Classificazione molecolare di Woese

Classificazione molecolare di Woese

Con l’avvento delle tecniche molecolari (alla fine degli anni ‘80), i criteri tradizionali di classificazione fenotipica si sono rivelati superati. Con le nuove tecniche risultava infatti possibile confrontare il materiale genetico di un organismo vivente con quello degli organismi a lui superiori, con i quali risultava difficile poter trovare aspetti fenotipici comuni.

L’ipotesi di Woese e collaboratori era quella di stabilire una connessione evolutiva fra due specie utilizzando sequenze del DNA di geni comuni a tutti gli esseri viventi; i geni in questione erano quelli che codificavano per l’rRNA ribosomiale. Gli rRNA dei procarioti e degli eucarioti risultano diversi nelle due subunità (maggiore e minore) e tuttavia presentano elevate analogie in alcune regioni geniche.

Scelta dei geni per la classificazione

Woese ha perciò scelto per le determinazioni molecolari (sequenziamento delle basi) il gene codificante per l’rRNA di dimensioni intermedie: l’rRNA 16S per i procarioti e l’rRNA 18S per gli eucarioti. Dalla complessa analisi molecolare di moltissime specie sono emersi sorprendenti risultati: fra gli organismi eucariotici esistono minori differenze che quelle che si riscontrano fra gli organismi procariotici; fra gli organismi procariotici esistono marcate differenze fra i batteri classici (eubatteri) e i procarioti primitivi (archeobatteri), questi ultimi peraltro hanno maggiori somiglianze con gli eucarioti che con i batteri tradizionali.

Super-regni o Domini

Su queste basi sono stati raggruppati tutti gli organismi viventi in tre super-regni o Domini: Bacteria, Archaea e Eukarya. Di questi tre domini, due sono procariotici (Archaea e Bacteria) e uno è eucariotico (Eukarya).

Dettagli sui Domini

Nel dominio Bacteria sono inclusi i comuni batteri suddivisi in cinque regni:

• Proteobacteria
• Batteri Gram-positivi
• Cyanobacteria
• Spirochetales
• Chlamydia

Nel dominio Archaea sono compresi i procarioti primitivi ed estremofili suddivisi in due regni:

• Euryarchaeota
• Crenarchaeota

Nel dominio Eukarya troviamo tutti gli organismi eucariotici, suddivisi in quattro regni:

• Protista
• Plantae
• Fungi
• Animalia

Nei protisti rientrano le forme microbiche eucariotiche: protozoi e alghe.