Virologia

Virologia

Virus: agente patogeno diffuso -> grande quantità, ma tutti uguali e patogeni; genoma virale fa parte del nostro materiale genetico.

Non è una cellula vivente: aggregato di elementi, si replica se c'è una cellula ospite.

Genoma virale: patrimonio genetico presente nel virione; si può chiamare anche:

• Microbioma: solo patrimonio genetico
• Microbiota: tutta la cellula microbica

Cosa sono i virus?

Parassiti endocellulari obbligati -> per vivere hanno bisogno di una cellula ospite.

Dimensioni: 20 nm < virus < 400 nm

Materiale genetico: o solo DNA o solo RNA -> non come i batteri che possono avere entrambi

Struttura: capside proteico -> avvolge il materiale genetico (guscio), protegge e dà una morfologia (piramide/poliedrale/...) ; formato da capsomeri + anticapsidi (se virus nudo, altrimenti sul pericapside)

Non ci sono nucleo o organuli

Envelope/pericapside lipidico -> fa parte della membrana cellulare dell'ospite da cui il virus è uscito; non c'è sempre: virus nudi o rivestiti

Replicazione: è necessario un circuito cellulare -> stato di de? il virus non è morto, ma inerte (e non può replicare)

Sistema: autoassemblaggio

• Virus entra
• Disgrega e libera geni
• Info genetica letta e copiata, a volte -> amplificazione! non c'è crescita per divisione
• Trascrizione per proteine e strutture
• Assemblaggio
• Uscita e lisi cellula ospite

Fasi iniziali del virus

Fasi iniziali del virus: barriera dopo riconoscere un recettore specifico per replicare

Due fasi:

• Inerte: non si replica
• Intracellulare: replica le componenti

Curva di crescita

Batteri -> esponenziale

Latenza > esplosione > stazionaria > morte

Virus: diverse fasi, cambiamenti più repentini

Inizio: latenza > assemblaggio ed esplosione > uscita e lisi

Classificazione dei virus

Classificazione dei virus in base a:

Pericapside (nudi o rivestiti) -> pericapside: guscio lipidico della membrana dell'ex cellula ospite

Virus rivestiti sono meno resistenti: struttura lipidica è più confortevole e si interrompe facilmente

Contiene glicoproteine virali che mediano l'entrata e l'uscita del virus

Morfologia capside: simmetrie diverse

• Icosaedrica/sferica (adenovirus)
• Elicoidale (virus del tabacco)
• A parentesi (poxvirus)
• Simmetria complessa (batteriofagi) -> iniettano il DNA nella cellula

Cellule bersaglio -> es. cellule epatiche / sistema immunitario

Forma del genoma (circolare/lineare) -> genoma composto da proteine, basi e solo minore

Acido nucleico, quantità e polarità (DNA/RNA singolo/doppio/+/-)

Dimensioni del genoma non sono correlate alle dimensioni; alcuni virus piccoli hanno genomi sorprendentemente grandi.

Classificazione secondo Baltimore

Classificazione secondo Baltimore

In base alla natura del patrimonio genetico:

• Classe I -> DNA doppia elica
• Classe II -> DNA singola elica
• Classe III -> RNA doppia elica
• Classe IV -> RNA singola +
• Classe V -> RNA singola -
• Classe VI -> RNA singola con trascrittasi inversa
• Classe VII -> DNA doppia con trascrittasi inversa

Replicazione virale

Suscettibilità: capacità della cellula di essere attaccata --- solo da specifici i virus specie. È la presenza della specifica cellula ospitante! Se la cellula è permissiva non finisce qui, bisogna trovare il sistema di superare le limitazioni virali.

Permissività: capacità della cellula di supportare il ciclo vitale del virus, fino alla formazione di nuovi virioni da rilasciare.

In natura una cellula deve essere contemporaneamente suscettibile e permissiva affinché il ciclo replicativo venga completato.

Strategie di sopravvivenza del virus

Strategie di sopravvivenza del virus (ciclo replicativo)

• Entrare ed entrare nella cellula ospite (suscettibile e permissiva) --- meccanismi in base al genoma, alcuni solo nel citoplasma, altri nel nucleo
• Sintetizzare le proteine virali: genoma --- mRNA uguale a quello cellulare --- sfrutta i ribosomi del sistema cellulare
• Sintetizzare nuovi genomi virali: la copia da usare e i nuovi virioni --- sfrutta il meccanismo cellulare e qualche enzima virale
• Produrre proteine virali: proteine capside/envelope + info sul DNA e quando + modifiche
• Differire dall'interno e da una cellula all'altra: diffonde e replica nelle cellule limitate

Per farlo deve superare le difese dell'ospite: induce patologia autoimmune; produce strutture simili all'ospite.

Ciclo replicativo

Successione di fasi sempre uguali, con variazioni nel sito di replicazione e nel tempo impiegato

• Fase di attacco o adsorbimento: legame recettore cellulare riconosciuto dall'antirecettore virale (a volte co-recettore)
• Non richiede tanta energia --- basato su interazioni elettrostatiche
• Comporta cambi conformazionali e tagli proteolitici
• Porta all'entrata; il virus penetra (si sposta anche dall'endocitosi)
• Una volta entrato,