Le malattie del sistema immunitario sono:
-la miastenia grave, il lupus erimatoso, l'anemia, il diabete giovanile, l'artrite reumatoide: malattie autoimmuni e l'individuo produce anticorpi contro le proprie cellule;
-sclerosi multipla: il sistema immunitario non trasmette gli impulsi nervosi e attacca la mielina (sostanza che ricopre i nervi) causando il deterioramento delle fibre nervose. In base all'area colpita, sono compromessi le funzioni di movimento e di equilibrio; questa malattia può essere curata con l'interferone (insieme di proteine che agiscono contro i virus);
-il cancro: può essere di origine genetico (i geni oncosoppressori arrestano il ciclo cellulare permettendo la diffusione di cellule cancerose) o ambientale. Per combattere il cancro si ricorre all'intervento chirurgico (asportando la massa tumorale) e a due terapie: la chemioterapia e la radioterapia;
-le SCID (dall'inglese Severe Combined Immune Deficiencies): sono malattie ereditarie autoimmuni combinate che derivano dal blocco delli sviluppo delle cellule staminali. Per curarle bisogna fare il trapianto del midollo osseo;

-l'AIDS: malattia da immunodeficienza acquisita diagnosticata nel 1982 che comporta la presenza del sarcoma di Kaposi, delle polmoniti e delle infezioni causate da protisti. Questo virus comporta
il blocco del sistema immunitario contro il virus e si trasmette attraverso il sangue o attraverso il liquido seminale.

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