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Peptidi e legame peptidico

Materiale didattico per il corso di Biochimica tenuto dal prof. Paolo Ascenzi, all'interno del quale sono affrontati i seguenti argomenti: studio dei peptidi e delle proteine; il legame peptidico e le sue proprietà; il grafico di Ramachandran; la str

... Espandi »uttura tridimensionale delle proteine. « Comprimi
  • Per l'esame di BIOCHIMICA del Prof. P. Ascenzi
  • Università: Roma Tre - Uniroma3
  • CdL: Corso di laurea in scienze biologiche
  • SSD:
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Voto: 5 verificato da Skuola.net

  • 6
  • 12-08-2011
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Peptidi e legame peptidico
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Anteprima Testo:
PEPTIDI E PROTEINE I peptidi sono catene di amminoacidi Due molecole di amminoacidi possono unirsi covalentemente mediante un legame ammidico, chiamato  LEGAME PEPTIDICO. Il legame peptidico è una reazione di condensazione. OLIGOPEPTIDE: piccolo numero di amminoacidi. POLIPEPTIDE: elevato numero di amminoacidi. Massa inferiore a 10.000. Il legame peptidico è rigido e planare Gli  atomi  di  Cα  di  amminoacidi  adiacenti  sono  separati  da  tre  legami  covalenti: Cα – C – N – Cα PROPRIETA’ DEL LEGAME PEPTIDICO   I 6 atomi del gruppo peptidico giacciono sullo stesso piano → l’ossigeno legato al carbonio  del gruppo carbonilico e l’atomo di idrogeno legato all’azoto amminico, si trovano in trans.   L’ossigeno  carbonilico  ha  una  parziale  carica  negativa  e  l’azoto  amminico  ha  una  parziale  carica positiva → ciò genera un parziale dipolo elettrico.   I  legami  ammidici  C­N  hanno  un  parziale  carattere  di  doppio  legame  per  effetto  della  risonanza→ non posson... Espandi »o ruotare liberamente.  La rotazione è permessa solo attorno ai legami N­Cα e Cα­C. Il legame peptidico è rigido e planare φ e ψ sono di 180° quando il polipeptide è nella conformazione complanare estesa e tutti i gruppi peptidici sono sullo  stesso piano. φ  e  ψ possono  assumere  tutti  i  valori  compresi  tra  ­180°  e  +180°,  ma  molti  valori  risultano  proibiti  per  interferenze  steriche tra gli atomi dello scheletro del polipeptide e quelli delle catene laterali. Il legame peptidico è rigido e planare φ e ψ sono  pari  a  0  quando  i  due  legami  peptidici  che fiancheggiano il Cα sono sullo stesso piano CONFORMAZIONE PROIBITA I legami peptidici rigidi limitano il numero di conformazioni che una catena  polipeptidica può assumere Il grafico di Ramachandran BLU: conformazioni in cui non si hanno sovrapposizioni  steriche → CONFORMAZIONI CONSENTITE. TURCHESI:  conformazioni  che  si  trovano  al  limite  della  stabilità  a  causa  di  contatti  non  favorevoli  tra  atomi → CONFORMAZIONI CONSENTITE. CELESTI:  conformazioni  che  sono  consentite  solo  se  è  permessa  una  certa  flessibilità  degli  angoli  di  legame → CONFORMAZIONI CONSENTITE. L­alanina I peptidi sono catene di amminoacidi Le  unità  amminoacidiche  sono  definite  RESIDUI  →  ogni  residuo  è  un  amminoacido  che  ha  perso  un  protone dal suo gruppo amminico e un ossidrile dal suo gruppo carbossilico. Estremità  ammino­terminale Estremità  carbossi­terminale L’idro « Comprimi
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