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Appunti degli studenti per corsi ed esami del Prof. Helmer-Citterich Manuela

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Bioinformatica Premium

Esame Bioinformatica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Helmer-Citterich

Università Università degli Studi di Roma Tor Vergata

Appunti esame
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Banche Dati biologiche: uso e interrogazione di database pubblici per acidi nucleici e proteine (come GenBank o UniProt).Allineamento di Sequenze: Algoritmi di programmazione dinamica (allineamento globale e locale) e matrici di sostituzione per confrontare sequenze di DNA, RNA e proteine. Genomica e NGS (Next Generation Sequencing): analisi dei dati di sequenziamento ad alto rendimento, assemblaggio di genomi e identificazione di varianti genetiche. Biologia strutturale: modellazione molecolare, grafica 3D e previsione della struttura delle proteine. Programmazione e statistica: utilizzo di linguaggi di scripting come Python o R e ambienti operativi come Linux per la gestione di grandi moli di dati (big data biologici). Machine Learning: modelli di apprendimento automatico applicati alla predizione di funzioni geniche e classificazione di dati biomedici.
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Bioinformatica - Blast e Fasta, Esercitazioni di laboratorio Premium

Esame Bioinformatica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Helmer-Citterich

Università Università degli Studi di Roma Tor Vergata

Esercitazione
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Esercizi di Bionformatica della prof. Helmer Citterich su come effettuare una ricerca in Uniprot, interrogare il database attraverso l'algoritmo blast (Basic Local Alignment Search Tool), effettuare ricerche ed interrogazioni DB con il programma Fasta e la banca dati SwissProt.
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Bioinformatica - Ricerche bibliografiche, Esercitazioni di laboratorio Premium

Esame Bioinformatica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Helmer-Citterich

Università Università degli Studi di Roma Tor Vergata

Esercitazione
4,5 / 5
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Esercizi di Bionformatica della prof. Helmer Citterich su come effettuare una ricerca in PubMed, impostare filtri per la ricerca di materiale pubblicato su riviste scientifiche, come utilizzare la risorsa Google Scholar per effettuare ricerche scientifiche, consultazione e interrogazione del portale di ricerca di UniProt.
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Bioinformatica - Uniprot, Esercitazioni di laboratorio Premium

Esame Bioinformatica

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. M. Helmer-Citterich

Università Università degli Studi di Roma Tor Vergata

Esercitazione
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Esercizi di Bioinformatica della prof. Helmer Citterich riguardanti la ricerca di sequenze nucleotidiche all'NCBI, la ricerca di sequenze nucleotidiche all'EBI e la consultazione della banca dati EMBL, l'utilizzo della risorsa UniProt e la sua interrogazione.
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