Riassunto esame Biochimica, prof. Palestini

BIOCHIMICA Sono trasformazioni di materia in cui sono presenti sostanze che si disfano (reagenti) e sostanze che si formano (prodotti). A B reazione chimica in cui A rappresenta i reagenti, B i prodotti Keq 1) dipende dalla temperatura e dalla pressione a cui si svolge la reazione 2) indica i rapporti fra concentrazioni dei prodotti e concentrazioni dei reagenti all equilibrio Keq DG indica quanto una reazione sia lontana dalla posizione di equilibrio DG Tipo di reazione Modalita di reazione >1 =1 Negativo 0 ESOERGONICA (La reazione libera energia) Equilibrio <1 Positivo ENDOERGONICA (la reazione ha bisogno di energia) Avviene spontaneamente Avviene solo quando le concentrazioni dei reagenti e dei prodotti sono uguali Non avvengono Una reazione chimica puo essere velocizzata: 1) aumentando la temperatura 2) utilizzando i catalizzatori - Sono catalizzatori biologici in grado di aumentare la velocita di una reazione senza alterarne l equilibrio e consentono ai prodotti di raggiungere uno stadio attivato che da soli non raggiungerebbero. Sono PROTEINE Sono sensibili al pH: gli enzimi funzionano bene solo a un pH fisiologico Sono sensibili alla temperatura: gli enzimi funzionano bene solo a una temperatura di 38deg Per rendere possibile la reazione, gli enzimi abbassano l energia di attivazione che si oppone alla trasformazione dei reagenti nei prodotti Sono caratterizzate da un sito di substrato e da un sito catalitico (o sito attivo). Sito di substrato: conferisce la specificita di un enzima per i suoi substrati (i reagenti) - Sito catalitico: 1) puo coincidere con il sito di substrato o essere in prossimita di esso 2) grazie alla presenza di alcuni gruppi funzionali presenti nelle catene di amminoacidi che lo costituiscono, e responsabile della specificita della reazione catalizzata 3)l interazione del substrato con il sito catalitico determina la formazione del prodotto , rilasciato successivamente dall enzima 4) contiene piu di un gruppo funzionale, importanti per la catalisi, che consentono a piu reazione di avvenire contemporaneamente Esistono due diversi modelli di legame enzima-substrato: 1) modello chiave-serratura (modello superato): l'enzima ed il substrato possiedono una forma esattamente complementare che ne permette un incastro perfetto, ma non ne spiega la catalisi 2) modello dell adattamento indotto (modello attualmente vigente): il sito catalitico e speculare non al substrato, ma allo stato di transizione del substrato, quindi rompe i legami, favorendo la rottura CINETICA ENZIMATICA Andamento della velocita di una reazione catalizzata da un enzima. Km: costante di Michaelis (concentrazione di substrato alla quale la reazione va meta della velocita massima) [S]: concentrazione di substrato Vmax: velocita massima della reazione che corrisponde a una concentrazione di substrato tale da saturare tutti i siti di legame dell en