Concetti Chiave
- Le sequenze intensificatrici sono elementi che legano proteine per avvicinare gli attivatori al promotore, facilitando l'inizio della trascrizione.
- La TATA-box è un promotore chiave che segnala l'inizio della trascrizione quando riconosciuta dalla TBP, che provoca il ripiegamento del DNA.
- Il legame della TBP alla TATA-box richiama altri fattori come TF2B, preparando il terreno per il posizionamento della RNA polimerasi.
- La RNA polimerasi richiede la fosforilazione del suo dominio C-terminus per avviare la trascrizione e disassemblare i fattori di trascrizione.
- Il complesso di inizio della trascrizione si forma grazie all'interazione tra attivatori, proteine mediatrici e fattori di trascrizione generali.
Intensificatori e attivatori
Ancora a monte dei promotori, troviamo delle sequenze intensificatrici: le proteine si legano agli elementi di controllo distali che, nel loro insieme, costituiscono un intensificatore. Una proteine che causa il ripiegamento del DNA avvicina al promotore gli attivatori legati all’intensificatore: in tal modo i fattori di trascrizione generali, proteine mediatrici ed RNA polimerasi si trovano vicini fra loro.
Gli attivatori si legano ad alcune proteine mediatrici e a fattori di trascrizione generali, favorendo la formazione di un complesso di inizio della trascrizione attivo sul promotore.
Il ruolo della TATA-box
Locata -30 dal sito di inizio, TATA-box è il promotore che da il segnale di inizio quando il primo scassinatore la rileva; questo scassinatore non è RNA polimerasi, ma TBP (TATA-box binding protein), subunità di TF2D che si lega a TATA box senza bisogno che il DNA sia denaturato, riconosce la sequenza causando un ripiegamento del DNA; Questo legame richiama un altro fattore, TF2B, e poi arriva la RNA polimerasi che si posiziona a +1.
RNA polimerasi e fosforilazione
Associata a RNA polimerasi c'è DNA ligasi e una chinasi che lavora per fosforilare il dominio carbossiterminale (C-terminus) di RNA polimerasi (perchè questa parta questo dominio deve essere fosforilato). Nel momento in cui RNA polimerasi inizia a trascrivere abbiamo il disassemblamento della maggior parte dei fattori di trascrizione.
Domande da interrogazione
- Qual è il ruolo degli intensificatori nella trascrizione genica?
- Che funzione ha la TATA-box nel processo di trascrizione?
- Perché è importante la fosforilazione del dominio C-terminus di RNA polimerasi?
Gli intensificatori sono sequenze che, legandosi a proteine, favoriscono il ripiegamento del DNA e avvicinano gli attivatori al promotore, facilitando l'assemblaggio dei fattori di trascrizione e dell'RNA polimerasi (come descritto nel testo).
La TATA-box, situata a -30 dal sito di inizio, segnala l'inizio della trascrizione quando viene riconosciuta dalla TBP, che provoca un ripiegamento del DNA e richiama altri fattori come TF2B e RNA polimerasi (secondo quanto riportato nel testo).
La fosforilazione del dominio C-terminus di RNA polimerasi è necessaria affinché questa inizi la trascrizione; durante questo processo, la maggior parte dei fattori di trascrizione si disassemble, come indicato nel testo.
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