' ossidazione

per

↳ ( )

istidina fenilalanina

distale insieme

l' Cde

velina f. 11 e

a

permettono che trovi tasca

si

02 idrofobia

in una

di protezione

questi forniscono

AA una l'

sferica ossidazione

impedire

per

legame ligando

il

con

-1

-

] =P

t PSO

affinità di

pendenza

saturazione =

→ =

quantità di ligando necessaria

la

0,5 - valido Mioglobina ed

per

→ sub unici

enzimi mono

s

° -1 p

i LO

pso

o 30

poz Hb

no

( torri

↳ lo della mioglobina rilascia in

02

è solo di

scopo caso

→

mantenere legato necessità

elevate

02 LO

↳ Mboz

presenta

si NEL

MAGAZZINO Oz

di

come Tessuto muscolare

Evoluzione Mb Hb portato

dovuto duplicazione ha

di che

genica

a

na

e indipendenti

linee di evoluzione

due

a

lo

( )

.

.

. hanno solo

residui

il 18% di

identici Orba 0282

e

µ

ho formata

emoglobina

l' da

è adulte

Tipologie

due 2

S →

→

uguali

catene fetale

1

coppie →

a embrionali

2 a

↳ ruoli dell' emoglobina ↳

6 da rilascio

trasporto e

legare legare di

CO2 no inibizione

vasodilatatore

02 polmoni

nei Ht nei ↳

e e

) dell' aggregazione

tessuti piastrinica

↳ trasporto e

polmoni

trasp

ai ai

tessuti . ↳ dalla

permessi

cooperativi ti delle

↳ strutti subunità

enzimi a

ALLOSTERICITÀ → quaternaria ↳ quattro subunità Unite

globulari

{ interazioni

da covalenti

non

subunità

ogni { )

( Hb

dalle altre POSITIVA

dipende TÀ

cooperativi es

→ NEGATIVA

'

attacco

l' all

↳ di Oz di

eme

subunità altre legheranno

modificazioni le

una provoca •

conformazionale nelle facilmente

02

altre più

↳ concertato è

il modello un

modello sequenziale

limite del

caso

↳ Perutz R

meccanismo di T Ed

STATI

-0

( )

.

.

.

{ d (

)

( tesa )

affinità emoglobina

T deossi

02 rosso

→ scuro

→ (

( ) )

R affinità

T

rilassata brillante

ossiemoglobina

02

no rosso

•

{ t legare Hb

stabilizza

pH 02

sa •

I stabilizza

pH desssittb

rilasciare 0

co •

,

(

Effetto )

Bohr → .

. .

Ruolo inibitore

della enterotropico legame

CO2 il

→ per

→ Hb

negativo 02

-

d. l' affinità

abbassa l' 02

per la

← formazione

Formazione carbammati

di di

bicarbonato

↳ effetto R

Bohr NH COOH

-

-

Hsot

degli Lo deossittb

stabilizza

attaccandosi agli catene

delle

terminali

N -

bi fosfoglicerato tropica

D- inibitore

2,3 antero

• - → negativo CO2

come

hot altitudine La BPG hanno

CO2 meccanismi

e

=

T [ differenti

]

BPG e convengono

} l'

permette ossigenazione T attitudini

dei L

tessuti por es

con o

→ . patologiche

cond .

Metabolismo

↳ METABOLICHE

PRINCIPI VIE

DELLE ha

!

← METABOLICA CATABOLICHE

LE METABOLICHE OGNI vie

VIA LE

VIE PRIMA E

HA ANABOLICHE

UNA

irreversibili sono

sono di

Tappa comando DIFFERENTI

↳ il sistema in

è

EQUILIBRIO DINAMICO OMEOSTASI DEGLI

co mantenuti

INTERMEDI METABOLICI a

→ costante

cono .

REAZIONI BIOCHIMICHE COMUNI

↳ TIPOLOGIE formano

che

reazioni C

legame

1- C

spezzano

o un -

↳ aldolica Claisen

condensazione condensazione di

es ,

.

2- reazioni arrangiamenti isomeri

di

ri

con

3- liberi

radicali

reazioni con POI

trasferimento

4- -

di di

reazioni gruppi spesso

→

5- di ossidoriduzione

reazioni FOSFORILATI

COMPOSTI due

le altre sono :&

:

biliari :

la

ENERGIA intercorrenti

irreversibile

è

AD prima

ALTA •

ma

fosfoc.no/piruvztoadl=-62hVm " } intermedi

glicolisi

della

1,3 bifosfogliceratoos.ge 494mmol

-

- 4)

Fosfo creatina lmol

DG 43

→ = -

AD INTERMEDIA

ENERGIA d ENERGIA

SINTESI QUELLI ED

a

DI

ATP 30

DG / mol '

4) TEN

SINTETIZZATO QUELLI ad

DA

e

non →

= - .

