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Anche per i virus il metodo diretto per eccellenza è la
microscopia, che permette l'identificazione dei virus già
isolati in colture cellulari, partendo dal materiale
patologico in esame. Altre tecniche identificative
importanti sono l'emoagglutinazione e 1'emoadsorbimento.
L'esame microscopico diretto, mediante microscopio ottico,
viene utilizzato per l'osservazione continua di colture
cellulari infettate allo scopo di mettere in evidenza
l'insorgenza di eventuali alterazioni cellulari
(determinate dai virus), che sono comunemente indicate come
effetto citopatico (CPE), oppure la presenza di inclusioni.
L'osservazione microscopica di preparati fissati e colorati di
colture cellulari, nelle diverse fasi di moltiplicazione
virale, evidenzia il progressivo deterioramento del tessuto
(lisi cellulari, masse sinciziali).