Concetti Chiave
- L'RNA polimerasi si lega al promotore per determinare il filamento da trascrivere, con il sito di inizio situato all'estremità 3'.
- Il filamento complementare, detto senso, ha una sequenza e direzione identiche all'mRNA, con uracili sostituiti da timine nel DNA.
- Nel promotore, la sequenza TATA box si trova in posizione -10, mentre un'altra sequenza tipica è localizzata in -35.
- I fattori di trascrizione riconoscono le sequenze promotorie e facilitano il legame dell'RNA polimerasi, garantendo un’efficace trascrizione.
- Il TFIIB, un fattore di trascrizione, si colloca vicino al TATA box per ottimizzare l'interazione con l'RNA polimerasi.
Il ruolo del promotore
L’RNA polimerasi deve legarsi al promotore che permette di comprendere il filamento che deve essere trascritto: rispetto al promotore il sito di inizio si trova sempre all’estremità 3’ di modo che l’RNA polimerasi possa sintetizzare in direzione 5’ 3’. Quindi, il filamento 3’ 5’ è il filamento stampo, l’altro è detto senso o complementare.
Il filamento complementare allo stampo viene definito complementare o senso perché la sua sequenza e la sua direzione sono uguali a quelle dell’mRNA sintetizzato, con l’unica differenza che nel DNA le uracili sono sostituite dalle timine. Gli mRNA sono perciò complementari al filamento stampo e sono uguali sia come direzione, sia come sequenza al filamento senso.
Sequenze e fattori di trascrizione
Nel promotore vi è un sito di inizio, collocato in posizione +1; in posizione -10 vi è invece una sequenza tipica dei promotori il TATA box, costituito da adenine e timine. Interessante è anche la sequenza tipica dei promotori posta in -35. La sequenza di inizio (inr) è riconosciuta da dei fattori della trascrizione (TF), delle proteine, i cui nomi sono seguiti da I, II o III in relazione all’RNA polimerasi al quale è consentito l’accoppiamento con il promotore. Esistono altri fattori della trascrizione fondamentali nella trascrizione come il TFIIB che si colloca in prossimità del TATA box, così da rendere più sicuro l’operato dell’RNA polimerasi.
Domande da interrogazione
- Qual è la funzione del promotore nell'inizio della trascrizione?
- Cosa caratterizza il filamento complementare rispetto al filamento stampo?
- Quali sequenze e fattori di trascrizione sono coinvolti nel promotore?
Il promotore è fondamentale poiché consente all'RNA polimerasi di legarsi e identificare il filamento da trascrivere, con il sito di inizio situato all'estremità 3' per permettere la sintesi in direzione 5' 3' (testo).
Il filamento complementare, o senso, ha una sequenza e una direzione identiche a quelle dell'mRNA sintetizzato, con l'unica differenza che le uracili nel DNA sono sostituite dalle timine (testo).
Nel promotore si trovano il sito di inizio in posizione +1, il TATA box in posizione -10 e una sequenza tipica in -35. I fattori di trascrizione, come il TFIIB, sono essenziali per facilitare l'accoppiamento dell'RNA polimerasi con il promotore (testo).
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