↳ { f.mfn.to tessuto muscolare

Acetil 31,4 uno ,

da

CoA altri tessuti

↳

→ •

- -

.

. ↳ perchè

dell' favorita

l' è

ATP molto

idrolisi DG !

C-

nella cellula ADPJ so )

[ ] [ 65

»

ATP -

no : - '

mo

La poi ]

[

[ AT =

bassa

A energia

fosfato

6 kslmol

DG 13

glucosio → =

- -

- fosfato

glicerolo 3 -

-

ciclo ADP ATP

- { rotori ATP

i

= .

↳ { fadp

]

)

( Atp

carica +

= 100%

ENERGETICA AMP

0 →

=

] ]

[ [

Atp AD camp

+ + ha fisiologicamente

µ = 0,80 0,95

-

costante equilibrio tra

→ anabattismo

catzbolismo e

6

Amp

da

Attacchi '

nucleofili sull ATP

i 7 ①

i

P P

P

o o o

o -

- - -

-

- _

b- b-

b-

µ \

µ

attacco

attacco attacco

B

8

in in

in a }

to

à

sintesi attivazione

Formazione dei

di

es es es

. .

.

da

GGP carbossilici

ribosil IPP

ATP di

gruppi

SP

di -

- grasso

2C

un .

TRASPORTATORI GLUCOSIO

DEL placenta

eritrociti

GLUT ubiquitario presente

1 in BEE

unico

a a , ,

LA Te T2

conformazioni

ESTERNO INTERNO

DA A a ,

fegato

intestino affinita

bassa '

GLUT 2 reni →

→ , ,

la sensibilità del

B

al

la

conferisce alle

glucosio cellule pancreas

alta testicoli

cervello

GLUT affinita

'

3 → → ,

6

GLUT SEGNALE

RISPOSTA

INSULINA SI

sensibile IN

all'

ma ma AL GLICEMIA

LA

"

att Abbassa

E

"

↳ /

normalmente vescica

segregato

è in e ↳ t adiposo

muscolo cuore , .

,

testicoli

intestino

5

GLUT TRASPORTA fruttosio

→ rene →

,

, NHZ

NHÌ o '

"

" CXNH

P

NH

CH 'è

-

N -

C n

CH

o

- →

-

- - - } -

} t

l t - Coo

Coo O -

-

CREATINA FOSFATO

ha poi _ formare fonte

forni ADP ATP energia

di i

per na

se per

a secondi di

primi

tale scorte di ATP fisico

esercizio

interviene

diminuiscono subito il

poi

→

metabolismo energetico

? -1

Mg -12,54 )

ATP /

Per mot

ADP ( DG

→

→ +

+ r =

te

( la CREATINA CHINASI

ha la nella cellula

energetica

carica metabolismo

determina il '

{ "

f" 2<00

200 ' Han

i Atp

Adp ,

✓

N

NH C

P CH CH

C N

- '

- reazione

- }

- -

- e

La

☐ } -

> →

/ ALCALINIZZANTE E

|

I µ tamponare

creatina può

[ ,

µ DELL'

l'

µ esercizio

g- acidosi

chinasi ( ) intenso

k

( ( r

P ( necessita schel

ha la {

MM rom .

✓ dimero .

di Mgz -1 Mb cuore e

a cervello

sintesi fegato

della creatina anche intr

in con

rene

e

→ sa .

la dieta

↳ partire

a { }

¥

da cucina

la guznido acetato

AMIDINO TRANSFERASI

, a ornitina

Meli + )

CH }

↳ )

( adenosil

S metionina

SAM

cambi

- Creatina

REGOLAZIONE A poi subisce ←

fosforilazione

/ le Sang

FEEDBACK agisce

NEGATIVO +

su

→ ,

fasi

prime S-adenosil

omocisteina

ubiquitario

ADENILATO CHINASI → ZADP AMP

ATP

= +

a ↳ no

sintesi chinasi

fosforilazione del

di livello mio

a →

scheletrico

nel

substrato

dna DNA m

e .

i. ho la favorita segnala

quando

è

reazione AMP

→

fosforila nucleosidi ' la

ATP

necessario carenza

e

fosfati di ATP

mono

VIE TRASDUZIONE DEL

DI SEGNALE 16103

LEZIONE

→

La MOLECOLA RECETTORE

DI +

SEGNALAZIONE SPECIFICO

del 1110s

18:31

appunti

37 438

pop

402 libro

439

P

GLUCONEOGENESI ( )

REVERSIBILI corrispondono

REAZIONI

10 reazioni 7

a

non REV

7

ALLE GLICOLISI

DELLA

.

