Sistemi complessi per la biologia

Revisionato il 29/06/2026

di Chiara 1995

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Appunti sul corso sui sistemi complessi della biologia. Argomenti: sistemi dinamici nella biologia, reti di interazione tra geni, regolazione genica, piccolo mondo, punti di equilibrio stabili e …

Esame Sistemi complessi per la biologia

Facoltà Scienze matematiche fisiche e naturali

Dal corso del Prof. Caselle Michele

Università Università degli studi di Torino

A.A. 2018-2019

116 pagine

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SISTEMI COMPLESSI PER LA BIOLOGIA

Michele Caselle

Introduzione ai sistemi complessi
Metodi avanzati di inferenza

Posso portare un ARTICOLO DI RICERCA

1 domanda: Formula della Modulazione
2 domanda: Sull'evento (mett di Bayesiani)

Se non porta la ricerca ho uno domanda in più

Le dispense sono sulla pagina web del professore.

Neumann padre delle reti complesse. Un SISTEMA COMPLESSO è più della somma delle sue parti
ESEMPIO Vaci cellulare è più delle proteine che la compongono

Parliamo di DNA PROTEINE e GENI.

Alla base di tutti c'è il DNA. Il sequenza di DNA è quello che ci identifica.
Abbiamo 6 basi di membrana da cui ho la le le usa del DNA:

DNA sono 4: A G C T

Abbiamo 3 miliardi di basi che assommo questi
I paradetti barani e MA, ho le che
Ogni base è come memoria 1 bit
Due catene di DNA è molto facile da aprire perché come legami ad idrogeno

Le macchine molecolari che leggono le DNA
anno dal 5' al 3'.
Questa nomi, non rifernsomno all'atomo di carbonio che

SISTEMI COMPLESSI PER LA BIOLOGIA

Michele Casellecaselle@to.infm.it

Introduzione ai sistemi complessi
Metodi avanzati di inferenza (reti neuronali e metodo bayesano)

Posso portare un ARTICOLO DI RICERCA1 domanda: formal della Modulatione2 domanda: sul resto (reti, metodo bayesano)

Se non porta la ricerca => ho una domanda in più

Le dispense sono sulla pagina web del professore

Neurulami parte delle reti complesse. Un SISTEMA COMPLESSO è più della somma delle sue parti.ESEMPIO: la cellula è più delle proteine che la compongono

Parleremo di DNA PROTEINE e GENI.

Alla base di tutto c'è il DNA: la sequenza di DNA è quello che ci identifica.
Abbiamo 6 giga di memoria, da cui ho le lettere del DNA (sono 4
A G C T
Ademina, citosina, timina) =>abbiamo 3 miliardi di basi che occupano questo
A parallelo vale = dato cui ho che
Ogni base si somma memoria 1 bit
La catena di DNA è molto facile da aprire (perché come legami ad idrogeno)

Se macchine molecolari che leggono le DNA hanno dal 5' al 3'.Questu nomi si rifersiamo all'atomo di carbonio che

Quella che è dentro alla cellula si chiama CITOPLASMA.

Nelle cellule eucariote le sequenze sono immagazzinate nei cromosomi (nell’uomo abbiamo 24 cromosomi indipendenti e 2 sono le X e le Y che mi danno (il sesso)); nelle cellule procariote le DNA è racchiuso nella cellula.

Il cromosoma è sparso nel nucleo ed ho che diventa compatto nel momento della mitosi. Abbiamo le GENI nelle sequenze di DNA che possono essere più piccoli o formati da molte migliaia di basi. Le PROTEINE formate dai molti AMMINOACIDI e svolgono tutte le funzioni.

Con meno di 580.000 basi non sai sopravvivere è il più batterico (E. M. GENTALUM).

PROCARIOTI: sono batteri e non hanno nucleo; piccoli (~ cento volte più piccoli degli eucarioti), fermentano => metabolismo molto veloce ma poco efficiente.

Per caos due miliarai di anni fa => ci sono gli eucarioti (solo unicellulari).

EUCARIOTI: DNA nel nucleo → molto più complesso; metabolismo ossidato => metodo più efficiente di produrre energia ma più lento (30 volte più energia dalla stessa quantità di zucchero), respirano (usano ossigeno). Possono essere unicellulari o anche pluricellulari.

S. CERVISIAE → eucariote (e.g.) non unicellulare; completa; maschio/femmina.

C. ELEGANS: è un verme. Il suo fenotipo è completamente fissato dal suo genotipo.

Noi e il topo abbiamo estremamente simili.

Abbiamo lo stesso n° di geni e del C. ELEGANS ⇒ ad ogni gene corrisponde una proteina (meglio abbiamo poco cambiano le proteine delle strutture) ⇒ abbiamo enorme quantità di geni per la rottura n° di geni.

Il 90% dei genomi e non codifica.

La struttura dei geni è estremamente complessa.

I geni negli EUCARIOTI ci sono zone codificanti che si chiamano ESONI e zone non codificanti, INTRONI - Gli introni servono per dove le strutturazioni. I geni sono tali che possono codificare per un gran n° di proteine diverse.

Nel nefrone, ad esempio, ho un gene con 30 ESONI che possono essere tutti spostati che induce che mi dà 2° seguente diverso ed è tutto un processo stocastico

(parte accessori al gene precedente al gene)

Ci sono le aminoacidi che vanno a formare le proteine che sono divisi tra idrofobe idrofile.

E normalmente questo abbiamo una struttura tridimensionale stabile α-ELIX β-SHEET mo

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