Amminoacidi - completo

2 - AMMINOACIDI

Hanno su C_α un gruppo amminico

G. AMMINICO

• CH - COOH
• R

Questi sono monomeri di proteine, più importanti amminoacidi

Formula Fisher

NB: orizzontale: VS noi, verticale: VS dietro

CHIRALITA' - L

Quelli naturali - quasi tutti 2 amminoacidi solo L

Hanno uno stereocentro

Supultimo C

NH₂ si trova a SX, fa ruotare a SX il piano di luce polarizzata

Configurazione S/R

In generale hanno configurazione S, ma 2 eccezioni

1. GLICINA

non c'è centro chirale, 2H no S/R

2. CISTEINA

COOH

• 2 direzione da R

S -> R

Unico amminoacido (R)

Zolfo più elettronegativo di OX

2 - AMMINOACIDI

Hanno su Cα un gruppo amminico

Questi sono monomeri di proteine, più importanti amminocacidi

NH₂CH - COOHR

G. Amminico

Formula Fisher

NB: Orizzontale : US noiVerticale : US dietro

COOHHNH₂R

Chiralità - quelli naturali

Quasi tutti L amminoacidi solo L hanno uno stereocentro

Curarù

Lelo gira

Configurazione S/R

In generale hanno configurazione S, ma 2 eccezioni

• Glicina

NH₂HR

Non c'è centro chirale, 2H no S/R

• Cisteina

NH₂HCu₂SH

S → RUnica amminocido R

Zero Pu elettronegativo di OX

2 Amminoacidi con 2 centri chirali

• Isoleucina
• Treonina

1 Amminoacido non ha ammina 1°

Prolina

Classificazione

• Neutri
• Acidi
• Basi

Catena apolare

• Valina
  • VAL
  • V
• Fenilalanina
  • PHE
  • F
• Alanina
  • ALA
  • A

H₂N

• METIONINA
• MET
• M

H₂N

• LEUCINA
• LEU
• L

CATENA POLARE

H₂N

• ASPARAGINA
• ASN
• N

H₂N

• GLUTAMMINA
• GLN
• G

H₂N

H₂N

• SERINA
• SER
• S

ACIDI

• ACIDO ASPARTICO
• ASP
• D

• ACIDO GLUTAMMICO
• GLU
• E

BASICI

• ARGININA
• ARG
• R

• LISINA
• LIS
• K

• ISTIDINA
• HIS
• H

IN SPL BASICO PERCHE' E' DISPONIBILE

IN P, IN ANELLO

Acidità d- carbossilici

Il loro valore medio è circa pKa ≈ 2

che è molto più forte di acido metilico pKa ≈ 4,7

Perché?

Effetto induttivo elettro-attrattore con oi NH₂ ⇒ stabilizzano anione

Acidità d- ammonio

pKa t-ammonio → pKa ≈ 9,47

Inferiore a valore medio di ioni ammonio primari alchilici

pKa ≈ 10,76 (acido più forte)

• Atomi ossigeno esercitano effetto induttivo elettro-attrattore
• Rende più probabile che esso ceda un protone tornando NH₂

Zwitterioni

COOH → COO^-

NH₃⁺

A pH ≈ 7 fisiologico

Reagiscono tra loro

Sale interno

Ione dipolare

Non ha carica netta

A forte COOH

B debole COO^-

H₃N⁺

BI forte

A debole

PK ≈ 2 PK ≈ 9

Posso variare

Zwitterioni esistono nel punto isoelettrico

Può corrispondere al pH in cui appare forma zwitterionica

PI = PKa_COOH + PKa_NH3⁺

PI

Ambiente acido

pH < PI

Carica netta

pH > PI

NH₃

Carica netta

Ambiente basico

CON H₃O⁺

TRATTO CON ACIDO FORTE Olimito carica ¹⁺forma cationica

CON NaOH

TRATTO CON BASE PRENDE CARICA ^1-forma anionica

EX ALANINA

VALORI PKa COOH = 2,36PKa NH₃⁺ = 9,87

PI = (2,36 + 9,87) / 2 = 6,11

2 amminoacidi - dipeptidi

tanti amminoacidi - polipeptidi

sLegame peptidico

Nterminale - Cterminale

ex

H₂N - C_H - C = O N - C_H2 - C = O R R

- H₂O

N - C_H - C = O NH - C_H - C = O

Ala - Val

H₂N - C_H - C = O NH - C_H - C = O CH₃ R

Non importa quanto siano lunghi avranno sempre un

• Nterminale
• Cterminale