L ↳ irreversibile

complessivamente ,

irreversibili la glicolisi

reazioni come

della gluconeogenesi a-

1 •

⑧

① ①

Fosforilazione

de

di defosfori

conversione /

del azione

Fruttosio Fosfato

bifosfato del

piruvato fruttosio

in -1,6

PEP 6-

- -

)

( da ossalacetato

passando d

to

di FRUTTOSIO GLUCOSIO FOSFATASI

-1,6 G

-

- -

PIRUVATO BIFOSFATASI

CARBOSSILASI

PEP CARBOSSICHINASI

La sintesi glucosio partendo

di convertibili

altri

lattato intermedi composti

da piruvato e

→

,

, questi

del in

Krebs

di

ciclo glucosio

↳ AVVIENE IN per

→

LATP

richiede 26T ? ZNADH cervello

{ {

FEGATO

→ , , muscoli

reni eritrociti

TENUE

int .

gli

convertire

mammiferi glucosio

acidi grassi in

i

→ possono

non

lo acetil-Coa

il piruvato

da

passaggio

avviene

non a

la sintesi

glicerolo intermedio di

per

→ )

fosfato (

triacilgliceroli adipociti

/ monofosfato

gluconato '

Fosfo / dell

del esosi

DEL

VIA pento FOSFATO

sia o nelle biosintesi

attivi

tessuti

↳ { contrasta Ros

effetti

NADPH dei

gli

produce → esposti all' ossidazione

→ o eritrociti

( )

cristallino

cornea e

,

ribosio S pro NADH a

ATP FADH

DNA coenzima

RNA

-

- ,

, ,

,

, ,

↳ rapidamente

cellule dividono

che si

difetto genetico di GLUCOSIO GP

Favismo DEIDROGENASI

→ - -

FASI

2

→ ossidativa

1 ?

FASE A se non ossidativa

6 lo

pentosio pentosi fosfato

fosfato ricicla

produce i

glucosio GP

NADPH in

e -

↳ da TIAMINA

glucosio 6 fosfato pirofosfato

6 pon

PD

G deidrogenasi

→

' transchetslasi TPP

→

.

lattamasi )

( cofattore

' transaldolasi

-

Fosfo

6- deidrogenasi

gluconato

- - b

Fosfopentosio inter conversione degli

isomerasi zuccheri

' 3,4 6,7 C

5

a

b. po

,

.

6

decarbossilazione

ossidazione molecole molecole

S di

di

e →

pento

dal P P

del del

Ct ↳ passando sia esosi

GGP o

go.r.osr.ogiuc.no/aHone - -

riduce NADP + produce

NADPH e

a

ribosio SP

-

l' GGP pentosio fosfato

del nella nella

ingresso del

via

→ o

{ ] /

determinato

glicolisi ]

[

da NADP

è -1 NADPH

EEYEE.me

Regolazione Metabolica

3 parametri

ANALISI DEL METABOLICO

CONTROLLO → (

① Coefficiente )

controllo

di del C 0

flusso può

0 1

→ essere <

no -

↳ contributo di ciascun flusso dipende dal

al sistema

enzima → t

Coefficiente T

E

② elasticità

di -4

O conc

a

→

→ → .

La ]

regolatore

[ metabolita

risposta /

b.

di enzima a

un

③ R

Coefficiente R

di risposta C E

→

a = .

la fattore

del flusso seguito esterno

variazione in un

a

aumentare prodotto

di

il flusso necessario

è

per un

→ tutti coinvolti

gli nella

aumentare

i. via

enzimi

{ T / la

controllo →

REGOLAZIONE di

→ (

glutatione catalasi

che

enzimi ,

richiedono di lipidi

NADPH FAS sintesi

,

no sintasi

µ

e. µ #

i.

↳ si

.

.

NADPH ossidasi DETOSSIFICAZIONE

ma

cyt ossidoreduttasi

450

p

- proteine diverse

REGOLAZIONE che

COORDINATA DI ISOZIMI →

catalizzano stessa

la reazione

GLICOLISI GLUCONEOGENESI

E

↳ u