Concetti Chiave
- Il TATA-box, presente nella maggior parte dei promotori, è importante per la trascrizione ma non indispensabile, poiché la sua inattivazione riduce l'efficienza al 38%.
- La CG-box, situata a -100, è cruciale per l'efficienza della trascrizione; la sua rimozione provoca un calo drammatico al 14%.
- La CAAT-box, localizzata a -110, influisce significativamente sull'efficienza della trascrizione, riducendola al 50% se rimossa.
- Le modifiche post-trascrizionali dell'mRNA includono l'aggiunta di un cap all'estremità 5' e di una coda di poli A all'estremità 3', essenziali per la stabilizzazione della molecola.
- Le sequenze CG-box e CAAT-box non interagiscono direttamente con l'RNA polimerasi, ma sono fondamentali per le interazioni con le proteine che regolano l'efficienza della trascrizione.
• il più vicino al punto di inizio effettivo di trascrizione (-30bp) è il TATA-box (l'assoluta maggioranza di geni la possiede nel suo promotore): se lo inattivo però l'efficienza della trascrizione non crolla a 0, ma rimane al 38%, TATA box è quindi importante ma non indispensabile. Se si toglie la sequenza che precede TATA box l'effetto è quasi nullo, il rendimento è pari al 95%: essa non è quindi un promotore.
• ancora a monte la CG-box, a -100, che se rimossa causa un drammatico calo dell'efficienza, che crolla al 14%.
• c'è poi la CAAT-box a -110, che se rimossa fa calare l’efficienza al 50%.
Modifiche post-trascrizionali dell'mRNA
Queste ultime due sequenze non interagiscono con RNA polimerasi, che interagisce solo con TATA -box, ma sono molto importanti per le interazioni con proteine che regolano l'efficienza della RNA polimerasi, inoltre un mRNA eucariote appena trascritto viene modificato alle estremità per stabilizzare la molecola, che deve comunque ancora andare incontro al processo di maturazione; quelle di mRNA appena sintetizzate sono infatti molecole deboli e poco stabili che possono essere attaccate da RNasi. All’estremità 5' viene agguanto un cap, un ribonucleoside, 7metilguanosina, guanosina con legato al N in posizione 7 un gruppo metile. Alla estremità 3'-OH vengono aggiunte invece delle code di poli A, tante adenosine. La coda di poli A viene aggiunta in seguito alla rimozione di una sequenza finale in seguito al riconoscimento di sequenze specifiche.
Domande da interrogazione
- Qual è l'importanza del TATA-box nella trascrizione genica?
- Qual è l'effetto della rimozione della CG-box e della CAAT-box sull'efficienza della trascrizione?
- Quali modifiche subisce l'mRNA eucariote dopo la trascrizione?
Il TATA-box è importante per l'inizio della trascrizione, ma non è indispensabile; la sua inattivazione riduce l'efficienza della trascrizione al 38%, mentre la rimozione della sequenza che lo precede ha un effetto quasi nullo, mantenendo l'efficienza al 95%.
La rimozione della CG-box, situata a -100, causa un drammatico calo dell'efficienza al 14%, mentre la rimozione della CAAT-box a -110 riduce l'efficienza al 50%.
L'mRNA eucariote appena trascritto subisce modifiche alle estremità per stabilizzarsi, con l'aggiunta di un cap di 7-metilguanosina all'estremità 5' e di una coda di poli A all'estremità 3'-OH, dopo la rimozione di sequenze specifiche.
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