Biochimica 1/7

AMMINOACIDI, PEPTIDI E PROTEINE

PROTEINE

Macromolecole più abbondanti nelle cellule

Svolgono grande varietà di funzioni biologiche

Principali nutrienti per tutti gli esseri viventi

AMMINOACIDI

 Molecola che contiene un gruppo amminico identificato da NH con una

o 3

carica positiva

Sono polimeri di α-aminoacidi (unità base)

o Per portarli formare i due gruppi funzionali devono essere legati in un

o certo modo:

Devono essere legati a un C identificato come C – α

 3

Il C, in questo caso, fa 4 legami semplici (sp )

 

Legami impegnati in modo fisso in tutti gli amminoacidi

 

Cisteina ha una particolarità insolita presenta il gruppo SH



o caratterizzato dall’essere implicato nelle ossidoriduzioni. Essi possono

subire un processo di ossidoriduzione nel quale si possono legare e se si

legano formano il ponte disolfuro diventando fissa (reversibile) 

importante nelle funzioni e nel ripiegamento delle proteine

Nel nostro corpo esistono degli amminoacidi che hanno le stesse

o caratteristiche ma non partecipano alla struttura della proteina

20 totali

o 19 hanno la stessa struttura generale:

o Carbonio – α

 Gruppo aminico primario (NH )

 3

Gruppo carbossilico (COOH)

 Gruppo R o catena laterale

 Atomo di H



STEREOISOMERIA:

o Carbonio – α è chirale (tranne nella glicina)

 2 forme isometriche speculari (detta nomenclatura di Fischer):

 L levogiro (tutti gli aminoacidi nel nostro corpo)

 

D destrogiro

 

Affinché tutto possa funzionare nel nostro organismo è necessario

 che tutti gli amminoacidi abbiano la stessa configurazione (non

potrebbero formare le strutture complesse proteine)

L’organismo è settato in modo tale da usare gli amminoacidi che

 vengono dalla dieta o che riesce a sintetizzare nella configurazione

L seguendo delle regole (gruppo amminico a sinistra)

Dove possono provenire:

 Dieta essenziali (noi non li produciamo)

 amminoacidi

alimenti ad alto valore biologico (carne, uova, pesce)

Sintetizzati da noi



CLASSI:

o Ciò che differenzia i vari aminoacidi è la natura del gruppo R

 Ne definisce le proprietà

 Si dividono in:

 Molecole alifatiche molecole che non piace l’ambiente

 

polare

Molecole polari stanno bene in ambiente acquoso

 

(possono essere cariche e non cariche )

Si raggruppano in base alla polarità di R

 Ce ne sono 5:

 Gruppi alifatici, non polari (aminoacidi idrofobi) si trovano

 nella parte interna della struttura tridimensionale

Gruppi aromatici

 Gruppi R polari, non carichi

 Gruppi R carichi positivamente

 Gruppi R carichi negativamente



LEGAME PEPTIDICO

o Legame C-N

 È una condensazione o una disidratazione (libera una molecola di

 H O)

2 - 3+

Avviene tra COO (legato al C -α) che si lega all’ NH

 Sono planari e rigidi, inoltre i legami C-N sono più corti del previsto

 N e O hanno entrambi elettronegatività alta (N>O)

 possibilità di risonanza

 doppio legame C=O può oscillare tra C-O e C-N. questa



situaz